MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	GAA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015851	GTT	2	6	99	104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015851	GAG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015851	AAC	2	6	200	205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015851	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015851	TGC	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015851	CGT	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015851	ATT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015851	GGC	2	6	2442	2447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015851	TGG	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015851	GCA	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015851	TCA	2	6	7557	7562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015851	GTG	2	6	7579	7584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015851	GAG	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015851	TTA	2	6	9615	9620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015851	GTG	2	6	10904	10909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015851	CGC	2	6	13071	13076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015851	CCG	2	6	13245	13250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015851	ACT	2	6	14507	14512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015851	GAG	2	6	14612	14617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015851	GCC	2	6	14747	14752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015851	CCA	2	6	14755	14760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015851	ATG	2	6	14819	14824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015851	ACA	2	6	14835	14840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015851	ACA	2	6	14906	14911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015851	GTG	2	6	15769	15774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015851	CAC	2	6	15793	15798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015851	GTA	2	6	15807	15812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015851	GAA	2	6	15818	15823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015851	CAG	2	6	15987	15992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015851	ATT	2	6	18292	18297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015851	GTT	2	6	19529	19534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015851	TAA	2	6	19608	19613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015851	TTA	2	6	19634	19639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015851	AAG	2	6	22095	22100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015851	GAA	2	6	23401	23406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015851	GTT	2	6	23892	23897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015851	CCG	2	6	27916	27921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015851	GCT	2	6	27930	27935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015851	ATT	2	6	28056	28061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015851	TCG	2	6	28152	28157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015851	CGT	2	6	28239	28244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015851	GCA	2	6	28343	28348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015851	CGA	2	6	28431	28436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015851	GCA	2	6	31067	31072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015851	GGC	2	6	31137	31142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015851	CGG	2	6	32678	32683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015851	GTG	2	6	32715	32720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015851	GTT	2	6	32813	32818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015851	CTC	2	6	33331	33336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015851	CGC	2	6	33385	33390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015851	GCA	2	6	33404	33409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015851	CGC	2	6	33461	33466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015851	ACC	2	6	33480	33485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015851	TCG	2	6	33508	33513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015851	ACC	2	6	33542	33547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015851	GCC	2	6	33579	33584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015851	TAT	2	6	34047	34052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015851	CGG	2	6	34081	34086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015851	TAT	3	9	34135	34143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015851	GGC	3	9	35121	35129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015851	TGG	2	6	35318	35323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015851	CCT	2	6	35402	35407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015851	CTG	2	6	35632	35637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015851	CCT	2	6	36759	36764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015851	CCG	2	6	36833	36838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015851	CTG	2	6	37627	37632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015851	AAC	2	6	37678	37683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015851	CTG	2	6	37691	37696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015851	ACC	2	6	37747	37752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015851	CCT	2	6	37800	37805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015851	AGC	2	6	38338	38343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015851	GGA	2	6	38375	38380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015851	GGT	2	6	38393	38398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015851	GCG	2	6	39216	39221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015851	ACT	2	6	40895	40900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015851	GGA	2	6	42318	42323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015851	AGC	2	6	42349	42354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015851	TGC	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015851	GCT	2	6	43281	43286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015851	TGG	2	6	43315	43320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015851	CCG	2	6	45526	45531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015851	GCC	2	6	45575	45580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015851	TTC	2	6	45660	45665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015851	GCG	3	9	50696	50704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015851	CAA	2	6	50776	50781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015851	AGG	2	6	50784	50789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015851	TGC	2	6	52149	52154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015851	TGA	2	6	52179	52184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015851	TCT	2	6	52203	52208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015851	CAG	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015851	GTG	2	6	52268	52273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015851	GTC	2	6	52278	52283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015851	GCT	2	6	53690	53695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015851	CAT	2	6	53863	53868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015851	CGA	2	6	53915	53920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015851	GCC	2	6	54005	54010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015851	GCC	2	6	54046	54051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015851	TCA	2	6	54131	54136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015851	GCG	2	6	54137	54142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015851	TCG	2	6	54182	54187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015851	AGA	2	6	54190	54195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015851	CTC	2	6	54215	54220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015851	CAG	2	6	54309	54314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015851	CAA	2	6	54335	54340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015851	ACT	2	6	54493	54498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015851	GAT	2	6	54547	54552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015851	GGA	2	6	54570	54575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015851	GGT	2	6	57312	57317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015851	TCG	2	6	57424	57429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015851	TGC	2	6	57540	57545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015851	AGG	2	6	57581	57586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015851	GCA	2	6	58786	58791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015851	GCC	2	6	60162	60167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015851	GGC	2	6	60230	60235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015851	TGC	2	6	65962	65967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015851	ATT	2	6	66246	66251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015851	GGT	2	6	66705	66710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015851	CGA	2	6	66770	66775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015851	GAC	2	6	66796	66801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015851	CGT	2	6	66802	66807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015851	CTA	2	6	66910	66915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015851	TCC	2	6	66940	66945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015851	GAA	2	6	68279	68284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015851	TCT	2	6	68298	68303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015851	TAA	2	6	68304	68309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015851	CCG	2	6	68317	68322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015851	TGA	2	6	68356	68361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015851	TCC	2	6	68983	68988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015851	CCA	2	6	69141	69146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015851	GCG	2	6	69166	69171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015851	GAT	2	6	69235	69240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015851	CAT	2	6	69247	69252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015851	GAT	2	6	69369	69374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015851	GGC	2	6	69461	69466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015851	GGC	2	6	69501	69506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015851	GAG	2	6	69521	69526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015851	CCT	2	6	69530	69535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015851	TTA	2	6	69712	69717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015851	CAA	2	6	69743	69748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_015851	GGC	2	6	70025	70030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015851	GGA	2	6	70041	70046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_015851	TTC	2	6	219585	219590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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