MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	GA	3	6	1084	1089	50 %	0 %	50 %	0 %	340783626
2	NC_015851	CT	4	8	1364	1371	0 %	50 %	0 %	50 %	340783627
3	NC_015851	TA	4	8	2876	2883	50 %	50 %	0 %	0 %	340783629
4	NC_015851	AT	3	6	3737	3742	50 %	50 %	0 %	0 %	340783629
5	NC_015851	TA	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	340783630
6	NC_015851	TA	3	6	4765	4770	50 %	50 %	0 %	0 %	340783630
7	NC_015851	AT	3	6	5605	5610	50 %	50 %	0 %	0 %	340783631
8	NC_015851	GT	3	6	5720	5725	0 %	50 %	50 %	0 %	340783631
9	NC_015851	TG	3	6	5995	6000	0 %	50 %	50 %	0 %	340783631
10	NC_015851	GC	3	6	7818	7823	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
11	NC_015851	GC	3	6	8044	8049	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
12	NC_015851	GC	3	6	8602	8607	0 %	0 %	50 %	50 %	340783634
13	NC_015851	GC	3	6	9675	9680	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
14	NC_015851	GC	3	6	9938	9943	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
15	NC_015851	TC	3	6	10016	10021	0 %	50 %	0 %	50 %	340783636
16	NC_015851	CG	3	6	10022	10027	0 %	0 %	50 %	50 %	340783636
17	NC_015851	GC	3	6	10640	10645	0 %	0 %	50 %	50 %	340783637
18	NC_015851	GC	3	6	12067	12072	0 %	0 %	50 %	50 %	340783639
19	NC_015851	TC	3	6	12734	12739	0 %	50 %	0 %	50 %	340783639
20	NC_015851	GT	3	6	13474	13479	0 %	50 %	50 %	0 %	340783640
21	NC_015851	CG	3	6	16101	16106	0 %	0 %	50 %	50 %	340783643
22	NC_015851	AT	3	6	16251	16256	50 %	50 %	0 %	0 %	340783643
23	NC_015851	AT	3	6	18142	18147	50 %	50 %	0 %	0 %	340783643
24	NC_015851	CG	3	6	18531	18536	0 %	0 %	50 %	50 %	340783644
25	NC_015851	TC	3	6	19238	19243	0 %	50 %	0 %	50 %	340783644
26	NC_015851	AT	3	6	19928	19933	50 %	50 %	0 %	0 %	340783645
27	NC_015851	TC	3	6	20081	20086	0 %	50 %	0 %	50 %	340783645
28	NC_015851	GC	3	6	20976	20981	0 %	0 %	50 %	50 %	340783645
29	NC_015851	CG	3	6	21522	21527	0 %	0 %	50 %	50 %	340783645
30	NC_015851	GC	3	6	22394	22399	0 %	0 %	50 %	50 %	340783646
31	NC_015851	CG	3	6	22665	22670	0 %	0 %	50 %	50 %	340783647
32	NC_015851	TC	3	6	22890	22895	0 %	50 %	0 %	50 %	340783647
33	NC_015851	TG	3	6	22965	22970	0 %	50 %	50 %	0 %	340783647
34	NC_015851	TG	3	6	23135	23140	0 %	50 %	50 %	0 %	340783647
35	NC_015851	CG	3	6	23505	23510	0 %	0 %	50 %	50 %	340783648
36	NC_015851	TC	3	6	24132	24137	0 %	50 %	0 %	50 %	340783649
37	NC_015851	CG	3	6	24300	24305	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
38	NC_015851	CG	3	6	24313	24318	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
39	NC_015851	CG	3	6	24550	24555	0 %	0 %	50 %	50 %	340783649
40	NC_015851	GT	3	6	24557	24562	0 %	50 %	50 %	0 %	340783649
41	NC_015851	AC	3	6	24810	24815	50 %	0 %	0 %	50 %	340783649
42	NC_015851	CG	3	6	25138	25143	0 %	0 %	50 %	50 %	340783650
43	NC_015851	AT	3	6	25953	25958	50 %	50 %	0 %	0 %	340783651
44	NC_015851	GC	3	6	26777	26782	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
45	NC_015851	GC	3	6	27062	27067	0 %	0 %	50 %	50 %	340783652
46	NC_015851	GC	3	6	28598	28603	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
47	NC_015851	CG	3	6	29712	29717	0 %	0 %	50 %	50 %	340783654
48	NC_015851	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
49	NC_015851	CG	3	6	30256	30261	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
50	NC_015851	TG	3	6	30288	30293	0 %	50 %	50 %	0 %	340783655
51	NC_015851	GC	3	6	30981	30986	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
52	NC_015851	GC	3	6	31621	31626	0 %	0 %	50 %	50 %	340783656
53	NC_015851	GT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	50 %	0 %	340783656
54	NC_015851	TC	3	6	33777	33782	0 %	50 %	0 %	50 %	340783658
55	NC_015851	GC	3	6	33986	33991	0 %	0 %	50 %	50 %	340783658
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59	NC_015851	GC	3	6	37054	37059	0 %	0 %	50 %	50 %	340783663
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63	NC_015851	CA	3	6	38802	38807	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
64	NC_015851	CG	3	6	39690	39695	0 %	0 %	50 %	50 %	340783669
65	NC_015851	GC	3	6	39876	39881	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
66	NC_015851	GC	3	6	40139	40144	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
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68	NC_015851	CG	3	6	40223	40228	0 %	0 %	50 %	50 %	340783670
69	NC_015851	CT	3	6	41216	41221	0 %	50 %	0 %	50 %	340783671
70	NC_015851	GC	3	6	41462	41467	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
71	NC_015851	CG	3	6	41603	41608	0 %	0 %	50 %	50 %	340783671
72	NC_015851	AG	3	6	42116	42121	50 %	0 %	50 %	0 %	340783671
73	NC_015851	GC	3	6	42667	42672	0 %	0 %	50 %	50 %	340783672
74	NC_015851	TC	3	6	42928	42933	0 %	50 %	0 %	50 %	340783672
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77	NC_015851	GC	3	6	43661	43666	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
78	NC_015851	CG	3	6	44167	44172	0 %	0 %	50 %	50 %	340783673
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91	NC_015851	GC	3	6	51351	51356	0 %	0 %	50 %	50 %	340783679
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93	NC_015851	CA	3	6	52902	52907	50 %	0 %	0 %	50 %	340783682
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102	NC_015851	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	340783688
103	NC_015851	TC	3	6	61578	61583	0 %	50 %	0 %	50 %	340783688
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108	NC_015851	GC	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
109	NC_015851	GC	3	6	65069	65074	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
110	NC_015851	CG	3	6	65477	65482	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
111	NC_015851	GC	3	6	65821	65826	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
112	NC_015851	CG	3	6	65862	65867	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
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115	NC_015851	CT	3	6	68612	68617	0 %	50 %	0 %	50 %	340783693
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119	NC_015851	GC	3	6	76652	76657	0 %	0 %	50 %	50 %	340783700
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122	NC_015851	GC	3	6	79939	79944	0 %	0 %	50 %	50 %	340783705
123	NC_015851	CG	3	6	81003	81008	0 %	0 %	50 %	50 %	340783706
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125	NC_015851	GC	3	6	82552	82557	0 %	0 %	50 %	50 %	340783707
126	NC_015851	CG	4	8	83047	83054	0 %	0 %	50 %	50 %	340783707
127	NC_015851	AT	3	6	85063	85068	50 %	50 %	0 %	0 %	340783708
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129	NC_015851	CG	3	6	86046	86051	0 %	0 %	50 %	50 %	340783709
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139	NC_015851	GC	3	6	93176	93181	0 %	0 %	50 %	50 %	340783715
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.