MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	ATGG	2	8	559	566	25 %	25 %	50 %	0 %	340783626
2	NC_015851	GTTG	2	8	1378	1385	0 %	50 %	50 %	0 %	340783627
3	NC_015851	TGCC	2	8	1480	1487	0 %	25 %	25 %	50 %	340783627
4	NC_015851	AAAG	2	8	1736	1743	75 %	0 %	25 %	0 %	340783628
5	NC_015851	GCCT	2	8	2567	2574	0 %	25 %	25 %	50 %	340783629
6	NC_015851	TTTC	2	8	2645	2652	0 %	75 %	0 %	25 %	340783629
7	NC_015851	CTAT	2	8	3204	3211	25 %	50 %	0 %	25 %	340783629
8	NC_015851	TTGC	2	8	3238	3245	0 %	50 %	25 %	25 %	340783629
9	NC_015851	GAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	50 %	25 %	340783630
10	NC_015851	GCGG	2	8	4838	4845	0 %	0 %	75 %	25 %	340783630
11	NC_015851	AGAA	2	8	5092	5099	75 %	0 %	25 %	0 %	340783631
12	NC_015851	ATAG	2	8	6373	6380	50 %	25 %	25 %	0 %	340783632
13	NC_015851	TATC	2	8	6448	6455	25 %	50 %	0 %	25 %	340783632
14	NC_015851	ACGA	2	8	7229	7236	50 %	0 %	25 %	25 %	340783633
15	NC_015851	AGGA	2	8	7660	7667	50 %	0 %	50 %	0 %	340783634
16	NC_015851	CGCC	2	8	8893	8900	0 %	0 %	25 %	75 %	340783634
17	NC_015851	TGCC	2	8	9382	9389	0 %	25 %	25 %	50 %	340783635
18	NC_015851	AGAA	2	8	9415	9422	75 %	0 %	25 %	0 %	340783635
19	NC_015851	GCCA	2	8	9868	9875	25 %	0 %	25 %	50 %	340783636
20	NC_015851	ACGA	2	8	10256	10263	50 %	0 %	25 %	25 %	340783637
21	NC_015851	CTGG	2	8	11071	11078	0 %	25 %	50 %	25 %	340783638
22	NC_015851	CGTC	2	8	11222	11229	0 %	25 %	25 %	50 %	340783638
23	NC_015851	TGGC	2	8	12076	12083	0 %	25 %	50 %	25 %	340783639
24	NC_015851	CCCA	2	8	12606	12613	25 %	0 %	0 %	75 %	340783639
25	NC_015851	CTGC	2	8	12722	12729	0 %	25 %	25 %	50 %	340783639
26	NC_015851	TCCG	2	8	12882	12889	0 %	25 %	25 %	50 %	340783639
27	NC_015851	ATTC	2	8	13444	13451	25 %	50 %	0 %	25 %	340783640
28	NC_015851	CCAA	2	8	14339	14346	50 %	0 %	0 %	50 %	340783641
29	NC_015851	GCGA	2	8	15453	15460	25 %	0 %	50 %	25 %	340783642
30	NC_015851	TTTG	2	8	16594	16601	0 %	75 %	25 %	0 %	340783643
31	NC_015851	CTAC	2	8	17190	17197	25 %	25 %	0 %	50 %	340783643
32	NC_015851	TGGC	2	8	17272	17279	0 %	25 %	50 %	25 %	340783643
33	NC_015851	CTTT	2	8	18222	18229	0 %	75 %	0 %	25 %	340783643
34	NC_015851	CCAC	2	8	18384	18391	25 %	0 %	0 %	75 %	340783644
35	NC_015851	CGGC	2	8	18394	18401	0 %	0 %	50 %	50 %	340783644
36	NC_015851	CATC	2	8	18476	18483	25 %	25 %	0 %	50 %	340783644
37	NC_015851	TGCG	2	8	18500	18507	0 %	25 %	50 %	25 %	340783644
38	NC_015851	TGCT	2	8	18792	18799	0 %	50 %	25 %	25 %	340783644
39	NC_015851	GGCA	2	8	19804	19811	25 %	0 %	50 %	25 %	340783645
40	NC_015851	TTGC	2	8	20043	20050	0 %	50 %	25 %	25 %	340783645
41	NC_015851	ACGT	2	8	20734	20741	25 %	25 %	25 %	25 %	340783645
42	NC_015851	ACCA	2	8	20763	20770	50 %	0 %	0 %	50 %	340783645
43	NC_015851	GGAT	2	8	20860	20867	25 %	25 %	50 %	0 %	340783645
44	NC_015851	GCAG	2	8	20999	21006	25 %	0 %	50 %	25 %	340783645
45	NC_015851	TGCT	2	8	21011	21018	0 %	50 %	25 %	25 %	340783645
46	NC_015851	AGCA	2	8	21025	21032	50 %	0 %	25 %	25 %	340783645
47	NC_015851	TTGG	2	8	21688	21695	0 %	50 %	50 %	0 %	340783645
48	NC_015851	AAGG	2	8	21723	21730	50 %	0 %	50 %	0 %	340783645
49	NC_015851	ATGG	2	8	21864	21871	25 %	25 %	50 %	0 %	340783645
50	NC_015851	GCCC	2	8	21872	21879	0 %	0 %	25 %	75 %	340783645
51	NC_015851	GCTG	2	8	22556	22563	0 %	25 %	50 %	25 %	340783647
52	NC_015851	GGAG	2	8	22629	22636	25 %	0 %	75 %	0 %	340783647
53	NC_015851	CTGG	2	8	23538	23545	0 %	25 %	50 %	25 %	340783648
54	NC_015851	AGGC	2	8	24269	24276	25 %	0 %	50 %	25 %	340783649
55	NC_015851	AGAC	2	8	24341	24348	50 %	0 %	25 %	25 %	340783649
56	NC_015851	GCCT	2	8	25813	25820	0 %	25 %	25 %	50 %	340783650
57	NC_015851	ACGG	2	8	26163	26170	25 %	0 %	50 %	25 %	340783652
58	NC_015851	GTTG	2	8	26298	26305	0 %	50 %	50 %	0 %	340783652
59	NC_015851	AATC	2	8	26400	26407	50 %	25 %	0 %	25 %	340783652
60	NC_015851	TTGG	2	8	26473	26480	0 %	50 %	50 %	0 %	340783652
61	NC_015851	GGAG	2	8	26587	26594	25 %	0 %	75 %	0 %	340783652
62	NC_015851	ACGG	2	8	26705	26712	25 %	0 %	50 %	25 %	340783652
63	NC_015851	TCAT	2	8	27346	27353	25 %	50 %	0 %	25 %	340783652
64	NC_015851	AAGG	2	8	28533	28540	50 %	0 %	50 %	0 %	340783654
65	NC_015851	GGCA	2	8	29493	29500	25 %	0 %	50 %	25 %	340783654
66	NC_015851	TGGG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	75 %	0 %	340783654
67	NC_015851	GTGC	2	8	29969	29976	0 %	25 %	50 %	25 %	340783654
68	NC_015851	ATAA	2	8	31044	31051	75 %	25 %	0 %	0 %	340783655
69	NC_015851	ACGA	2	8	31237	31244	50 %	0 %	25 %	25 %	340783656
70	NC_015851	GGGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	75 %	25 %	340783656
71	NC_015851	ATTC	2	8	31851	31858	25 %	50 %	0 %	25 %	340783656
72	NC_015851	CTGC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	25 %	50 %	340783656
73	NC_015851	GTGC	2	8	32086	32093	0 %	25 %	50 %	25 %	340783656
74	NC_015851	AACC	2	8	33148	33155	50 %	0 %	0 %	50 %	340783657
75	NC_015851	CCCG	2	8	33187	33194	0 %	0 %	25 %	75 %	340783657
76	NC_015851	GATG	2	8	33879	33886	25 %	25 %	50 %	0 %	340783658
77	NC_015851	AGGA	2	8	34517	34524	50 %	0 %	50 %	0 %	340783659
78	NC_015851	GCGG	2	8	36084	36091	0 %	0 %	75 %	25 %	340783661
79	NC_015851	CGGG	2	8	38449	38456	0 %	0 %	75 %	25 %	340783666
80	NC_015851	GATC	2	8	38458	38465	25 %	25 %	25 %	25 %	340783666
81	NC_015851	CCAG	2	8	38844	38851	25 %	0 %	25 %	50 %	340783667
82	NC_015851	CCAA	2	8	39151	39158	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
83	NC_015851	GCAG	2	8	39310	39317	25 %	0 %	50 %	25 %	340783668
84	NC_015851	TTGG	2	8	39396	39403	0 %	50 %	50 %	0 %	340783668
85	NC_015851	GCCA	2	8	40069	40076	25 %	0 %	25 %	50 %	340783670
86	NC_015851	CCAA	2	8	40727	40734	50 %	0 %	0 %	50 %	340783670
87	NC_015851	GGCG	2	8	41006	41013	0 %	0 %	75 %	25 %	340783671
88	NC_015851	CCTC	2	8	41448	41455	0 %	25 %	0 %	75 %	340783671
89	NC_015851	TCGA	2	8	41655	41662	25 %	25 %	25 %	25 %	340783671
90	NC_015851	TCTG	2	8	41686	41693	0 %	50 %	25 %	25 %	340783671
91	NC_015851	CGCC	2	8	42091	42098	0 %	0 %	25 %	75 %	340783671
92	NC_015851	CACG	2	8	42145	42152	25 %	0 %	25 %	50 %	340783671
93	NC_015851	CGGC	2	8	42198	42205	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
94	NC_015851	GCTG	2	8	42778	42785	0 %	25 %	50 %	25 %	340783672
95	NC_015851	GGTT	2	8	43071	43078	0 %	50 %	50 %	0 %	340783672
96	NC_015851	GCGG	2	8	43103	43110	0 %	0 %	75 %	25 %	340783672
97	NC_015851	GCGG	2	8	43590	43597	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
98	NC_015851	TGCT	2	8	43769	43776	0 %	50 %	25 %	25 %	340783673
99	NC_015851	TCCC	2	8	43874	43881	0 %	25 %	0 %	75 %	340783673
100	NC_015851	CGAG	2	8	44369	44376	25 %	0 %	50 %	25 %	340783673
101	NC_015851	GGAT	2	8	44698	44705	25 %	25 %	50 %	0 %	340783673
102	NC_015851	GCGA	2	8	44857	44864	25 %	0 %	50 %	25 %	340783673
103	NC_015851	GCGG	2	8	45033	45040	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
104	NC_015851	CCGC	2	8	45122	45129	0 %	0 %	25 %	75 %	340783673
105	NC_015851	CGGG	2	8	45232	45239	0 %	0 %	75 %	25 %	340783673
106	NC_015851	CGCA	2	8	46518	46525	25 %	0 %	25 %	50 %	340783675
107	NC_015851	GCCG	2	8	46712	46719	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
108	NC_015851	CCGG	2	8	46919	46926	0 %	0 %	50 %	50 %	340783675
109	NC_015851	CAGC	2	8	47498	47505	25 %	0 %	25 %	50 %	340783675
110	NC_015851	GCGA	2	8	47975	47982	25 %	0 %	50 %	25 %	340783676
111	NC_015851	CCCA	2	8	48434	48441	25 %	0 %	0 %	75 %	340783676
112	NC_015851	TGCG	2	8	49242	49249	0 %	25 %	50 %	25 %	340783676
113	NC_015851	GCCG	2	8	49263	49270	0 %	0 %	50 %	50 %	340783676
114	NC_015851	CCTC	2	8	49521	49528	0 %	25 %	0 %	75 %	340783676
115	NC_015851	GATG	2	8	50441	50448	25 %	25 %	50 %	0 %	340783678
116	NC_015851	AGCA	2	8	51158	51165	50 %	0 %	25 %	25 %	340783679
117	NC_015851	AACC	2	8	51206	51213	50 %	0 %	0 %	50 %	340783679
118	NC_015851	ATAA	2	8	51627	51634	75 %	25 %	0 %	0 %	340783679
119	NC_015851	ACTG	2	8	51957	51964	25 %	25 %	25 %	25 %	340783680
120	NC_015851	TATC	2	8	52446	52453	25 %	50 %	0 %	25 %	340783681
121	NC_015851	CAGT	2	8	54743	54750	25 %	25 %	25 %	25 %	340783684
122	NC_015851	TACC	2	8	55403	55410	25 %	25 %	0 %	50 %	340783684
123	NC_015851	TGGC	2	8	55479	55486	0 %	25 %	50 %	25 %	340783684
124	NC_015851	CCAC	2	8	55636	55643	25 %	0 %	0 %	75 %	340783684
125	NC_015851	GACT	2	8	56011	56018	25 %	25 %	25 %	25 %	340783684
126	NC_015851	GCGA	2	8	56106	56113	25 %	0 %	50 %	25 %	340783684
127	NC_015851	CCTC	2	8	56650	56657	0 %	25 %	0 %	75 %	340783684
128	NC_015851	GTGC	2	8	56982	56989	0 %	25 %	50 %	25 %	340783684
129	NC_015851	GCAC	2	8	57909	57916	25 %	0 %	25 %	50 %	340783685
130	NC_015851	GATA	2	8	58284	58291	50 %	25 %	25 %	0 %	340783685
131	NC_015851	TGCA	2	8	59208	59215	25 %	25 %	25 %	25 %	340783686
132	NC_015851	CGTC	2	8	59253	59260	0 %	25 %	25 %	50 %	340783686
133	NC_015851	GGTA	2	8	59499	59506	25 %	25 %	50 %	0 %	340783687
134	NC_015851	ACCA	2	8	60696	60703	50 %	0 %	0 %	50 %	340783688
135	NC_015851	GCAT	2	8	61276	61283	25 %	25 %	25 %	25 %	340783688
136	NC_015851	CGCC	2	8	61584	61591	0 %	0 %	25 %	75 %	340783688
137	NC_015851	TGGC	2	8	62591	62598	0 %	25 %	50 %	25 %	340783688
138	NC_015851	GCCC	2	8	62745	62752	0 %	0 %	25 %	75 %	340783688
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