MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 plasmid pLAtc2

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015853	ATCC	2	8	1683	1690	25 %	25 %	0 %	50 %	340783924
2	NC_015853	CTGG	2	8	2410	2417	0 %	25 %	50 %	25 %	340783925
3	NC_015853	GCGG	2	8	2437	2444	0 %	0 %	75 %	25 %	340783925
4	NC_015853	CGAT	2	8	3196	3203	25 %	25 %	25 %	25 %	340783926
5	NC_015853	CCTG	2	8	3590	3597	0 %	25 %	25 %	50 %	340783927
6	NC_015853	CCGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	50 %	50 %	340783927
7	NC_015853	AGCC	2	8	4388	4395	25 %	0 %	25 %	50 %	340783927
8	NC_015853	TCTT	2	8	5107	5114	0 %	75 %	0 %	25 %	340783927
9	NC_015853	GAGC	2	8	5178	5185	25 %	0 %	50 %	25 %	340783927
10	NC_015853	GTGG	2	8	5267	5274	0 %	25 %	75 %	0 %	340783927
11	NC_015853	GCGG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	75 %	25 %	340783927
12	NC_015853	GATG	2	8	5335	5342	25 %	25 %	50 %	0 %	340783927
13	NC_015853	GCGG	2	8	5810	5817	0 %	0 %	75 %	25 %	340783927
14	NC_015853	GGTA	2	8	6452	6459	25 %	25 %	50 %	0 %	340783928
15	NC_015853	CCTG	2	8	8368	8375	0 %	25 %	25 %	50 %	340783930
16	NC_015853	TGCT	2	8	9190	9197	0 %	50 %	25 %	25 %	340783930
17	NC_015853	TGAT	2	8	10390	10397	25 %	50 %	25 %	0 %	340783931
18	NC_015853	AAAG	2	8	11458	11465	75 %	0 %	25 %	0 %	340783933
19	NC_015853	GTGG	2	8	11518	11525	0 %	25 %	75 %	0 %	340783933
20	NC_015853	GGCT	2	8	12006	12013	0 %	25 %	50 %	25 %	340783934
21	NC_015853	ATGC	2	8	12211	12218	25 %	25 %	25 %	25 %	340783934

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.