MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015856	TGCATT	2	12	19756	19767	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015856	CCACAC	2	12	20113	20124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015856	CAGCGC	2	12	40570	40581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015856	CCGTTG	2	12	41674	41685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015856	GCAGAT	2	12	110510	110521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015856	CGGCTG	2	12	129706	129717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015856	CGCAGG	2	12	130497	130508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015856	AGCAAG	2	12	141525	141536	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015856	GCAATT	2	12	284382	284393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015856	GGCAAG	2	12	308811	308822	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015856	ACCCAG	2	12	352975	352986	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015856	CCGGCG	2	12	393229	393240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015856	TCATCG	2	12	393250	393261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015856	ATCGCA	2	12	396064	396075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015856	TCACGA	2	12	439228	439239	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015856	ATAATG	2	12	456623	456634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015856	CTTGTT	2	12	459971	459982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015856	CAGCAT	2	12	468939	468950	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015856	ATTTCT	2	12	484415	484426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015856	TGCGCA	2	12	489926	489937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015856	GCTTCC	2	12	502526	502537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015856	TGAAAA	2	12	525181	525192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015856	GCTGGC	2	12	529931	529942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015856	TTCCCA	2	12	598290	598301	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015856	TTGTCG	2	12	614925	614936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015856	GACGCC	2	12	641175	641186	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015856	ATAATT	2	12	658345	658356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015856	GGTTCA	2	12	663457	663468	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015856	GTTGCG	2	12	737674	737685	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015856	CAAAAA	2	12	763269	763280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015856	GCCGGC	2	12	771896	771907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015856	TTATTT	2	12	775845	775856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015856	TTGAAA	2	12	776327	776338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015856	CTTTGC	2	12	778709	778720	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015856	CCACCT	2	12	779260	779271	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015856	TCAGGG	2	12	791823	791834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015856	CGCCGG	2	12	816684	816695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015856	CTGCCG	2	12	857869	857880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015856	ATGGCA	2	12	1010080	1010091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015856	AATAAA	2	12	1025911	1025922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015856	CGGCAT	2	12	1093206	1093217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015856	TTTCAG	3	18	1176300	1176317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015856	CGGAAG	2	12	1194309	1194320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015856	GCGTCG	2	12	1269756	1269767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015856	TTTTCG	2	12	1274143	1274154	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015856	ACGGCA	2	12	1276842	1276853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015856	CATATC	2	12	1491451	1491462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015856	TAAAAA	2	12	1589259	1589270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015856	AGGCTT	2	12	1669624	1669635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015856	TCCGGC	2	12	1676117	1676128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015856	TTGGGC	2	12	1695639	1695650	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015856	CGCTGG	2	12	1733492	1733503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015856	TTGGCA	2	12	1738594	1738605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015856	CATTGC	2	12	1747519	1747530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015856	TCAGCC	2	12	1747611	1747622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015856	GTTTAC	2	12	1748357	1748368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015856	TACATC	2	12	1749645	1749656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015856	TTCCTG	2	12	1810174	1810185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015856	AAAATA	2	12	1835874	1835885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015856	GTTAAC	2	12	1860475	1860486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015856	AAAAGC	2	12	1879774	1879785	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015856	CTGCGC	2	12	1942535	1942546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015856	TGACGC	2	12	1943043	1943054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015856	CAAGGA	2	12	1952229	1952240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015856	GTTCCA	2	12	2090129	2090140	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015856	GATTTC	2	12	2139453	2139464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015856	CGGCGT	2	12	2188947	2188958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015856	CCGGCG	2	12	2234138	2234149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015856	AATTTA	2	12	2278601	2278612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015856	CCTTGC	2	12	2345475	2345486	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015856	CATGTT	2	12	2358982	2358993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015856	GGAGAC	2	12	2361359	2361370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015856	ATTGAA	2	12	2485892	2485903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015856	CGGCAT	2	12	2500157	2500168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015856	ACTGTG	2	12	2500567	2500578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015856	CACGTT	2	12	2503465	2503476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015856	ATCGCA	2	12	2511132	2511143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015856	CGCCGG	2	12	2687341	2687352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015856	ATAGAA	2	12	2693886	2693897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015856	CGCAAA	2	12	2764086	2764097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015856	TGCGCC	2	12	2800738	2800749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015856	GCCGCA	2	12	2815399	2815410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015856	CCTACT	2	12	2861213	2861224	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015856	AAGCGC	2	12	2865386	2865397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015856	AACTAC	2	12	2953669	2953680	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015856	ATCGAA	2	12	3044419	3044430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015856	ATTGTG	2	12	3123810	3123821	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015856	TTCCCA	2	12	3124675	3124686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015856	TGTTTC	2	12	3126675	3126686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015856	ATCCGG	2	12	3128820	3128831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015856	GTGACA	2	12	3135562	3135573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015856	GCAGTA	2	12	3143776	3143787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015856	TTATTT	2	12	3147903	3147914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015856	GCGGCT	2	12	3156433	3156444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015856	AATACA	2	12	3182933	3182944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015856	CTGGCG	2	12	3290417	3290428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015856	CCGGCG	2	12	3355690	3355701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015856	CAAAAA	2	12	3406039	3406050	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015856	CAATCT	2	12	3419194	3419205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015856	ACGTGG	2	12	3436846	3436857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015856	CCACGC	2	12	3444663	3444674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015856	CCTCCC	2	12	3686308	3686319	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_015856	ACCTTG	2	12	3687716	3687727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015856	TGGCGC	3	18	3705192	3705209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015856	GCGCCG	2	12	3714957	3714968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015856	ACAGTA	2	12	3723127	3723138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015856	CGGTGG	2	12	3723357	3723368	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015856	TGGCGG	2	12	3723381	3723392	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015856	CAACGA	2	12	3728944	3728955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015856	TGAAAA	2	12	3825083	3825094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015856	TTGCGG	2	12	3849908	3849919	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015856	GCCATA	2	12	3903495	3903506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015856	GTCGCA	2	12	3904071	3904082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015856	CAGAAA	2	12	3909096	3909107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015856	TTTCCC	2	12	3912173	3912184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015856	CAAGTC	2	12	3926224	3926235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015856	GCTCGA	2	12	3930752	3930763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015856	GCTGGT	2	12	3931934	3931945	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015856	TGAAGG	2	12	3944560	3944571	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015856	AGCAAG	2	12	3945087	3945098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015856	TAGCGA	2	12	3965913	3965924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015856	AGAAAC	2	12	3983960	3983971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015856	TTGCAG	2	12	4012260	4012271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015856	GGACAT	2	12	4076587	4076598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015856	ATGCAT	2	12	4113479	4113490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015856	GGCCGG	2	12	4136604	4136615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015856	TATGCT	2	12	4140183	4140194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015856	CTGTAT	2	12	4212230	4212241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015856	TTTTTC	2	12	4268207	4268218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015856	TTATTC	2	12	4357346	4357357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015856	CCTCGA	2	12	4387765	4387776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015856	ATTTCT	2	12	4445796	4445807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015856	AAAAGA	2	12	4524832	4524843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015856	TCGACC	2	12	4534148	4534159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015856	CGGTCT	2	12	4534515	4534526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015856	ACAAAA	2	12	4559991	4560002	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015856	CCTCGG	2	12	4656597	4656608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015856	AGCCGG	2	12	4661066	4661077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015856	ATTTCT	2	12	4697431	4697442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015856	CGCTGG	2	12	4752195	4752206	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015856	CATTGC	2	12	4837549	4837560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015856	TTTCAA	2	12	4863517	4863528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015856	CGGTAG	2	12	4901159	4901170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_015856	GTTAAC	2	12	4975770	4975781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_015856	CAAAAC	2	12	5120716	5120727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015856	GATCAA	2	12	5137085	5137096	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_015856	CATTTT	2	12	5181655	5181666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015856	GAGGCG	2	12	5182272	5182283	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.