MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015856	TTCTG	2	10	18029	18038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015856	ATGCA	2	10	29012	29021	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015856	CAAAA	2	10	32709	32718	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015856	TCCAG	2	10	36941	36950	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015856	CTCTG	2	10	37040	37049	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015856	CACGC	2	10	41933	41942	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015856	CAGGC	2	10	73584	73593	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015856	TTCCT	2	10	74104	74113	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015856	ATGGC	2	10	83173	83182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015856	TGCAA	2	10	83256	83265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015856	ATTGG	2	10	129191	129200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015856	CCGAT	2	10	130245	130254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015856	CGGCT	2	10	130328	130337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015856	GATTT	2	10	132065	132074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015856	TCCAC	2	10	132135	132144	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_015856	ATGGC	2	10	135969	135978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015856	GTATT	2	10	144212	144221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015856	AAAGG	2	10	174162	174171	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015856	TGCAT	2	10	195276	195285	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015856	GCATC	2	10	196380	196389	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015856	CGGCG	2	10	197266	197275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015856	GGCCG	2	10	215477	215486	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015856	TTAAT	2	10	229505	229514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015856	GCTGG	2	10	244441	244450	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015856	GGCAA	2	10	245764	245773	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015856	GTCGG	2	10	277356	277365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015856	ACCTT	2	10	278597	278606	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015856	ATATT	2	10	279931	279940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015856	GGAAA	2	10	280309	280318	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015856	GGCAA	2	10	281797	281806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015856	GGTGG	2	10	282550	282559	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015856	GAATT	2	10	283823	283832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015856	GAAGA	2	10	285473	285482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015856	CGGTT	2	10	285823	285832	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015856	CGCAC	2	10	286342	286351	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015856	TCGAA	2	10	286374	286383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015856	AAGCC	2	10	286775	286784	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015856	CATGC	2	10	301573	301582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015856	CTTGG	2	10	328309	328318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015856	CTGTT	2	10	333401	333410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015856	GCCAT	2	10	338086	338095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015856	AAAAT	2	10	346348	346357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015856	TTCCA	2	10	346391	346400	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015856	GCCGA	2	10	355253	355262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015856	TGCTA	2	10	355269	355278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015856	CCTCA	2	10	360352	360361	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015856	GGAAT	2	10	434727	434736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015856	GGCTC	2	10	447898	447907	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015856	GGTCC	2	10	463027	463036	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015856	TGTTT	2	10	466089	466098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015856	ACGAA	2	10	469111	469120	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015856	GTGAA	2	10	485803	485812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015856	CGAAT	2	10	502562	502571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015856	CAAGC	2	10	503088	503097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015856	CGAGC	2	10	503737	503746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015856	GTTGT	2	10	507676	507685	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015856	TTTTC	2	10	533112	533121	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015856	ACAAT	2	10	541687	541696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015856	GCAAA	2	10	564589	564598	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015856	GCCAT	2	10	573043	573052	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015856	GGATC	2	10	583998	584007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015856	TCTGG	2	10	584100	584109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015856	GCGTT	2	10	584269	584278	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015856	GACAG	2	10	630730	630739	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015856	GGTCA	2	10	638518	638527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015856	ATAAA	2	10	669466	669475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015856	AGTTA	2	10	671845	671854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015856	GAGTA	2	10	685274	685283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015856	CCGGA	2	10	692412	692421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015856	CCAAA	2	10	706732	706741	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015856	TTGTT	2	10	709536	709545	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015856	AGTCG	2	10	709571	709580	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015856	AGGGG	2	10	709657	709666	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015856	CGTCG	2	10	726094	726103	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015856	TGCCA	2	10	771163	771172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015856	CAAAT	2	10	774471	774480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015856	TTCAA	2	10	774910	774919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015856	ACACA	2	10	776311	776320	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015856	GAATG	2	10	778518	778527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015856	TTGGG	2	10	779505	779514	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015856	CCTTG	2	10	786555	786564	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_015856	CAAAT	2	10	787076	787085	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015856	TTTTC	2	10	790422	790431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015856	TAGGG	2	10	796960	796969	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015856	GCCGG	2	10	816634	816643	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015856	ATCTC	2	10	828911	828920	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015856	TCGTG	2	10	830254	830263	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015856	ATCAA	2	10	831180	831189	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015856	GTGGG	2	10	843948	843957	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015856	CGGCG	2	10	873112	873121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015856	GCGTA	2	10	908493	908502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015856	GTTAA	2	10	923356	923365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015856	TTGAT	2	10	948868	948877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015856	TGATT	2	10	950851	950860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015856	TCACT	2	10	954784	954793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015856	GCAAT	2	10	976515	976524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015856	TTTTG	2	10	1008682	1008691	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015856	CAAAA	2	10	1025332	1025341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015856	AATTC	2	10	1025966	1025975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015856	AATAC	2	10	1026140	1026149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015856	CAAAA	2	10	1028231	1028240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015856	TGCAG	2	10	1030303	1030312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015856	CTATT	2	10	1034216	1034225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015856	TGGCC	2	10	1082390	1082399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015856	AGATG	2	10	1083712	1083721	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015856	GATAA	2	10	1084652	1084661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015856	CGCCT	2	10	1087912	1087921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015856	AATTT	2	10	1088146	1088155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015856	GTTCC	2	10	1134981	1134990	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015856	GACAA	2	10	1142568	1142577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015856	GCCGA	2	10	1145897	1145906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015856	GGCTA	2	10	1165107	1165116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015856	TCAAA	2	10	1165264	1165273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015856	ATCAT	2	10	1192793	1192802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015856	TTTGC	2	10	1193963	1193972	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015856	GCGCT	2	10	1243574	1243583	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015856	CGCTG	2	10	1249387	1249396	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015856	CGAGG	2	10	1269818	1269827	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015856	AGCGG	2	10	1276567	1276576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015856	TGCTT	2	10	1276826	1276835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015856	GTAAT	2	10	1280901	1280910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015856	AACAA	2	10	1294750	1294759	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015856	GTGTC	2	10	1335170	1335179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015856	GACAC	2	10	1335319	1335328	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015856	CGTTG	2	10	1343058	1343067	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015856	CCGGA	2	10	1346025	1346034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015856	CCCAG	2	10	1350038	1350047	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_015856	GGGTG	2	10	1350344	1350353	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015856	CGTAA	2	10	1362818	1362827	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015856	TGGCT	2	10	1363368	1363377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015856	GTAAA	2	10	1366005	1366014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015856	GCAGC	2	10	1376106	1376115	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015856	TGCAA	2	10	1392593	1392602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015856	GCTTT	2	10	1402864	1402873	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015856	CGCGG	2	10	1406399	1406408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015856	ACCAA	2	10	1408396	1408405	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015856	GGGCG	2	10	1443290	1443299	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015856	ATTGC	2	10	1446507	1446516	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015856	TGCTG	2	10	1446787	1446796	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015856	GGGCG	2	10	1463687	1463696	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015856	GCCTT	2	10	1473203	1473212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015856	TTTTG	2	10	1489267	1489276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015856	TAGTG	2	10	1502867	1502876	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015856	ACACT	2	10	1503020	1503029	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015856	ATGCG	2	10	1526192	1526201	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015856	TCTTT	2	10	1526353	1526362	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015856	ACATA	2	10	1565306	1565315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015856	TTTAT	2	10	1570222	1570231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015856	CCAAG	2	10	1572221	1572230	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015856	TTTCA	2	10	1586337	1586346	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015856	CAAAA	2	10	1610321	1610330	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015856	TGGGG	2	10	1662192	1662201	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015856	AGATT	2	10	1668798	1668807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015856	AGATG	2	10	1668886	1668895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015856	ACAGA	2	10	1676263	1676272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_015856	CGCGG	2	10	1701188	1701197	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_015856	TTCCC	2	10	1723704	1723713	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
158	NC_015856	AATTG	2	10	1723887	1723896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015856	TGGAA	2	10	1738502	1738511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015856	GCAAT	2	10	1738967	1738976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015856	TCCAT	2	10	1739066	1739075	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015856	TTTGC	2	10	1739301	1739310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015856	CATCG	2	10	1739997	1740006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_015856	ATCTG	2	10	1743999	1744008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_015856	TAGGG	2	10	1744534	1744543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015856	ATGGA	2	10	1746137	1746146	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015856	CTAGC	2	10	1747880	1747889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_015856	GATCG	2	10	1762084	1762093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_015856	TGCCA	2	10	1778324	1778333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_015856	TAGTG	2	10	1795282	1795291	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015856	TTAAT	2	10	1798639	1798648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_015856	CGTTG	2	10	1832582	1832591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_015856	GATTT	2	10	1835947	1835956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015856	GTTAG	2	10	1887003	1887012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_015856	AACTG	2	10	1952103	1952112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_015856	GTATA	2	10	1952117	1952126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015856	CGCTG	2	10	1954561	1954570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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219	NC_015856	GTTAC	2	10	2197663	2197672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_015856	GCCAA	2	10	2687213	2687222	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_015856	TGTCC	2	10	2723171	2723180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_015856	TGCGG	2	10	2791195	2791204	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_015856	TCTGG	2	10	2866521	2866530	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
273	NC_015856	TTCTT	2	10	2896626	2896635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_015856	CGCCT	2	10	2922842	2922851	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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279	NC_015856	ATTTT	2	10	2943932	2943941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_015856	CTATT	2	10	2960509	2960518	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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464	NC_015856	CCTGC	2	10	4474053	4474062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
465	NC_015856	AAAAG	2	10	4481039	4481048	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015856	TCAAA	2	10	4481229	4481238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_015856	AGGCG	2	10	4496078	4496087	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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