MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella pinnipedialis B2/94 chromosome 1

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015857	CATGC	2	10	26940	26949	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015857	CATGC	2	10	28355	28364	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015857	CGAAA	2	10	28553	28562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015857	CGGAG	2	10	31531	31540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015857	CCGTG	2	10	40685	40694	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015857	TAAAG	2	10	50755	50764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015857	TGAAA	2	10	51872	51881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015857	GCCGC	2	10	53006	53015	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015857	CGGAG	2	10	72670	72679	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015857	AAATA	2	10	78803	78812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015857	ACGTT	2	10	80050	80059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015857	TGGCG	2	10	81269	81278	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015857	TCGAT	2	10	89500	89509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015857	TTCCA	2	10	95775	95784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015857	CGGTT	2	10	96147	96156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015857	GAACC	2	10	96199	96208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015857	GCACC	2	10	107081	107090	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015857	TTTGT	2	10	107574	107583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015857	GCCGC	2	10	114791	114800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015857	CTGGC	2	10	114870	114879	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015857	GCGCA	2	10	117573	117582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015857	GCTCG	2	10	118538	118547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015857	GACCA	2	10	118554	118563	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015857	CGCGG	2	10	120591	120600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015857	GGCGA	2	10	120877	120886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015857	TGGCT	2	10	122152	122161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015857	GCTCG	2	10	122331	122340	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015857	ATGGA	2	10	123121	123130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015857	TGCGA	2	10	151124	151133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015857	ACAGC	2	10	162744	162753	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015857	CGGAG	2	10	166079	166088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015857	ACAAA	2	10	166146	166155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015857	CTGCC	2	10	170507	170516	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015857	TGAAA	2	10	171879	171888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015857	CGTGT	2	10	172776	172785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015857	TTTTA	2	10	174583	174592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015857	AAAGC	2	10	196483	196492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015857	CGATC	2	10	206038	206047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015857	TTTCG	2	10	217138	217147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015857	TCAGG	2	10	220316	220325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015857	CTTGG	2	10	228361	228370	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015857	GGCAG	2	10	233739	233748	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015857	ATTCC	2	10	266324	266333	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015857	CAACC	2	10	273277	273286	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015857	CGGCG	2	10	273641	273650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015857	AAATC	2	10	280671	280680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015857	AAGGG	2	10	280701	280710	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015857	GGGGC	2	10	291445	291454	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015857	TTGCG	2	10	292345	292354	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015857	ATTCT	2	10	310811	310820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015857	TGGCT	2	10	327355	327364	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015857	AAAAG	2	10	333328	333337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015857	GTTTC	2	10	343250	343259	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015857	CAGCT	2	10	348860	348869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015857	TCTTT	2	10	352681	352690	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015857	CGTGG	2	10	369108	369117	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015857	GCCTG	2	10	408167	408176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015857	ACGCG	2	10	408181	408190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015857	CCGGC	2	10	408201	408210	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015857	CGAAA	2	10	425454	425463	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015857	CCGGG	2	10	426548	426557	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015857	ACAAA	2	10	426759	426768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015857	AGCGA	2	10	429848	429857	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015857	GAAAA	2	10	434783	434792	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015857	AGGCT	2	10	443525	443534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015857	GGGTT	2	10	449343	449352	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015857	AATGT	2	10	449420	449429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015857	AAAAG	2	10	453993	454002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015857	ACCGC	2	10	455123	455132	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_015857	GTTTT	2	10	455144	455153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015857	AACGC	2	10	472978	472987	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015857	CGGCA	2	10	490069	490078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015857	TGTTC	2	10	490725	490734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015857	TGGTG	2	10	490935	490944	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015857	AGGGC	2	10	497398	497407	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015857	TGCCG	2	10	497459	497468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015857	CGGAA	2	10	505955	505964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015857	TTTTA	2	10	506668	506677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015857	AAATT	2	10	508635	508644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015857	ATGAA	2	10	508656	508665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015857	ACAGG	2	10	515809	515818	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015857	GATGC	2	10	537782	537791	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015857	ACGAG	2	10	538500	538509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015857	CCGCA	2	10	538685	538694	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_015857	TGCCA	2	10	544315	544324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015857	AGTTT	2	10	569885	569894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015857	ATAGT	2	10	570012	570021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015857	TTTGC	2	10	584986	584995	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015857	AAAGA	2	10	585009	585018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015857	ACTGA	2	10	589411	589420	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015857	TGGGC	2	10	593920	593929	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015857	TAAAA	2	10	643258	643267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015857	GAACG	2	10	650024	650033	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015857	ACCGG	2	10	651747	651756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015857	TTTGC	2	10	654307	654316	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015857	TCCTA	2	10	671117	671126	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015857	TCCGC	2	10	672152	672161	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015857	GCAAG	2	10	686788	686797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015857	ACGAC	2	10	688544	688553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015857	ACGAC	2	10	688678	688687	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015857	CCGAT	2	10	715601	715610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015857	ACAAA	2	10	721161	721170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015857	AAGAT	2	10	728454	728463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015857	CAAAG	2	10	729024	729033	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015857	TCTTT	2	10	731766	731775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015857	CTGAA	2	10	741967	741976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015857	CAGGC	2	10	755336	755345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015857	CATGC	2	10	759062	759071	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015857	ACAAA	2	10	770451	770460	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015857	CAAGA	2	10	770479	770488	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015857	ATGCC	2	10	777246	777255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015857	TTTGT	2	10	788079	788088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015857	GAAAA	2	10	789834	789843	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015857	ACAAA	2	10	789966	789975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015857	CTTGT	2	10	796090	796099	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015857	CTTGA	2	10	800403	800412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015857	ATGCC	2	10	806760	806769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015857	ATTGG	2	10	815746	815755	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015857	GTAAA	2	10	836646	836655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015857	TGAAG	2	10	847547	847556	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015857	AGCGA	2	10	850187	850196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015857	GGCAG	2	10	858486	858495	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015857	GCGCG	2	10	858536	858545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015857	GAGCT	2	10	870956	870965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015857	GGGCA	2	10	872731	872740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015857	GACAG	2	10	875572	875581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015857	GACAG	2	10	940248	940257	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015857	GGTGC	2	10	946951	946960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015857	ATGCG	2	10	951040	951049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015857	CGGGG	2	10	951127	951136	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015857	CCAAC	2	10	951577	951586	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015857	CATCT	2	10	953555	953564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015857	TTGCC	2	10	954994	955003	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015857	GCAGG	2	10	962775	962784	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015857	GAAGC	2	10	964470	964479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015857	GGGCC	2	10	964511	964520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015857	TGCTT	2	10	964595	964604	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015857	TTCCT	2	10	969552	969561	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015857	CGCTG	2	10	969587	969596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015857	AAATA	2	10	1011586	1011595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015857	ATGAA	2	10	1021413	1021422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015857	ACAAA	2	10	1023277	1023286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015857	CGGCA	2	10	1026429	1026438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015857	TTTTA	2	10	1041513	1041522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015857	ATTGA	2	10	1046910	1046919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015857	ATCGC	2	10	1047510	1047519	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_015857	ACAAA	2	10	2115911	2115920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_015857	TGTGC	2	10	2119887	2119896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015857	CCCGG	2	10	2121505	2121514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
288	NC_015857	ACCCG	2	10	2121893	2121902	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_015857	CGGAT	2	10	2121918	2121927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_015857	GGCTT	2	10	2132478	2132487	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015857	GGATG	2	10	2137581	2137590	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.