MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015851	G	6	6	1333	1338	0 %	0 %	100 %	0 %	340783627
2	NC_015851	G	6	6	1395	1400	0 %	0 %	100 %	0 %	340783627
3	NC_015851	G	6	6	1684	1689	0 %	0 %	100 %	0 %	340783628
4	NC_015851	C	6	6	1728	1733	0 %	0 %	0 %	100 %	340783628
5	NC_015851	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	340783629
6	NC_015851	T	6	6	3388	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	340783629
7	NC_015851	C	6	6	3620	3625	0 %	0 %	0 %	100 %	340783629
8	NC_015851	C	6	6	4309	4314	0 %	0 %	0 %	100 %	340783630
9	NC_015851	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	340783631
10	NC_015851	A	6	6	6333	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
11	NC_015851	A	6	6	6504	6509	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
12	NC_015851	A	6	6	6612	6617	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
13	NC_015851	A	6	6	6627	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	340783632
14	NC_015851	C	6	6	12092	12097	0 %	0 %	0 %	100 %	340783639
15	NC_015851	C	6	6	13961	13966	0 %	0 %	0 %	100 %	340783641
16	NC_015851	G	6	6	15399	15404	0 %	0 %	100 %	0 %	340783642
17	NC_015851	T	7	7	18757	18763	0 %	100 %	0 %	0 %	340783644
18	NC_015851	G	7	7	19877	19883	0 %	0 %	100 %	0 %	340783645
19	NC_015851	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	340783645
20	NC_015851	A	6	6	24217	24222	100 %	0 %	0 %	0 %	340783649
21	NC_015851	G	6	6	24449	24454	0 %	0 %	100 %	0 %	340783649
22	NC_015851	G	6	6	25199	25204	0 %	0 %	100 %	0 %	340783650
23	NC_015851	A	6	6	26016	26021	100 %	0 %	0 %	0 %	340783651
24	NC_015851	G	6	6	26722	26727	0 %	0 %	100 %	0 %	340783652
25	NC_015851	A	6	6	38692	38697	100 %	0 %	0 %	0 %	340783667
26	NC_015851	C	6	6	38783	38788	0 %	0 %	0 %	100 %	340783667
27	NC_015851	T	6	6	42011	42016	0 %	100 %	0 %	0 %	340783671
28	NC_015851	T	6	6	45898	45903	0 %	100 %	0 %	0 %	340783674
29	NC_015851	A	6	6	46344	46349	100 %	0 %	0 %	0 %	340783675
30	NC_015851	C	6	6	49109	49114	0 %	0 %	0 %	100 %	340783676
31	NC_015851	T	6	6	52077	52082	0 %	100 %	0 %	0 %	340783680
32	NC_015851	G	6	6	55871	55876	0 %	0 %	100 %	0 %	340783684
33	NC_015851	C	6	6	56516	56521	0 %	0 %	0 %	100 %	340783684
34	NC_015851	T	8	8	59456	59463	0 %	100 %	0 %	0 %	340783687
35	NC_015851	C	6	6	62750	62755	0 %	0 %	0 %	100 %	340783688
36	NC_015851	G	6	6	63955	63960	0 %	0 %	100 %	0 %	340783689
37	NC_015851	C	6	6	63984	63989	0 %	0 %	0 %	100 %	340783689
38	NC_015851	C	6	6	65517	65522	0 %	0 %	0 %	100 %	340783690
39	NC_015851	G	6	6	67729	67734	0 %	0 %	100 %	0 %	340783692
40	NC_015851	A	6	6	68917	68922	100 %	0 %	0 %	0 %	340783693
41	NC_015851	A	6	6	71419	71424	100 %	0 %	0 %	0 %	340783695
42	NC_015851	A	7	7	75105	75111	100 %	0 %	0 %	0 %	340783699
43	NC_015851	G	6	6	77013	77018	0 %	0 %	100 %	0 %	340783701
44	NC_015851	C	6	6	78992	78997	0 %	0 %	0 %	100 %	340783704
45	NC_015851	C	6	6	80899	80904	0 %	0 %	0 %	100 %	340783706
46	NC_015851	C	6	6	82092	82097	0 %	0 %	0 %	100 %	340783707
47	NC_015851	C	6	6	83581	83586	0 %	0 %	0 %	100 %	340783707
48	NC_015851	C	6	6	84134	84139	0 %	0 %	0 %	100 %	340783708
49	NC_015851	T	7	7	85291	85297	0 %	100 %	0 %	0 %	340783708
50	NC_015851	G	6	6	86118	86123	0 %	0 %	100 %	0 %	340783709
51	NC_015851	A	7	7	94096	94102	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
52	NC_015851	A	6	6	94150	94155	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
53	NC_015851	A	6	6	94168	94173	100 %	0 %	0 %	0 %	340783716
54	NC_015851	C	6	6	94264	94269	0 %	0 %	0 %	100 %	340783716
55	NC_015851	T	6	6	94644	94649	0 %	100 %	0 %	0 %	340783716
56	NC_015851	A	6	6	97793	97798	100 %	0 %	0 %	0 %	340783719
57	NC_015851	A	6	6	97980	97985	100 %	0 %	0 %	0 %	340783719
58	NC_015851	A	6	6	100132	100137	100 %	0 %	0 %	0 %	340783720
59	NC_015851	A	6	6	101809	101814	100 %	0 %	0 %	0 %	340783722
60	NC_015851	A	6	6	101824	101829	100 %	0 %	0 %	0 %	340783722
61	NC_015851	A	6	6	101887	101892	100 %	0 %	0 %	0 %	340783722
62	NC_015851	T	6	6	101896	101901	0 %	100 %	0 %	0 %	340783722
63	NC_015851	T	7	7	104538	104544	0 %	100 %	0 %	0 %	340783724
64	NC_015851	A	6	6	105808	105813	100 %	0 %	0 %	0 %	340783725
65	NC_015851	T	6	6	105937	105942	0 %	100 %	0 %	0 %	340783725
66	NC_015851	A	6	6	106195	106200	100 %	0 %	0 %	0 %	340783725
67	NC_015851	T	6	6	107388	107393	0 %	100 %	0 %	0 %	340783725
68	NC_015851	T	6	6	107970	107975	0 %	100 %	0 %	0 %	340783726
69	NC_015851	C	6	6	112638	112643	0 %	0 %	0 %	100 %	340783730
70	NC_015851	G	6	6	120797	120802	0 %	0 %	100 %	0 %	340783741
71	NC_015851	C	6	6	122327	122332	0 %	0 %	0 %	100 %	340783744
72	NC_015851	T	6	6	126090	126095	0 %	100 %	0 %	0 %	340783751
73	NC_015851	T	6	6	127407	127412	0 %	100 %	0 %	0 %	340783751
74	NC_015851	A	6	6	128308	128313	100 %	0 %	0 %	0 %	340783753
75	NC_015851	T	6	6	128964	128969	0 %	100 %	0 %	0 %	340783754
76	NC_015851	C	6	6	129046	129051	0 %	0 %	0 %	100 %	340783754
77	NC_015851	A	6	6	129949	129954	100 %	0 %	0 %	0 %	340783754
78	NC_015851	T	6	6	131514	131519	0 %	100 %	0 %	0 %	340783756
79	NC_015851	A	6	6	133210	133215	100 %	0 %	0 %	0 %	340783757
80	NC_015851	T	6	6	135621	135626	0 %	100 %	0 %	0 %	340783762
81	NC_015851	T	7	7	149708	149714	0 %	100 %	0 %	0 %	340783781
82	NC_015851	G	6	6	153075	153080	0 %	0 %	100 %	0 %	340783785
83	NC_015851	G	6	6	162146	162151	0 %	0 %	100 %	0 %	340783789
84	NC_015851	G	6	6	162727	162732	0 %	0 %	100 %	0 %	340783789
85	NC_015851	C	6	6	163658	163663	0 %	0 %	0 %	100 %	340783790
86	NC_015851	T	6	6	165708	165713	0 %	100 %	0 %	0 %	340783790
87	NC_015851	T	7	7	169291	169297	0 %	100 %	0 %	0 %	340783793
88	NC_015851	A	6	6	170689	170694	100 %	0 %	0 %	0 %	340783795
89	NC_015851	A	7	7	173662	173668	100 %	0 %	0 %	0 %	340783797
90	NC_015851	A	6	6	174526	174531	100 %	0 %	0 %	0 %	340783798
91	NC_015851	T	6	6	175118	175123	0 %	100 %	0 %	0 %	340783799
92	NC_015851	T	6	6	175790	175795	0 %	100 %	0 %	0 %	340783800
93	NC_015851	A	6	6	178010	178015	100 %	0 %	0 %	0 %	340783803
94	NC_015851	G	6	6	183344	183349	0 %	0 %	100 %	0 %	340783809
95	NC_015851	G	6	6	185608	185613	0 %	0 %	100 %	0 %	340783812
96	NC_015851	A	6	6	186527	186532	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
97	NC_015851	A	7	7	186742	186748	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
98	NC_015851	T	6	6	187513	187518	0 %	100 %	0 %	0 %	340783814
99	NC_015851	T	6	6	189423	189428	0 %	100 %	0 %	0 %	340783816
100	NC_015851	T	6	6	189588	189593	0 %	100 %	0 %	0 %	340783816
101	NC_015851	T	6	6	194187	194192	0 %	100 %	0 %	0 %	340783823
102	NC_015851	A	6	6	194789	194794	100 %	0 %	0 %	0 %	340783823
103	NC_015851	C	6	6	198311	198316	0 %	0 %	0 %	100 %	340783826
104	NC_015851	T	6	6	201634	201639	0 %	100 %	0 %	0 %	340783829
105	NC_015851	C	6	6	201785	201790	0 %	0 %	0 %	100 %	340783829
106	NC_015851	T	6	6	203457	203462	0 %	100 %	0 %	0 %	340783830
107	NC_015851	A	6	6	214121	214126	100 %	0 %	0 %	0 %	340783838
108	NC_015851	C	6	6	214535	214540	0 %	0 %	0 %	100 %	340783839
109	NC_015851	C	6	6	217836	217841	0 %	0 %	0 %	100 %	340783843
110	NC_015851	A	8	8	222407	222414	100 %	0 %	0 %	0 %	340783847
111	NC_015851	T	7	7	224247	224253	0 %	100 %	0 %	0 %	340783849
112	NC_015851	C	6	6	226648	226653	0 %	0 %	0 %	100 %	340783852
113	NC_015851	T	6	6	227049	227054	0 %	100 %	0 %	0 %	340783852
114	NC_015851	T	6	6	230433	230438	0 %	100 %	0 %	0 %	340783857
115	NC_015851	T	8	8	231042	231049	0 %	100 %	0 %	0 %	340783858
116	NC_015851	G	6	6	233846	233851	0 %	0 %	100 %	0 %	340783861
117	NC_015851	G	6	6	235043	235048	0 %	0 %	100 %	0 %	340783862
118	NC_015851	A	6	6	235598	235603	100 %	0 %	0 %	0 %	340783863
119	NC_015851	G	6	6	235871	235876	0 %	0 %	100 %	0 %	340783864
120	NC_015851	T	6	6	235970	235975	0 %	100 %	0 %	0 %	340783864
121	NC_015851	A	6	6	236484	236489	100 %	0 %	0 %	0 %	340783864
122	NC_015851	A	7	7	237064	237070	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
123	NC_015851	A	6	6	237221	237226	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
124	NC_015851	A	6	6	237603	237608	100 %	0 %	0 %	0 %	340783865
125	NC_015851	A	6	6	239242	239247	100 %	0 %	0 %	0 %	340783866
126	NC_015851	A	6	6	241770	241775	100 %	0 %	0 %	0 %	340783869
127	NC_015851	C	6	6	242705	242710	0 %	0 %	0 %	100 %	340783870
128	NC_015851	T	6	6	243817	243822	0 %	100 %	0 %	0 %	340783871
129	NC_015851	T	6	6	244557	244562	0 %	100 %	0 %	0 %	340783872
130	NC_015851	A	6	6	246777	246782	100 %	0 %	0 %	0 %	340783875
131	NC_015851	G	6	6	247932	247937	0 %	0 %	100 %	0 %	340783877
132	NC_015851	A	6	6	249717	249722	100 %	0 %	0 %	0 %	340783879

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.