MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	GTGAC	2	10	71	80	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015851	GGTCG	2	10	1166	1175	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015851	TGTTA	2	10	19416	19425	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015851	GCGCG	2	10	28134	28143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015851	GGGAT	2	10	32753	32762	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015851	GCATC	2	10	33355	33364	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015851	CAGAG	2	10	35293	35302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015851	CGGCC	2	10	39429	39438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015851	TTTCC	2	10	51778	51787	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015851	CGGGC	2	10	53966	53975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015851	CTGGC	2	10	58830	58839	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015851	TGCCA	2	10	59938	59947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015851	CCCCA	2	10	60101	60110	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_015851	CGACG	2	10	70051	70060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015851	CCCTG	2	10	99242	99251	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_015851	TTTAT	2	10	108731	108740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015851	CGCTG	2	10	117156	117165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015851	AGCAT	2	10	123426	123435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015851	CCCTC	2	10	124337	124346	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_015851	AGCGC	2	10	125574	125583	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015851	GTGAT	2	10	142926	142935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015851	TTTTA	2	10	171850	171859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015851	TGCCT	2	10	185090	185099	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015851	TGGTA	2	10	189144	189153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015851	ATCCG	2	10	196915	196924	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015851	GAACC	2	10	206744	206753	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015851	AGGCA	2	10	215049	215058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015851	TTTTC	2	10	223963	223972	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015851	CACCG	2	10	238256	238265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015851	ATTAT	2	10	238496	238505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.