MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 1893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015856	AGCA	2	8	1683	1690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015856	CGCT	2	8	13964	13971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015856	AGCG	2	8	14108	14115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015856	GAAC	2	8	14535	14542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015856	TCCT	2	8	14672	14679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015856	TCTT	2	8	14996	15003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015856	TTAT	2	8	15420	15427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015856	AGCC	2	8	15570	15577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015856	AGCT	2	8	15624	15631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015856	GTAA	2	8	16225	16232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015856	CAAT	2	8	16253	16260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015856	CAGA	2	8	18250	18257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015856	ATGT	2	8	18291	18298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015856	GATG	2	8	19735	19742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015856	AAGC	2	8	19777	19784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015856	CGTT	2	8	19977	19984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015856	TGTT	2	8	22017	22024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015856	TTTG	2	8	23594	23601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015856	TCCA	2	8	25407	25414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015856	GGAT	2	8	25470	25477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015856	TTGA	2	8	26149	26156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015856	AGCA	2	8	29101	29108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015856	ATGC	2	8	29145	29152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015856	GGCG	2	8	29214	29221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015856	GTCT	2	8	32333	32340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015856	AGGC	2	8	32478	32485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015856	ATTG	2	8	32534	32541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015856	TATC	2	8	37286	37293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015856	GCAA	2	8	37471	37478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015856	GCGG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015856	ATAA	2	8	42918	42925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015856	CTTT	2	8	42943	42950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015856	ATCC	2	8	43022	43029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015856	CAAG	2	8	43065	43072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015856	GATT	2	8	49335	49342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015856	GGGC	2	8	50589	50596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015856	GAGT	2	8	50770	50777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015856	CAAT	2	8	53225	53232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015856	ATAG	2	8	61507	61514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015856	ATGC	2	8	61549	61556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015856	TATT	2	8	74061	74068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015856	CCGT	2	8	74086	74093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015856	TGCA	2	8	74915	74922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015856	AATC	2	8	83398	83405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015856	GCCG	2	8	91199	91206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015856	CATG	2	8	103823	103830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015856	TGGC	2	8	117438	117445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015856	GCCC	2	8	117506	117513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_015856	TTTC	2	8	118510	118517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015856	TACG	2	8	118645	118652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015856	TGGG	2	8	118728	118735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015856	TATT	2	8	118953	118960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015856	TCCA	2	8	119135	119142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015856	CATT	2	8	119615	119622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015856	TCAG	2	8	120279	120286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015856	ACAG	2	8	122546	122553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015856	TGCA	2	8	129750	129757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015856	TGGA	2	8	130266	130273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015856	CTGG	2	8	130642	130649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015856	TTCT	2	8	131961	131968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015856	TAGA	2	8	132086	132093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015856	TCTT	2	8	132116	132123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015856	GCCG	2	8	132428	132435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015856	ATAA	2	8	133242	133249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015856	TTCT	2	8	138023	138030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015856	CATT	2	8	138063	138070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015856	GATG	2	8	140556	140563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015856	GTTG	2	8	149533	149540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015856	ATTT	3	12	163589	163600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015856	AGGC	2	8	163679	163686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015856	CCGG	2	8	166244	166251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015856	TTCG	2	8	168556	168563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015856	TCTT	2	8	173973	173980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015856	GATT	2	8	174135	174142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015856	TTGT	2	8	175869	175876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015856	AGCC	2	8	184283	184290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015856	GGAA	2	8	184330	184337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015856	GCGG	2	8	193409	193416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015856	CATC	2	8	208799	208806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015856	AGGA	2	8	212900	212907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015856	CTGC	2	8	219490	219497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015856	CGAT	2	8	222386	222393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015856	ATGG	2	8	229532	229539	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015856	TAAT	2	8	231685	231692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015856	GCAA	2	8	239622	239629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015856	GAAA	2	8	241939	241946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015856	AATC	2	8	243349	243356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015856	CCGG	2	8	244432	244439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015856	CATG	2	8	247193	247200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015856	TCGG	2	8	249200	249207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015856	CTGG	2	8	249397	249404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015856	ACCA	2	8	249458	249465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015856	CAAT	2	8	260094	260101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015856	GCAT	2	8	264329	264336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015856	TATT	2	8	266962	266969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015856	AGGA	2	8	267103	267110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015856	GGTC	2	8	272914	272921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015856	GTAT	2	8	273589	273596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015856	GGAA	2	8	276347	276354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015856	ACCT	2	8	276445	276452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015856	CAAA	2	8	276934	276941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015856	CCAA	2	8	277367	277374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015856	GCAA	2	8	277505	277512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015856	GCAA	2	8	278205	278212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015856	CGGG	2	8	278811	278818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015856	AAAC	2	8	278826	278833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015856	GCAA	2	8	279121	279128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015856	AGCC	2	8	279301	279308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015856	GCTT	2	8	279636	279643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015856	TATT	2	8	279669	279676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015856	AATA	2	8	279896	279903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015856	TATT	2	8	280384	280391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015856	GAAT	2	8	280623	280630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015856	GGCA	2	8	280707	280714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015856	GACA	2	8	281095	281102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015856	GAAC	2	8	281327	281334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015856	CTTG	2	8	281635	281642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015856	TTTG	2	8	283754	283761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015856	CCGA	2	8	283840	283847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015856	CTTG	2	8	284273	284280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015856	CGGC	2	8	285342	285349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015856	ATTG	2	8	285659	285666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015856	CGTT	2	8	285989	285996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015856	GGCA	2	8	286223	286230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015856	CACG	2	8	286277	286284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015856	TGCT	2	8	286573	286580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015856	AGAA	2	8	287037	287044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015856	CATT	2	8	287308	287315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015856	CTGG	2	8	287479	287486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015856	TACA	2	8	288037	288044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015856	TTTA	2	8	288050	288057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015856	TTCC	2	8	288363	288370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015856	TTTA	2	8	288454	288461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015856	GGCC	2	8	298295	298302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015856	CAGA	2	8	301493	301500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015856	AGCC	2	8	304608	304615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015856	AATT	2	8	305564	305571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015856	AATT	2	8	305578	305585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015856	TAAT	2	8	305598	305605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015856	TAAT	2	8	305634	305641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015856	GCAA	2	8	308753	308760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015856	CTGG	2	8	311037	311044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015856	GCTT	2	8	311148	311155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015856	CAGC	2	8	328381	328388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015856	AAAT	2	8	333953	333960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015856	TGGA	2	8	346407	346414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015856	ATGG	2	8	347703	347710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015856	GGAA	2	8	355219	355226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015856	CAGT	2	8	355238	355245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015856	GCCG	2	8	355289	355296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015856	GCCT	2	8	355311	355318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_015856	TTTG	2	8	390317	390324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_015856	GCCC	2	8	1242992	1242999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_015856	TGGA	2	8	1243452	1243459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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