MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 plasmid pLAtc3

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015854	GC	3	6	471	476	0 %	0 %	50 %	50 %	340783893
2	NC_015854	GC	3	6	1838	1843	0 %	0 %	50 %	50 %	340783893
3	NC_015854	GC	3	6	2384	2389	0 %	0 %	50 %	50 %	340783893
4	NC_015854	TG	3	6	2503	2508	0 %	50 %	50 %	0 %	340783893
5	NC_015854	CG	3	6	3498	3503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015854	CG	3	6	4367	4372	0 %	0 %	50 %	50 %	340783894
7	NC_015854	GC	3	6	5035	5040	0 %	0 %	50 %	50 %	340783894
8	NC_015854	TG	3	6	6156	6161	0 %	50 %	50 %	0 %	340783895
9	NC_015854	GT	3	6	6230	6235	0 %	50 %	50 %	0 %	340783895
10	NC_015854	GC	3	6	7167	7172	0 %	0 %	50 %	50 %	340783896
11	NC_015854	GT	3	6	7209	7214	0 %	50 %	50 %	0 %	340783896
12	NC_015854	GC	3	6	7323	7328	0 %	0 %	50 %	50 %	340783896
13	NC_015854	GC	3	6	7450	7455	0 %	0 %	50 %	50 %	340783896
14	NC_015854	CG	3	6	7760	7765	0 %	0 %	50 %	50 %	340783896
15	NC_015854	GC	4	8	8821	8828	0 %	0 %	50 %	50 %	340783897
16	NC_015854	CG	3	6	8990	8995	0 %	0 %	50 %	50 %	340783897
17	NC_015854	GC	3	6	9671	9676	0 %	0 %	50 %	50 %	340783897
18	NC_015854	GC	3	6	10575	10580	0 %	0 %	50 %	50 %	340783898
19	NC_015854	GT	3	6	13392	13397	0 %	50 %	50 %	0 %	340783903
20	NC_015854	GC	3	6	14046	14051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015854	GC	3	6	15293	15298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015854	CG	3	6	15326	15331	0 %	0 %	50 %	50 %	340783906
23	NC_015854	GC	3	6	15433	15438	0 %	0 %	50 %	50 %	340783906
24	NC_015854	CG	3	6	16299	16304	0 %	0 %	50 %	50 %	340783906
25	NC_015854	CT	3	6	16557	16562	0 %	50 %	0 %	50 %	340783906
26	NC_015854	CT	3	6	18005	18010	0 %	50 %	0 %	50 %	340783906
27	NC_015854	GA	3	6	18794	18799	50 %	0 %	50 %	0 %	340783908
28	NC_015854	TA	3	6	19048	19053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015854	GA	3	6	19218	19223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015854	GA	3	6	21541	21546	50 %	0 %	50 %	0 %	340783910
31	NC_015854	AG	3	6	22127	22132	50 %	0 %	50 %	0 %	340783912
32	NC_015854	CG	3	6	23389	23394	0 %	0 %	50 %	50 %	340783913
33	NC_015854	CG	3	6	23767	23772	0 %	0 %	50 %	50 %	340783913
34	NC_015854	GA	3	6	24681	24686	50 %	0 %	50 %	0 %	340783916
35	NC_015854	GC	3	6	24717	24722	0 %	0 %	50 %	50 %	340783916
36	NC_015854	CA	3	6	25042	25047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015854	AT	3	6	26033	26038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015854	TA	3	6	26052	26057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015854	GC	3	6	26448	26453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015854	TC	3	6	26456	26461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015854	GC	3	6	27222	27227	0 %	0 %	50 %	50 %	340783919
42	NC_015854	GC	3	6	27844	27849	0 %	0 %	50 %	50 %	340783919

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.