MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 plasmid pLAtc2

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015853	GT	3	6	1425	1430	0 %	50 %	50 %	0 %	340783924
2	NC_015853	GC	3	6	2079	2084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015853	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	340783926
4	NC_015853	GC	3	6	3328	3333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015853	CG	3	6	3361	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015853	CG	3	6	3467	3472	0 %	0 %	50 %	50 %	340783927
7	NC_015853	GT	3	6	4031	4036	0 %	50 %	50 %	0 %	340783927
8	NC_015853	CG	3	6	4334	4339	0 %	0 %	50 %	50 %	340783927
9	NC_015853	CT	3	6	4592	4597	0 %	50 %	0 %	50 %	340783927
10	NC_015853	CA	3	6	6386	6391	50 %	0 %	0 %	50 %	340783928
11	NC_015853	AT	3	6	6951	6956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015853	AT	3	6	6971	6976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015853	AT	3	6	7956	7961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015853	AT	3	6	8069	8074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015853	AG	3	6	10656	10661	50 %	0 %	50 %	0 %	340783931
16	NC_015853	GC	3	6	10899	10904	0 %	0 %	50 %	50 %	340783932
17	NC_015853	CG	3	6	11444	11449	0 %	0 %	50 %	50 %	340783932
18	NC_015853	AG	3	6	11584	11589	50 %	0 %	50 %	0 %	340783933
19	NC_015853	CT	3	6	12429	12434	0 %	50 %	0 %	50 %	340783934
20	NC_015853	GT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	50 %	0 %	340783934
21	NC_015853	AG	4	8	13182	13189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015853	TG	3	6	13249	13254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015853	GA	3	6	13281	13286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015853	CT	3	6	13382	13387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015853	GT	3	6	13525	13530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015853	GT	3	6	13574	13579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.