MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella pinnipedialis B2/94 chromosome 1

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015857	ACGGTT	2	12	34843	34854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015857	CGGCTA	2	12	53686	53697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015857	AACAGT	2	12	80207	80218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015857	CCTGGC	2	12	81572	81583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015857	TTTTGC	2	12	94742	94753	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015857	GCTTTT	2	12	103520	103531	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015857	CGGAAG	2	12	115573	115584	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015857	TGGCCT	2	12	115691	115702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015857	TTGCCA	2	12	118393	118404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015857	GTTCCT	2	12	119273	119284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015857	CGACAG	2	12	119534	119545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015857	GCCATG	2	12	120971	120982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015857	CGGGTG	2	12	121826	121837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015857	AAGGGC	2	12	122131	122142	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015857	GCCGAG	2	12	162796	162807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015857	GGGGAA	2	12	169806	169817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015857	TCTGGC	2	12	186296	186307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015857	CGTATC	2	12	194196	194207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015857	TGAAAA	2	12	206774	206785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015857	AAGCCG	2	12	265129	265140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015857	GGTGTA	2	12	269633	269644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015857	CTCCCG	2	12	275078	275089	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015857	TTCTGC	2	12	277785	277796	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015857	CACGCG	2	12	280612	280623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015857	TGGTCA	2	12	292618	292629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015857	CTGATG	2	12	297281	297292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015857	GGCACA	2	12	307728	307739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015857	CTGAAA	2	12	353365	353376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015857	CTGTCT	2	12	364139	364150	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015857	TTGCCT	2	12	364444	364455	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015857	TTTAAC	2	12	454492	454503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015857	GGCGCG	2	12	490381	490392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015857	CGTTTT	2	12	528184	528195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015857	ATGACC	2	12	537959	537970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015857	ACGGTC	2	12	549126	549137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015857	TTACGT	2	12	580256	580267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015857	GCTATG	2	12	671762	671773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015857	ATTTGT	2	12	686832	686843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015857	GGCAAA	2	12	688614	688625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015857	GGCAAA	2	12	688748	688759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015857	CATCGT	2	12	712966	712977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015857	CGGGAT	2	12	756661	756672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015857	ATTGAA	2	12	778980	778991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015857	CTTTTC	2	12	794966	794977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015857	TCGCGC	2	12	835642	835653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015857	CTTCGC	2	12	886927	886938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015857	GAATAT	2	12	887149	887160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015857	GAAATT	2	12	928489	928500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015857	AGACGC	2	12	960249	960260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015857	CGCTGG	2	12	967851	967862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015857	GCTGAT	2	12	1024121	1024132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015857	CTGTTT	2	12	1025418	1025429	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015857	TATTTT	2	12	1043473	1043484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015857	GGACTT	2	12	1046706	1046717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015857	GCCGAA	2	12	1048219	1048230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015857	TGACCA	2	12	1077843	1077854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015857	TTTTCC	2	12	1168581	1168592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015857	CAAAAA	2	12	1207860	1207871	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015857	TGAATT	2	12	1265047	1265058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015857	CGTTTC	2	12	1322712	1322723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015857	CACCGC	2	12	1323765	1323776	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015857	AAAACA	2	12	1323954	1323965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015857	TGGAAC	2	12	1344569	1344580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015857	TTCAAA	2	12	1346255	1346266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015857	AAAGCG	2	12	1362657	1362668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015857	ATAGCC	2	12	1362907	1362918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015857	AAGCGC	2	12	1377386	1377397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015857	CCGCGC	2	12	1414532	1414543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015857	GTAAAA	2	12	1432757	1432768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015857	GCATTT	2	12	1438641	1438652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015857	CATCGG	2	12	1465136	1465147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015857	ATGCCA	2	12	1467551	1467562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015857	AAGGAA	2	12	1499818	1499829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015857	GCTCTG	2	12	1501899	1501910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015857	AAAAGC	2	12	1574450	1574461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015857	CTGCCG	2	12	1621366	1621377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015857	AAGGGC	2	12	1628388	1628399	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015857	AATGCC	2	12	1681067	1681078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015857	CTGCCG	2	12	1826435	1826446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015857	AGAAAC	2	12	1872854	1872865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015857	AACTCA	2	12	1888984	1888995	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015857	GAAACG	2	12	1932466	1932477	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015857	CCAACA	2	12	1969753	1969764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015857	TGGCCA	2	12	1990825	1990836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015857	TTCTTT	2	12	2092719	2092730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015857	TCTTTG	2	12	2130525	2130536	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.