MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 63823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	CGC	2	6	66	71	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
2	NC_015859	CCG	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
3	NC_015859	CAG	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
4	NC_015859	GTC	2	6	133	138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792957
5	NC_015859	AGA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
6	NC_015859	CGC	2	6	282	287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
7	NC_015859	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
8	NC_015859	GAG	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
9	NC_015859	TCC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
10	NC_015859	GAC	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
11	NC_015859	TCC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
12	NC_015859	GCC	2	6	532	537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
13	NC_015859	CCG	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
14	NC_015859	CCG	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
15	NC_015859	CCG	3	9	632	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
16	NC_015859	CGA	3	9	651	659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
17	NC_015859	CGC	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
18	NC_015859	TCA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792957
19	NC_015859	CCT	2	6	969	974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
20	NC_015859	TCG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792957
21	NC_015859	TCC	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
22	NC_015859	AGG	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
23	NC_015859	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340792957
24	NC_015859	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
25	NC_015859	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
26	NC_015859	GGA	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792957
27	NC_015859	CAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792957
28	NC_015859	AAG	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
29	NC_015859	GGC	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792957
30	NC_015859	TCC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792957
31	NC_015859	GTG	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792957
32	NC_015859	CGC	2	6	1347	1352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792957
33	NC_015859	GGT	3	9	1359	1367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792957
34	NC_015859	CGA	3	9	1538	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792957
35	NC_015859	CGG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792957
36	NC_015859	GAA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
37	NC_015859	AGA	2	6	1664	1669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792957
38	NC_015859	ACC	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792958
39	NC_015859	CAG	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
40	NC_015859	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
41	NC_015859	GTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792958
42	NC_015859	CCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792958
43	NC_015859	CAT	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792958
44	NC_015859	ACG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
45	NC_015859	CGA	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
46	NC_015859	TCC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792958
47	NC_015859	CCG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
48	NC_015859	TCA	2	6	2918	2923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792958
49	NC_015859	GAC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792958
50	NC_015859	CGC	2	6	3012	3017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
51	NC_015859	CCG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
52	NC_015859	GCT	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
53	NC_015859	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
54	NC_015859	CGG	2	6	3183	3188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792958
55	NC_015859	CTG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
56	NC_015859	GCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
57	NC_015859	CCG	2	6	3333	3338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792958
58	NC_015859	CGG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792958
59	NC_015859	GAG	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792958
60	NC_015859	TCG	2	6	3458	3463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
61	NC_015859	GTC	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792958
62	NC_015859	TCG	2	6	3810	3815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
63	NC_015859	CCG	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
64	NC_015859	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792959
65	NC_015859	ACC	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792959
66	NC_015859	GGA	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792959
67	NC_015859	GTC	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
68	NC_015859	CTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
69	NC_015859	CGT	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
70	NC_015859	CGG	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792959
71	NC_015859	GAG	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792959
72	NC_015859	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792959
73	NC_015859	TGC	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
74	NC_015859	GAC	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
75	NC_015859	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
76	NC_015859	CGC	2	6	4700	4705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
77	NC_015859	TCG	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792959
78	NC_015859	TCA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792959
79	NC_015859	CCG	3	9	4752	4760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
80	NC_015859	CGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792959
81	NC_015859	CCG	2	6	4776	4781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792959
82	NC_015859	TGA	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792959
83	NC_015859	CGC	2	6	4886	4891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792960
84	NC_015859	GAA	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792960
85	NC_015859	CGA	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792960
86	NC_015859	ACG	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792960
87	NC_015859	TCG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792960
88	NC_015859	GTC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792960
89	NC_015859	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792960
90	NC_015859	CGG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792960
91	NC_015859	CAC	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
92	NC_015859	CCA	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
93	NC_015859	CCA	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
94	NC_015859	GAC	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
95	NC_015859	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792961
96	NC_015859	CGG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792961
97	NC_015859	GGT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340792961
98	NC_015859	AAG	2	6	5996	6001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792961
99	NC_015859	CAC	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
100	NC_015859	CGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
101	NC_015859	CAA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792961
102	NC_015859	GGA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792961
103	NC_015859	CGC	3	9	6184	6192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
104	NC_015859	CGA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
105	NC_015859	GCC	2	6	6203	6208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
106	NC_015859	GAG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792961
107	NC_015859	AGA	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792961
108	NC_015859	ACC	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
109	NC_015859	CAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792961
110	NC_015859	GAC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
111	NC_015859	GAG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792961
112	NC_015859	TGA	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340792961
113	NC_015859	GAC	2	6	6566	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
114	NC_015859	CGC	2	6	6586	6591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
115	NC_015859	CCA	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
116	NC_015859	CAA	2	6	6745	6750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792961
117	NC_015859	CGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
118	NC_015859	CGG	2	6	6829	6834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340792961
119	NC_015859	TCC	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340792961
120	NC_015859	GAA	2	6	7015	7020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792961
121	NC_015859	ATC	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340792961
122	NC_015859	ACG	2	6	7065	7070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
123	NC_015859	CAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792961
124	NC_015859	CTG	3	9	7151	7159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340792961
125	NC_015859	GAG	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340792961
126	NC_015859	GCC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
127	NC_015859	CGC	2	6	7309	7314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340792961
128	NC_015859	CAA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340792961
129	NC_015859	GAC	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340792961
130	NC_015859	ACC	2	6	7394	7399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340792961
131	NC_015859	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340792961
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