MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 5358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015850	GCTG	2	8	524740	524747	0 %	25 %	50 %	25 %	340781256
1002	NC_015850	GGTC	2	8	525006	525013	0 %	25 %	50 %	25 %	340781257
1003	NC_015850	CTAC	2	8	526115	526122	25 %	25 %	0 %	50 %	340781257
1004	NC_015850	CTGG	2	8	526159	526166	0 %	25 %	50 %	25 %	340781257
1005	NC_015850	GACA	2	8	526359	526366	50 %	0 %	25 %	25 %	340781257
1006	NC_015850	GCGT	2	8	527139	527146	0 %	25 %	50 %	25 %	340781258
1007	NC_015850	TGGT	2	8	527503	527510	0 %	50 %	50 %	0 %	340781258
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1009	NC_015850	GATT	2	8	528701	528708	25 %	50 %	25 %	0 %	340781259
1010	NC_015850	CAGG	2	8	529029	529036	25 %	0 %	50 %	25 %	340781259
1011	NC_015850	GAAG	2	8	529079	529086	50 %	0 %	50 %	0 %	340781259
1012	NC_015850	CGCC	2	8	530422	530429	0 %	0 %	25 %	75 %	340781260
1013	NC_015850	GCCA	2	8	531565	531572	25 %	0 %	25 %	50 %	340781261
1014	NC_015850	CCAA	2	8	532223	532230	50 %	0 %	0 %	50 %	340781261
1015	NC_015850	CGAT	2	8	533124	533131	25 %	25 %	25 %	25 %	340781262
1016	NC_015850	TAGC	2	8	533832	533839	25 %	25 %	25 %	25 %	340781262
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1019	NC_015850	CGAT	2	8	535686	535693	25 %	25 %	25 %	25 %	340781263
1020	NC_015850	GAGG	2	8	536188	536195	25 %	0 %	75 %	0 %	340781264
1021	NC_015850	TGGC	3	12	536561	536572	0 %	25 %	50 %	25 %	340781265
1022	NC_015850	TGGA	2	8	536807	536814	25 %	25 %	50 %	0 %	340781265
1023	NC_015850	CCGA	2	8	537352	537359	25 %	0 %	25 %	50 %	340781265
1024	NC_015850	TCTG	2	8	538352	538359	0 %	50 %	25 %	25 %	340781267
1025	NC_015850	GGTG	2	8	538389	538396	0 %	25 %	75 %	0 %	340781267
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1034	NC_015850	CGAC	2	8	542377	542384	25 %	0 %	25 %	50 %	340781269
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1036	NC_015850	CGAC	2	8	543039	543046	25 %	0 %	25 %	50 %	340781269
1037	NC_015850	GTGG	2	8	543965	543972	0 %	25 %	75 %	0 %	340781270
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1041	NC_015850	GTTG	2	8	544809	544816	0 %	50 %	50 %	0 %	340781271
1042	NC_015850	TGGG	2	8	544835	544842	0 %	25 %	75 %	0 %	340781271
1043	NC_015850	CGCC	2	8	544879	544886	0 %	0 %	25 %	75 %	340781271
1044	NC_015850	GCTA	2	8	545008	545015	25 %	25 %	25 %	25 %	340781271
1045	NC_015850	GCCC	2	8	545048	545055	0 %	0 %	25 %	75 %	340781271
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1051	NC_015850	GCGG	2	8	549663	549670	0 %	0 %	75 %	25 %	340781275
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1055	NC_015850	GCTG	2	8	552935	552942	0 %	25 %	50 %	25 %	340781279
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1057	NC_015850	TTGC	2	8	554505	554512	0 %	50 %	25 %	25 %	340781280
1058	NC_015850	GCTG	2	8	555289	555296	0 %	25 %	50 %	25 %	340781280
1059	NC_015850	GCCG	2	8	555333	555340	0 %	0 %	50 %	50 %	340781280
1060	NC_015850	TTAC	2	8	555813	555820	25 %	50 %	0 %	25 %	340781281
1061	NC_015850	GCAA	2	8	556318	556325	50 %	0 %	25 %	25 %	340781281
1062	NC_015850	AGAA	2	8	557889	557896	75 %	0 %	25 %	0 %	340781282
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1076	NC_015850	CAGC	2	8	564652	564659	25 %	0 %	25 %	50 %	340781292
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1098	NC_015850	CGGA	2	8	579423	579430	25 %	0 %	50 %	25 %	340781312
1099	NC_015850	GGTC	2	8	579962	579969	0 %	25 %	50 %	25 %	340781313
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1101	NC_015850	CCCA	2	8	582015	582022	25 %	0 %	0 %	75 %	340781315
1102	NC_015850	TCGG	2	8	583064	583071	0 %	25 %	50 %	25 %	340781317
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1104	NC_015850	CCAC	2	8	583499	583506	25 %	0 %	0 %	75 %	340781317
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1108	NC_015850	TTCC	2	8	585946	585953	0 %	50 %	0 %	50 %	340781319
1109	NC_015850	GGCG	2	8	586435	586442	0 %	0 %	75 %	25 %	340781320
1110	NC_015850	GTTC	2	8	586792	586799	0 %	50 %	25 %	25 %	340781320
1111	NC_015850	GGCG	2	8	586888	586895	0 %	0 %	75 %	25 %	340781320
1112	NC_015850	GATG	2	8	587225	587232	25 %	25 %	50 %	0 %	340781321
1113	NC_015850	GCCG	2	8	587271	587278	0 %	0 %	50 %	50 %	340781321
1114	NC_015850	ATCG	2	8	588216	588223	25 %	25 %	25 %	25 %	340781322
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1123	NC_015850	AGGT	2	8	594371	594378	25 %	25 %	50 %	0 %	340781330
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1126	NC_015850	CGTC	2	8	595807	595814	0 %	25 %	25 %	50 %	340781331
1127	NC_015850	GGGC	2	8	596751	596758	0 %	0 %	75 %	25 %	340781332
1128	NC_015850	TCCG	2	8	596827	596834	0 %	25 %	25 %	50 %	340781332
1129	NC_015850	GGTG	2	8	597983	597990	0 %	25 %	75 %	0 %	340781333
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