MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 plasmid pLAtc2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015853	ATCC	2	8	1683	1690	25 %	25 %	0 %	50 %	340783924
2	NC_015853	CAGG	2	8	1758	1765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015853	TGGT	2	8	1769	1776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015853	AAAG	2	8	2233	2240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015853	CTGG	2	8	2410	2417	0 %	25 %	50 %	25 %	340783925
6	NC_015853	GCGG	2	8	2437	2444	0 %	0 %	75 %	25 %	340783925
7	NC_015853	CGAT	2	8	3196	3203	25 %	25 %	25 %	25 %	340783926
8	NC_015853	CCTG	2	8	3590	3597	0 %	25 %	25 %	50 %	340783927
9	NC_015853	CCGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	50 %	50 %	340783927
10	NC_015853	AGCC	2	8	4388	4395	25 %	0 %	25 %	50 %	340783927
11	NC_015853	TCTT	2	8	5107	5114	0 %	75 %	0 %	25 %	340783927
12	NC_015853	GAGC	2	8	5178	5185	25 %	0 %	50 %	25 %	340783927
13	NC_015853	GTGG	2	8	5267	5274	0 %	25 %	75 %	0 %	340783927
14	NC_015853	GCGG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	75 %	25 %	340783927
15	NC_015853	GATG	2	8	5335	5342	25 %	25 %	50 %	0 %	340783927
16	NC_015853	GCGG	2	8	5810	5817	0 %	0 %	75 %	25 %	340783927
17	NC_015853	ACAA	2	8	6194	6201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015853	GGTA	2	8	6452	6459	25 %	25 %	50 %	0 %	340783928
19	NC_015853	CCTG	2	8	7018	7025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015853	GGTA	2	8	7163	7170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015853	AATA	2	8	7832	7839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015853	TCTA	2	8	8151	8158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015853	CCTG	2	8	8368	8375	0 %	25 %	25 %	50 %	340783930
24	NC_015853	TGCT	2	8	9190	9197	0 %	50 %	25 %	25 %	340783930
25	NC_015853	ACCG	2	8	10029	10036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015853	TGAT	2	8	10390	10397	25 %	50 %	25 %	0 %	340783931
27	NC_015853	AAAG	2	8	11458	11465	75 %	0 %	25 %	0 %	340783933
28	NC_015853	GTGG	2	8	11518	11525	0 %	25 %	75 %	0 %	340783933
29	NC_015853	GGCT	2	8	12006	12013	0 %	25 %	50 %	25 %	340783934
30	NC_015853	ATGC	2	8	12211	12218	25 %	25 %	25 %	25 %	340783934
31	NC_015853	CCAA	2	8	13169	13176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015853	TGTT	2	8	13305	13312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.