MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 2676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	CACCG	2	10	162	171	20 %	0 %	20 %	60 %	340792957
2	NC_015859	ACCAC	2	10	1574	1583	40 %	0 %	0 %	60 %	340792957
3	NC_015859	CGCTG	2	10	6487	6496	0 %	20 %	40 %	40 %	340792961
4	NC_015859	GGGGA	2	10	10820	10829	20 %	0 %	80 %	0 %	340792964
5	NC_015859	GTGGG	2	10	10990	10999	0 %	20 %	80 %	0 %	340792965
6	NC_015859	TGTGG	2	10	15022	15031	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015859	GAGAG	2	10	15109	15118	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015859	CTCCG	2	10	15444	15453	0 %	20 %	20 %	60 %	340792969
9	NC_015859	CCGTG	2	10	15973	15982	0 %	20 %	40 %	40 %	340792970
10	NC_015859	CCGGT	2	10	18653	18662	0 %	20 %	40 %	40 %	340792971
11	NC_015859	AGGCG	2	10	19670	19679	20 %	0 %	60 %	20 %	340792972
12	NC_015859	TGCCG	2	10	20159	20168	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015859	CCTCG	2	10	21784	21793	0 %	20 %	20 %	60 %	340792974
14	NC_015859	CTGGG	2	10	22454	22463	0 %	20 %	60 %	20 %	340792974
15	NC_015859	GGGGA	2	10	23501	23510	20 %	0 %	80 %	0 %	340792975
16	NC_015859	GAACG	2	10	25060	25069	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015859	GGGGC	2	10	25785	25794	0 %	0 %	80 %	20 %	340792977
18	NC_015859	GCTCC	2	10	25855	25864	0 %	20 %	20 %	60 %	340792977
19	NC_015859	GACCG	2	10	25943	25952	20 %	0 %	40 %	40 %	340792977
20	NC_015859	CCCTG	2	10	26094	26103	0 %	20 %	20 %	60 %	340792977
21	NC_015859	ACGCC	2	10	27532	27541	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015859	CCCGC	2	10	29228	29237	0 %	0 %	20 %	80 %	340792978
23	NC_015859	GACCG	2	10	29684	29693	20 %	0 %	40 %	40 %	340792978
24	NC_015859	TCCAC	2	10	30626	30635	20 %	20 %	0 %	60 %	340792979
25	NC_015859	GCGTT	2	10	31422	31431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015859	TAGGG	2	10	31779	31788	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015859	CACCG	2	10	33786	33795	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015859	GGAAG	2	10	34273	34282	40 %	0 %	60 %	0 %	340792982
29	NC_015859	CACCG	2	10	35496	35505	20 %	0 %	20 %	60 %	340792984
30	NC_015859	CCACC	2	10	36732	36741	20 %	0 %	0 %	80 %	340792984
31	NC_015859	GGTCT	2	10	37272	37281	0 %	40 %	40 %	20 %	340792985
32	NC_015859	GCCGG	2	10	37661	37670	0 %	0 %	60 %	40 %	340792985
33	NC_015859	GACCT	2	10	40130	40139	20 %	20 %	20 %	40 %	340792987
34	NC_015859	AGGGG	2	10	41285	41294	20 %	0 %	80 %	0 %	340792988
35	NC_015859	GGCGG	2	10	41462	41471	0 %	0 %	80 %	20 %	340792988
36	NC_015859	ACGAC	2	10	41706	41715	40 %	0 %	20 %	40 %	340792988
37	NC_015859	CATGA	2	10	41813	41822	40 %	20 %	20 %	20 %	340792988
38	NC_015859	TGCCT	2	10	41922	41931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015859	CTGAC	2	10	41989	41998	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015859	GAACG	2	10	44397	44406	40 %	0 %	40 %	20 %	340792991
41	NC_015859	TTCTC	2	10	45959	45968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015859	CGTCC	2	10	46401	46410	0 %	20 %	20 %	60 %	340792992
43	NC_015859	GCGCG	2	10	49427	49436	0 %	0 %	60 %	40 %	340792995
44	NC_015859	GACCG	2	10	50360	50369	20 %	0 %	40 %	40 %	340792996
45	NC_015859	AGACC	2	10	50728	50737	40 %	0 %	20 %	40 %	340792996
46	NC_015859	CGGTG	2	10	52122	52131	0 %	20 %	60 %	20 %	340792997
47	NC_015859	CCCCA	2	10	52197	52206	20 %	0 %	0 %	80 %	340792997
48	NC_015859	GCCGG	2	10	52895	52904	0 %	0 %	60 %	40 %	340792997
49	NC_015859	GGGGT	2	10	53390	53399	0 %	20 %	80 %	0 %	340792998
50	NC_015859	GGCGC	2	10	54029	54038	0 %	0 %	60 %	40 %	340792998
51	NC_015859	ACCGG	2	10	57183	57192	20 %	0 %	40 %	40 %	340793001
52	NC_015859	GTCCG	2	10	58875	58884	0 %	20 %	40 %	40 %	340793005
53	NC_015859	CCGGT	2	10	58977	58986	0 %	20 %	40 %	40 %	340793005
54	NC_015859	CTGTG	2	10	62411	62420	0 %	40 %	40 %	20 %	340793010
55	NC_015859	CCGTC	2	10	63890	63899	0 %	20 %	20 %	60 %	340793011
56	NC_015859	CAGGG	2	10	64678	64687	20 %	0 %	60 %	20 %	340793011
57	NC_015859	AAAAG	2	10	64927	64936	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015859	CGGGG	2	10	65322	65331	0 %	0 %	80 %	20 %	340793012
59	NC_015859	GGTGA	2	10	66833	66842	20 %	20 %	60 %	0 %	340793013
60	NC_015859	TGGCC	2	10	67524	67533	0 %	20 %	40 %	40 %	340793014
61	NC_015859	CGCTC	2	10	68109	68118	0 %	20 %	20 %	60 %	340793016
62	NC_015859	TCGTG	2	10	70650	70659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015859	CTTGT	2	10	70694	70703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015859	CGTCA	2	10	70986	70995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015859	CGTTG	2	10	71258	71267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015859	GGGAG	2	10	72056	72065	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015859	TGGTG	2	10	72121	72130	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015859	GTTCG	2	10	73778	73787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015859	CCCGG	2	10	75522	75531	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_015859	CACCG	2	10	75561	75570	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_015859	GACCG	2	10	76659	76668	20 %	0 %	40 %	40 %	340793018
72	NC_015859	CGCGG	2	10	76675	76684	0 %	0 %	60 %	40 %	340793018
73	NC_015859	CACCG	2	10	77280	77289	20 %	0 %	20 %	60 %	340793018
74	NC_015859	CCTCT	2	10	77743	77752	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015859	ACGGC	2	10	79490	79499	20 %	0 %	40 %	40 %	340793020
76	NC_015859	CCGTG	2	10	80037	80046	0 %	20 %	40 %	40 %	340793020
77	NC_015859	CGCGC	2	10	80515	80524	0 %	0 %	40 %	60 %	340793020
78	NC_015859	CAGGT	2	10	80837	80846	20 %	20 %	40 %	20 %	340793020
79	NC_015859	CGGGG	2	10	83199	83208	0 %	0 %	80 %	20 %	340793022
80	NC_015859	GAGCA	2	10	83450	83459	40 %	0 %	40 %	20 %	340793022
81	NC_015859	GAGAT	2	10	85538	85547	40 %	20 %	40 %	0 %	340793024
82	NC_015859	GGACG	2	10	86275	86284	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015859	CACTG	2	10	88587	88596	20 %	20 %	20 %	40 %	340793026
84	NC_015859	GCCGG	2	10	91059	91068	0 %	0 %	60 %	40 %	340793030
85	NC_015859	ATCTC	2	10	91752	91761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015859	GTGCT	2	10	94953	94962	0 %	40 %	40 %	20 %	340793033
87	NC_015859	GGGTG	2	10	98217	98226	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015859	GCTGC	2	10	99297	99306	0 %	20 %	40 %	40 %	340793037
89	NC_015859	CGGTC	2	10	100124	100133	0 %	20 %	40 %	40 %	340793038
90	NC_015859	CCCAC	2	10	100679	100688	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_015859	CAGAT	2	10	100696	100705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015859	GTGAT	2	10	100977	100986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015859	TGCGC	2	10	103754	103763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015859	TGCAC	2	10	104366	104375	20 %	20 %	20 %	40 %	340793042
95	NC_015859	GCTGA	2	10	104946	104955	20 %	20 %	40 %	20 %	340793042
96	NC_015859	CGGGC	2	10	109575	109584	0 %	0 %	60 %	40 %	340793047
97	NC_015859	ACCGG	2	10	110566	110575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015859	ACGGC	2	10	111287	111296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015859	ACCGG	2	10	112721	112730	20 %	0 %	40 %	40 %	340793051
100	NC_015859	CGCGT	2	10	112910	112919	0 %	20 %	40 %	40 %	340793051
101	NC_015859	CGGCT	2	10	113966	113975	0 %	20 %	40 %	40 %	340793052
102	NC_015859	CCGCC	2	10	114121	114130	0 %	0 %	20 %	80 %	340793052
103	NC_015859	TCCCG	2	10	114182	114191	0 %	20 %	20 %	60 %	340793052
104	NC_015859	CTCGA	2	10	114224	114233	20 %	20 %	20 %	40 %	340793052
105	NC_015859	CCCGG	2	10	115608	115617	0 %	0 %	40 %	60 %	340793053
106	NC_015859	CGGTG	2	10	116862	116871	0 %	20 %	60 %	20 %	340793053
107	NC_015859	CTGGG	2	10	116896	116905	0 %	20 %	60 %	20 %	340793053
108	NC_015859	CGGTG	2	10	120382	120391	0 %	20 %	60 %	20 %	340793055
109	NC_015859	GCCCG	2	10	120780	120789	0 %	0 %	40 %	60 %	340793056
110	NC_015859	GGCGT	2	10	120885	120894	0 %	20 %	60 %	20 %	340793056
111	NC_015859	TCCGG	2	10	122248	122257	0 %	20 %	40 %	40 %	340793058
112	NC_015859	CGAGC	2	10	123062	123071	20 %	0 %	40 %	40 %	340793058
113	NC_015859	CGAGG	2	10	123293	123302	20 %	0 %	60 %	20 %	340793058
114	NC_015859	TCCTG	2	10	123989	123998	0 %	40 %	20 %	40 %	340793058
115	NC_015859	CGTCC	2	10	125010	125019	0 %	20 %	20 %	60 %	340793059
116	NC_015859	CGGGC	2	10	126341	126350	0 %	0 %	60 %	40 %	340793060
117	NC_015859	CGGTG	2	10	127814	127823	0 %	20 %	60 %	20 %	340793061
118	NC_015859	TGGTG	2	10	127901	127910	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015859	GGTCG	2	10	128858	128867	0 %	20 %	60 %	20 %	340793062
120	NC_015859	GCCGG	2	10	130918	130927	0 %	0 %	60 %	40 %	340793063
121	NC_015859	CGGAC	2	10	131487	131496	20 %	0 %	40 %	40 %	340793063
122	NC_015859	CTGCG	2	10	132136	132145	0 %	20 %	40 %	40 %	340793064
123	NC_015859	AGGGG	2	10	132327	132336	20 %	0 %	80 %	0 %	340793065
124	NC_015859	GCCCC	2	10	134297	134306	0 %	0 %	20 %	80 %	340793067
125	NC_015859	CACTG	2	10	134959	134968	20 %	20 %	20 %	40 %	340793067
126	NC_015859	CGTCT	2	10	135447	135456	0 %	40 %	20 %	40 %	340793068
127	NC_015859	CGACC	2	10	135554	135563	20 %	0 %	20 %	60 %	340793068
128	NC_015859	CCGCG	2	10	136475	136484	0 %	0 %	40 %	60 %	340793068
129	NC_015859	GCTCG	2	10	137774	137783	0 %	20 %	40 %	40 %	340793068
130	NC_015859	GGCTC	2	10	138280	138289	0 %	20 %	40 %	40 %	340793068
131	NC_015859	CCGGG	2	10	138575	138584	0 %	0 %	60 %	40 %	340793068
132	NC_015859	GCGCC	2	10	139393	139402	0 %	0 %	40 %	60 %	340793069
133	NC_015859	GTGCG	2	10	139467	139476	0 %	20 %	60 %	20 %	340793069
134	NC_015859	GGCGC	2	10	146873	146882	0 %	0 %	60 %	40 %	340793076
135	NC_015859	TCGAC	2	10	147694	147703	20 %	20 %	20 %	40 %	340793077
136	NC_015859	CGGTG	2	10	148750	148759	0 %	20 %	60 %	20 %	340793078
137	NC_015859	GTGCG	2	10	148929	148938	0 %	20 %	60 %	20 %	340793078
138	NC_015859	CCGGT	2	10	149545	149554	0 %	20 %	40 %	40 %	340793079
139	NC_015859	GGACT	2	10	151275	151284	20 %	20 %	40 %	20 %	340793081
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141	NC_015859	GTGCG	2	10	156590	156599	0 %	20 %	60 %	20 %	340793087
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243	NC_015859	CCCCG	2	10	301955	301964	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
244	NC_015859	CAGCG	2	10	301995	302004	20 %	0 %	40 %	40 %	340793210
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248	NC_015859	CCCCG	2	10	308467	308476	0 %	0 %	20 %	80 %	340793211
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251	NC_015859	ACCGA	2	10	318135	318144	40 %	0 %	20 %	40 %	340793220
252	NC_015859	CCGAA	2	10	319144	319153	40 %	0 %	20 %	40 %	340793220
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254	NC_015859	CCGAG	2	10	320894	320903	20 %	0 %	40 %	40 %	340793222
255	NC_015859	TCGTG	2	10	321014	321023	0 %	40 %	40 %	20 %	340793222
256	NC_015859	CGCAG	2	10	321314	321323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
257	NC_015859	GCTGC	2	10	321936	321945	0 %	20 %	40 %	40 %	340793223
258	NC_015859	CGGGC	2	10	327142	327151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
259	NC_015859	GTGAG	2	10	331921	331930	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
260	NC_015859	AAGAG	2	10	332267	332276	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015859	CCGGC	2	10	333271	333280	0 %	0 %	40 %	60 %	340793234
262	NC_015859	GTCCG	2	10	333883	333892	0 %	20 %	40 %	40 %	340793234
263	NC_015859	AGCGA	2	10	333984	333993	40 %	0 %	40 %	20 %	340793234
264	NC_015859	GTGAT	2	10	335035	335044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015859	GCGGT	2	10	336103	336112	0 %	20 %	60 %	20 %	340793236
266	NC_015859	GGCCG	2	10	340357	340366	0 %	0 %	60 %	40 %	340793240
267	NC_015859	GGACG	2	10	340604	340613	20 %	0 %	60 %	20 %	340793241
268	NC_015859	GCGAC	2	10	344365	344374	20 %	0 %	40 %	40 %	340793245
269	NC_015859	CGGCG	2	10	344797	344806	0 %	0 %	60 %	40 %	340793245
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393	NC_015859	GCGGG	2	10	491664	491673	0 %	0 %	80 %	20 %	340793376
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398	NC_015859	GGTCG	2	10	497018	497027	0 %	20 %	60 %	20 %	340793382
399	NC_015859	CACCG	2	10	499332	499341	20 %	0 %	20 %	60 %	340793384
400	NC_015859	CGCGC	2	10	500220	500229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
401	NC_015859	CTGGA	2	10	500631	500640	20 %	20 %	40 %	20 %	340793385
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