MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 80675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015856	GCT	2	6	20	25	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
2	NC_015856	CAA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785198
3	NC_015856	GTG	2	6	217	222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785198
4	NC_015856	TAA	2	6	285	290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785198
5	NC_015856	GTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
6	NC_015856	CGG	3	9	327	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
7	NC_015856	AAT	2	6	502	507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785198
8	NC_015856	GCT	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
9	NC_015856	CGA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
10	NC_015856	CTA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785198
11	NC_015856	TGC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
12	NC_015856	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
13	NC_015856	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785198
14	NC_015856	GGC	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
15	NC_015856	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785198
16	NC_015856	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785198
17	NC_015856	TGC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
18	NC_015856	ATC	3	9	817	825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785198
19	NC_015856	GCC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785198
20	NC_015856	CGA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785198
21	NC_015856	CTG	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785198
22	NC_015856	AGA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785198
23	NC_015856	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785198
24	NC_015856	CAC	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785198
25	NC_015856	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
26	NC_015856	CAC	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
27	NC_015856	CCA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
28	NC_015856	CGC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
29	NC_015856	GCT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
30	NC_015856	CAA	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
31	NC_015856	GCC	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
32	NC_015856	GAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
33	NC_015856	TAC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
34	NC_015856	CTG	3	9	2203	2211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
35	NC_015856	TCA	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
36	NC_015856	CAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
37	NC_015856	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
38	NC_015856	GAA	2	6	2353	2358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
39	NC_015856	CGA	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785199
40	NC_015856	CAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
41	NC_015856	GTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785199
42	NC_015856	GCT	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785199
43	NC_015856	CGC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785199
44	NC_015856	CAT	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785199
45	NC_015856	CCA	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785199
46	NC_015856	GAA	2	6	2641	2646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785199
47	NC_015856	CGG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785199
48	NC_015856	CAA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785199
49	NC_015856	TTC	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785199
50	NC_015856	GTA	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785199
51	NC_015856	TCA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
52	NC_015856	ACA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
53	NC_015856	CAC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
54	NC_015856	CGA	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
55	NC_015856	CGA	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
56	NC_015856	CGG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
57	NC_015856	CGG	2	6	3418	3423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
58	NC_015856	GCT	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
59	NC_015856	CCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
60	NC_015856	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
61	NC_015856	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
62	NC_015856	CAA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
63	NC_015856	AGA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
64	NC_015856	GGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
65	NC_015856	CAA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
66	NC_015856	CGA	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
67	NC_015856	ACG	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
68	NC_015856	CAA	2	6	3925	3930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
69	NC_015856	CGG	2	6	3946	3951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
70	NC_015856	GAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
71	NC_015856	GCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785200
72	NC_015856	AGA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
73	NC_015856	TCG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
74	NC_015856	ACG	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
75	NC_015856	ATC	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
76	NC_015856	TCG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
77	NC_015856	GCC	2	6	4247	4252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
78	NC_015856	CGC	2	6	4264	4269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
79	NC_015856	CGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
80	NC_015856	TCG	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
81	NC_015856	GTC	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
82	NC_015856	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
83	NC_015856	CGA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
84	NC_015856	ACC	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
85	NC_015856	CAT	4	12	4591	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
86	NC_015856	CTG	3	9	4640	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
87	NC_015856	CCG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
88	NC_015856	GAC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
89	NC_015856	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785200
90	NC_015856	ATG	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785200
91	NC_015856	ACG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
92	NC_015856	ACA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785200
93	NC_015856	CAT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
94	NC_015856	GCC	2	6	4925	4930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
95	NC_015856	CAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
96	NC_015856	GTC	3	9	5036	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
97	NC_015856	CGA	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
98	NC_015856	TCG	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
99	NC_015856	CGC	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
100	NC_015856	CCG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785200
101	NC_015856	CAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785200
102	NC_015856	CCA	2	6	5260	5265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785200
103	NC_015856	CGA	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785200
104	NC_015856	GTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785200
105	NC_015856	TGC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785200
106	NC_015856	GAT	2	6	5450	5455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785200
107	NC_015856	TGT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340785201
108	NC_015856	TCA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
109	NC_015856	AAG	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785201
110	NC_015856	GCA	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
111	NC_015856	CGT	2	6	6208	6213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
112	NC_015856	TCA	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
113	NC_015856	TCT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785201
114	NC_015856	CAA	2	6	6246	6251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785201
115	NC_015856	ACG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
116	NC_015856	CGC	2	6	6272	6277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785201
117	NC_015856	ATG	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785201
118	NC_015856	GAA	3	9	6343	6351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785201
119	NC_015856	CTG	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
120	NC_015856	CGC	2	6	6390	6395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785201
121	NC_015856	TGC	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
122	NC_015856	ACA	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785201
123	NC_015856	TCA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
124	NC_015856	CAA	2	6	6459	6464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340785201
125	NC_015856	CGA	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
126	NC_015856	CTT	2	6	6525	6530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785201
127	NC_015856	CAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
128	NC_015856	CTA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
129	NC_015856	TGA	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785201
130	NC_015856	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
131	NC_015856	CTA	2	6	6696	6701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
132	NC_015856	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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134	NC_015856	GTG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785201
135	NC_015856	ACG	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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138	NC_015856	TAC	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785201
139	NC_015856	GCA	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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141	NC_015856	TGC	2	6	7533	7538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
142	NC_015856	GCG	2	6	7570	7575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785201
143	NC_015856	ACG	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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145	NC_015856	CTG	2	6	7741	7746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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151	NC_015856	CAG	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
152	NC_015856	GCT	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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155	NC_015856	GAA	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785201
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160	NC_015856	CAG	2	6	8623	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
161	NC_015856	CGA	2	6	8631	8636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
162	NC_015856	TGC	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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165	NC_015856	GCA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785201
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237	NC_015856	TAG	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785204
238	NC_015856	CAG	2	6	13429	13434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785204
239	NC_015856	CAG	2	6	13443	13448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785204
240	NC_015856	CAC	2	6	13462	13467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785204
241	NC_015856	CGC	2	6	13500	13505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785204
242	NC_015856	TAG	2	6	13513	13518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785204
243	NC_015856	AAG	2	6	13558	13563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785204
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245	NC_015856	CAC	2	6	16553	16558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785205
246	NC_015856	ATG	2	6	16611	16616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785205
247	NC_015856	AGG	2	6	16685	16690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340785205
248	NC_015856	GGA	2	6	16787	16792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340785205
249	NC_015856	TTC	2	6	17000	17005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785205
250	NC_015856	ACC	2	6	17016	17021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785205
251	NC_015856	CTT	2	6	17053	17058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785205
252	NC_015856	AGG	2	6	17067	17072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340785205
253	NC_015856	CTG	2	6	17161	17166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785205
254	NC_015856	ATA	2	6	17175	17180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785205
255	NC_015856	TGA	2	6	17218	17223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785205
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259	NC_015856	TAA	2	6	17526	17531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340785205
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