MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella pinnipedialis B2/94 chromosome 2

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015858	GCGAA	2	10	288	297	40 %	0 %	40 %	20 %	340791768
2	NC_015858	CATGG	2	10	431	440	20 %	20 %	40 %	20 %	340791768
3	NC_015858	CCGCG	2	10	782	791	0 %	0 %	40 %	60 %	340791768
4	NC_015858	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	340791770
5	NC_015858	GGGAG	2	10	1695	1704	20 %	0 %	80 %	0 %	340791770
6	NC_015858	CTGCC	2	10	2165	2174	0 %	20 %	20 %	60 %	340791772
7	NC_015858	CAAGG	2	10	2499	2508	40 %	0 %	40 %	20 %	340791772
8	NC_015858	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015858	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	340791774
10	NC_015858	ACCGA	2	10	8529	8538	40 %	0 %	20 %	40 %	340791777
11	NC_015858	CGGCG	2	10	11736	11745	0 %	0 %	60 %	40 %	340791781
12	NC_015858	CCCCG	2	10	13915	13924	0 %	0 %	20 %	80 %	340791782
13	NC_015858	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015858	CATCA	2	10	15567	15576	40 %	20 %	0 %	40 %	340791784
15	NC_015858	CATCG	2	10	18229	18238	20 %	20 %	20 %	40 %	340791787
16	NC_015858	AGGCG	2	10	18955	18964	20 %	0 %	60 %	20 %	340791788
17	NC_015858	GCCAT	2	10	19219	19228	20 %	20 %	20 %	40 %	340791789
18	NC_015858	TGAGG	2	10	19505	19514	20 %	20 %	60 %	0 %	340791789
19	NC_015858	GCTTC	2	10	19587	19596	0 %	40 %	20 %	40 %	340791789
20	NC_015858	AGCGG	2	10	22143	22152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015858	TCTCG	2	10	23217	23226	0 %	40 %	20 %	40 %	340791792
22	NC_015858	CGGCC	2	10	23931	23940	0 %	0 %	40 %	60 %	340791792
23	NC_015858	CGGCC	2	10	24419	24428	0 %	0 %	40 %	60 %	340791793
24	NC_015858	ATCCG	2	10	24866	24875	20 %	20 %	20 %	40 %	340791793
25	NC_015858	GGCGA	2	10	25220	25229	20 %	0 %	60 %	20 %	340791794
26	NC_015858	ACGGC	2	10	27251	27260	20 %	0 %	40 %	40 %	340791797
27	NC_015858	GCGCA	2	10	28358	28367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015858	TCGGT	2	10	28575	28584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015858	CCGCG	2	10	33767	33776	0 %	0 %	40 %	60 %	340791802
30	NC_015858	CTGCC	2	10	35798	35807	0 %	20 %	20 %	60 %	340791802
31	NC_015858	GGCCT	2	10	37536	37545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015858	CGGAA	2	10	38826	38835	40 %	0 %	40 %	20 %	340791807
33	NC_015858	ATGAA	2	10	40107	40116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015858	CATGC	2	10	41055	41064	20 %	20 %	20 %	40 %	340791810
35	NC_015858	TTTGT	2	10	41268	41277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015858	GCGCC	2	10	41800	41809	0 %	0 %	40 %	60 %	340791811
37	NC_015858	CAGCG	2	10	42682	42691	20 %	0 %	40 %	40 %	340791812
38	NC_015858	CGCTC	2	10	43477	43486	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015858	CGGCG	2	10	43581	43590	0 %	0 %	60 %	40 %	340791814
40	NC_015858	GCAAA	2	10	44168	44177	60 %	0 %	20 %	20 %	340791815
41	NC_015858	TGAAA	2	10	44333	44342	60 %	20 %	20 %	0 %	340791816
42	NC_015858	TGCGC	2	10	48310	48319	0 %	20 %	40 %	40 %	340791820
43	NC_015858	CCGCT	2	10	50325	50334	0 %	20 %	20 %	60 %	340791820
44	NC_015858	GGTAA	2	10	51656	51665	40 %	20 %	40 %	0 %	340791821
45	NC_015858	CCGGC	2	10	52110	52119	0 %	0 %	40 %	60 %	340791821
46	NC_015858	CGGAA	2	10	52810	52819	40 %	0 %	40 %	20 %	340791821
47	NC_015858	GCCGT	2	10	55104	55113	0 %	20 %	40 %	40 %	340791823
48	NC_015858	CATTC	2	10	55353	55362	20 %	40 %	0 %	40 %	340791823
49	NC_015858	CTTCG	2	10	57233	57242	0 %	40 %	20 %	40 %	340791825
50	NC_015858	TTTGC	2	10	59209	59218	0 %	60 %	20 %	20 %	340791827
51	NC_015858	TGCCC	2	10	60606	60615	0 %	20 %	20 %	60 %	340791828
52	NC_015858	TGCGG	2	10	60844	60853	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015858	ATGCG	2	10	62547	62556	20 %	20 %	40 %	20 %	340791831
54	NC_015858	ATGTG	2	10	64385	64394	20 %	40 %	40 %	0 %	340791832
55	NC_015858	ATCGC	2	10	68554	68563	20 %	20 %	20 %	40 %	340791836
56	NC_015858	GACGG	2	10	68865	68874	20 %	0 %	60 %	20 %	340791836
57	NC_015858	TATCT	2	10	73100	73109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015858	AGGGC	2	10	78453	78462	20 %	0 %	60 %	20 %	340791845
59	NC_015858	AATTC	2	10	78573	78582	40 %	40 %	0 %	20 %	340791845
60	NC_015858	TCGGT	2	10	81777	81786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015858	TTCTC	2	10	81806	81815	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015858	TCTGC	2	10	83161	83170	0 %	40 %	20 %	40 %	340791848
63	NC_015858	AGCCA	2	10	86898	86907	40 %	0 %	20 %	40 %	340791851
64	NC_015858	ACTTG	2	10	87335	87344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015858	GCCGG	2	10	93499	93508	0 %	0 %	60 %	40 %	340791858
66	NC_015858	CTTTC	2	10	94121	94130	0 %	60 %	0 %	40 %	340791859
67	NC_015858	GCAAT	2	10	94747	94756	40 %	20 %	20 %	20 %	340791859
68	NC_015858	CTTGC	2	10	94991	95000	0 %	40 %	20 %	40 %	340791860
69	NC_015858	GGAAT	2	10	95261	95270	40 %	20 %	40 %	0 %	340791860
70	NC_015858	GTAAT	2	10	95881	95890	40 %	40 %	20 %	0 %	340791861
71	NC_015858	AAGCG	2	10	96112	96121	40 %	0 %	40 %	20 %	340791861
72	NC_015858	CCGAG	2	10	96568	96577	20 %	0 %	40 %	40 %	340791861
73	NC_015858	CGGTA	2	10	97198	97207	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015858	CCAAG	2	10	97373	97382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015858	TCGCT	2	10	97718	97727	0 %	40 %	20 %	40 %	340791862
76	NC_015858	ATGGC	2	10	98234	98243	20 %	20 %	40 %	20 %	340791862
77	NC_015858	TTCGC	2	10	99620	99629	0 %	40 %	20 %	40 %	340791863
78	NC_015858	GCTCT	2	10	99733	99742	0 %	40 %	20 %	40 %	340791863
79	NC_015858	ATGAG	2	10	99827	99836	40 %	20 %	40 %	0 %	340791863
80	NC_015858	GTTCC	2	10	99939	99948	0 %	40 %	20 %	40 %	340791863
81	NC_015858	TGCTG	2	10	100547	100556	0 %	40 %	40 %	20 %	340791864
82	NC_015858	ATGAA	2	10	103460	103469	60 %	20 %	20 %	0 %	340791868
83	NC_015858	CCGCT	2	10	103755	103764	0 %	20 %	20 %	60 %	340791869
84	NC_015858	CCGAT	2	10	103908	103917	20 %	20 %	20 %	40 %	340791869
85	NC_015858	TCCTT	2	10	106804	106813	0 %	60 %	0 %	40 %	340791871
86	NC_015858	GGCGA	2	10	107785	107794	20 %	0 %	60 %	20 %	340791872
87	NC_015858	CTTGC	2	10	108032	108041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015858	CCTGC	2	10	112706	112715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015858	CCGCG	2	10	113341	113350	0 %	0 %	40 %	60 %	340791877
90	NC_015858	CGGTG	2	10	114929	114938	0 %	20 %	60 %	20 %	340791878
91	NC_015858	GCCCG	2	10	115966	115975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_015858	GCACA	2	10	117257	117266	40 %	0 %	20 %	40 %	340791879
93	NC_015858	GTTCG	2	10	117278	117287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015858	GCCAT	2	10	117888	117897	20 %	20 %	20 %	40 %	340791880
95	NC_015858	GAAAA	2	10	119209	119218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015858	CGATA	2	10	121446	121455	40 %	20 %	20 %	20 %	340791884
97	NC_015858	GCCCG	2	10	121860	121869	0 %	0 %	40 %	60 %	340791884
98	NC_015858	CATCG	2	10	125381	125390	20 %	20 %	20 %	40 %	340791889
99	NC_015858	CGCGG	2	10	128103	128112	0 %	0 %	60 %	40 %	340791892
100	NC_015858	AATCA	2	10	129224	129233	60 %	20 %	0 %	20 %	340791894
101	NC_015858	TGGGC	2	10	132916	132925	0 %	20 %	60 %	20 %	340791899
102	NC_015858	CAAGA	2	10	133028	133037	60 %	0 %	20 %	20 %	340791899
103	NC_015858	AGATA	2	10	134643	134652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015858	TGGGA	2	10	136304	136313	20 %	20 %	60 %	0 %	340791903
105	NC_015858	GGGCA	3	15	140814	140828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015858	GCCGC	2	10	141681	141690	0 %	0 %	40 %	60 %	340791908
107	NC_015858	CCGCA	2	10	143332	143341	20 %	0 %	20 %	60 %	340791912
108	NC_015858	ATGAA	2	10	144383	144392	60 %	20 %	20 %	0 %	340791913
109	NC_015858	TTGGC	2	10	145213	145222	0 %	40 %	40 %	20 %	340791915
110	NC_015858	CGCAG	2	10	146844	146853	20 %	0 %	40 %	40 %	340791916
111	NC_015858	CCGGC	2	10	150226	150235	0 %	0 %	40 %	60 %	340791922
112	NC_015858	CGCAT	2	10	150304	150313	20 %	20 %	20 %	40 %	340791922
113	NC_015858	CTATA	2	10	151781	151790	40 %	40 %	0 %	20 %	340791924
114	NC_015858	CCGGG	2	10	152363	152372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015858	GCTTT	2	10	152765	152774	0 %	60 %	20 %	20 %	340791925
116	NC_015858	CGCGG	2	10	152844	152853	0 %	0 %	60 %	40 %	340791925
117	NC_015858	TGCGA	2	10	155142	155151	20 %	20 %	40 %	20 %	340791930
118	NC_015858	CGGAT	2	10	160853	160862	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015858	TGGGC	2	10	160984	160993	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015858	TGTTT	2	10	161437	161446	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015858	CCCGT	2	10	162162	162171	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_015858	AGCGG	2	10	164115	164124	20 %	0 %	60 %	20 %	340791937
123	NC_015858	GCCGC	2	10	166602	166611	0 %	0 %	40 %	60 %	340791939
124	NC_015858	GTGGC	2	10	166918	166927	0 %	20 %	60 %	20 %	340791939
125	NC_015858	GCCTG	2	10	167715	167724	0 %	20 %	40 %	40 %	340791940
126	NC_015858	GGCCG	2	10	170669	170678	0 %	0 %	60 %	40 %	340791942
127	NC_015858	AGGGC	2	10	171102	171111	20 %	0 %	60 %	20 %	340791943
128	NC_015858	GCCCG	2	10	171912	171921	0 %	0 %	40 %	60 %	340791944
129	NC_015858	GTTCG	2	10	173564	173573	0 %	40 %	40 %	20 %	340791945
130	NC_015858	GTCTC	2	10	173599	173608	0 %	40 %	20 %	40 %	340791945
131	NC_015858	GCCGA	2	10	176351	176360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015858	GCCCC	2	10	176378	176387	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
133	NC_015858	CTTCA	2	10	181191	181200	20 %	40 %	0 %	40 %	340791952
134	NC_015858	TGACC	2	10	181460	181469	20 %	20 %	20 %	40 %	340791952
135	NC_015858	GCCTC	2	10	183728	183737	0 %	20 %	20 %	60 %	340791955
136	NC_015858	GGATA	2	10	189420	189429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015858	GTGAA	2	10	191626	191635	40 %	20 %	40 %	0 %	340791962
138	NC_015858	GAAGA	2	10	191958	191967	60 %	0 %	40 %	0 %	340791962
139	NC_015858	GCCGC	2	10	192461	192470	0 %	0 %	40 %	60 %	340791962
140	NC_015858	TGACG	2	10	193166	193175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015858	GATCA	2	10	194612	194621	40 %	20 %	20 %	20 %	340791964
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151	NC_015858	TGAAA	2	10	210725	210734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015858	TGAAG	2	10	211171	211180	40 %	20 %	40 %	0 %	340791979
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187	NC_015858	CGTCC	2	10	256668	256677	0 %	20 %	20 %	60 %	340792025
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241	NC_015858	GCCCG	2	10	351575	351584	0 %	0 %	40 %	60 %	340792117
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254	NC_015858	GGAAC	2	10	365639	365648	40 %	0 %	40 %	20 %	340792133
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257	NC_015858	TGAAA	2	10	369682	369691	60 %	20 %	20 %	0 %	340792135
258	NC_015858	CGTTC	2	10	371894	371903	0 %	40 %	20 %	40 %	340792137
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262	NC_015858	AGCGC	2	10	377432	377441	20 %	0 %	40 %	40 %	340792142
263	NC_015858	CTGTT	2	10	378184	378193	0 %	60 %	20 %	20 %	340792143
264	NC_015858	TGGAG	2	10	380629	380638	20 %	20 %	60 %	0 %	340792144
265	NC_015858	GGCAA	2	10	380949	380958	40 %	0 %	40 %	20 %	340792144
266	NC_015858	TGCCG	2	10	386888	386897	0 %	20 %	40 %	40 %	340792149
267	NC_015858	CCTGT	2	10	389052	389061	0 %	40 %	20 %	40 %	340792151
268	NC_015858	CGCAG	2	10	392540	392549	20 %	0 %	40 %	40 %	340792154
269	NC_015858	CGCGG	2	10	392733	392742	0 %	0 %	60 %	40 %	340792154
270	NC_015858	CCGGA	2	10	393181	393190	20 %	0 %	40 %	40 %	340792154
271	NC_015858	TGGAG	2	10	393695	393704	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_015858	CATGG	2	10	530304	530313	20 %	20 %	40 %	20 %	340792293
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397	NC_015858	GACCA	2	10	553165	553174	40 %	0 %	20 %	40 %	340792309
398	NC_015858	TCTTG	2	10	555211	555220	0 %	60 %	20 %	20 %	340792310
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400	NC_015858	CGCGG	2	10	556572	556581	0 %	0 %	60 %	40 %	340792311
401	NC_015858	GTACG	2	10	556980	556989	20 %	20 %	40 %	20 %	340792311
402	NC_015858	CTGAT	2	10	557478	557487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_015858	TTGTC	2	10	701612	701621	0 %	60 %	20 %	20 %	340792449
500	NC_015858	GGCTC	2	10	703326	703335	0 %	20 %	40 %	40 %	340792452

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