MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	AG	3	6	2400	2405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015851	GC	4	8	13126	13133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015851	TC	4	8	13136	13143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015851	GA	3	6	13147	13152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015851	GC	3	6	14726	14731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015851	AC	3	6	15730	15735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015851	GA	3	6	15911	15916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015851	TG	3	6	19386	19391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015851	GC	3	6	28107	28112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015851	GC	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015851	AC	3	6	32392	32397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015851	AC	3	6	32832	32837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015851	TC	3	6	36869	36874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015851	CA	3	6	38399	38404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015851	CA	3	6	42305	42310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015851	AT	3	6	57819	57824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015851	TG	3	6	66445	66450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015851	CA	3	6	69546	69551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015851	AC	3	6	69558	69563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015851	TG	3	6	74691	74696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015851	AT	3	6	78037	78042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015851	GT	3	6	78205	78210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015851	AG	4	8	88355	88362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015851	TG	3	6	88524	88529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015851	AC	3	6	99039	99044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015851	GT	3	6	99253	99258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015851	TG	3	6	99361	99366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015851	TC	3	6	99589	99594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015851	AT	4	8	100377	100384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015851	GT	4	8	110844	110851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015851	GT	4	8	110954	110961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015851	GC	4	8	113672	113679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015851	TC	4	8	113682	113689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015851	GA	3	6	113693	113698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015851	TC	3	6	114968	114973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015851	TC	3	6	116586	116591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015851	GT	3	6	131262	131267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015851	GC	3	6	142878	142883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015851	CG	3	6	142994	142999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015851	GT	3	6	145892	145897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015851	TC	3	6	148535	148540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015851	GT	3	6	150894	150899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015851	GC	4	8	152467	152474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015851	GC	3	6	152605	152610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015851	GC	3	6	152612	152617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015851	GC	3	6	172633	172638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015851	GA	3	6	174868	174873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015851	GC	3	6	178391	178396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015851	CG	3	6	182434	182439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015851	AG	3	6	190247	190252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015851	GT	3	6	196874	196879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015851	GC	4	8	199345	199352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015851	TC	4	8	199355	199362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015851	GA	3	6	199366	199371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015851	GC	3	6	201355	201360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015851	TC	4	8	208162	208169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015851	GC	3	6	208835	208840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015851	AC	3	6	210371	210376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015851	GT	3	6	215497	215502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015851	GC	4	8	218870	218877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015851	TC	4	8	218880	218887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015851	GA	3	6	218891	218896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015851	GC	3	6	221226	221231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015851	TG	3	6	223900	223905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015851	GC	4	8	228884	228891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015851	TG	3	6	228999	229004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015851	AT	3	6	234571	234576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015851	CA	3	6	234621	234626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015851	CA	4	8	234667	234674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015851	AT	3	6	238341	238346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015851	CG	3	6	241642	241647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015851	GC	3	6	242253	242258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015851	CA	3	6	244111	244116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015851	GC	3	6	247158	247163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015851	GC	3	6	248383	248388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015851	TC	3	6	248625	248630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015851	TA	4	8	250306	250313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.