MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 5007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015850	CA	3	6	1249	1254	50 %	0 %	0 %	50 %	340780745
2	NC_015850	GC	3	6	1301	1306	0 %	0 %	50 %	50 %	340780745
3	NC_015850	GA	4	8	1589	1596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015850	TG	3	6	1730	1735	0 %	50 %	50 %	0 %	340780746
5	NC_015850	CG	3	6	1810	1815	0 %	0 %	50 %	50 %	340780746
6	NC_015850	AG	3	6	1948	1953	50 %	0 %	50 %	0 %	340780746
7	NC_015850	CG	3	6	2047	2052	0 %	0 %	50 %	50 %	340780746
8	NC_015850	GC	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	340780746
9	NC_015850	GC	3	6	4505	4510	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
10	NC_015850	CG	3	6	4863	4868	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
11	NC_015850	GC	4	8	4904	4911	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
12	NC_015850	GC	4	8	4927	4934	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
13	NC_015850	CG	3	6	5337	5342	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
14	NC_015850	GC	3	6	5459	5464	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
15	NC_015850	GA	3	6	5484	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	340780748
16	NC_015850	GC	3	6	5948	5953	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
17	NC_015850	GC	3	6	6146	6151	0 %	0 %	50 %	50 %	340780748
18	NC_015850	GT	3	6	9233	9238	0 %	50 %	50 %	0 %	340780749
19	NC_015850	CG	3	6	9635	9640	0 %	0 %	50 %	50 %	340780749
20	NC_015850	GC	3	6	10619	10624	0 %	0 %	50 %	50 %	340780751
21	NC_015850	GC	3	6	12024	12029	0 %	0 %	50 %	50 %	340780754
22	NC_015850	GC	3	6	12035	12040	0 %	0 %	50 %	50 %	340780754
23	NC_015850	GC	3	6	13131	13136	0 %	0 %	50 %	50 %	340780754
24	NC_015850	GC	3	6	13212	13217	0 %	0 %	50 %	50 %	340780754
25	NC_015850	GC	3	6	13745	13750	0 %	0 %	50 %	50 %	340780754
26	NC_015850	CG	3	6	14589	14594	0 %	0 %	50 %	50 %	340780755
27	NC_015850	AG	3	6	14842	14847	50 %	0 %	50 %	0 %	340780756
28	NC_015850	CG	3	6	15144	15149	0 %	0 %	50 %	50 %	340780756
29	NC_015850	GC	3	6	15545	15550	0 %	0 %	50 %	50 %	340780756
30	NC_015850	CT	3	6	15913	15918	0 %	50 %	0 %	50 %	340780756
31	NC_015850	GC	3	6	17378	17383	0 %	0 %	50 %	50 %	340780758
32	NC_015850	GT	3	6	17436	17441	0 %	50 %	50 %	0 %	340780758
33	NC_015850	TC	4	8	17489	17496	0 %	50 %	0 %	50 %	340780758
34	NC_015850	GC	3	6	19115	19120	0 %	0 %	50 %	50 %	340780760
35	NC_015850	CG	3	6	19653	19658	0 %	0 %	50 %	50 %	340780760
36	NC_015850	GC	3	6	19774	19779	0 %	0 %	50 %	50 %	340780760
37	NC_015850	AG	3	6	20302	20307	50 %	0 %	50 %	0 %	340780761
38	NC_015850	GC	3	6	21353	21358	0 %	0 %	50 %	50 %	340780761
39	NC_015850	GC	3	6	21787	21792	0 %	0 %	50 %	50 %	340780761
40	NC_015850	GC	3	6	21992	21997	0 %	0 %	50 %	50 %	340780761
41	NC_015850	GC	3	6	22615	22620	0 %	0 %	50 %	50 %	340780762
42	NC_015850	GC	3	6	23265	23270	0 %	0 %	50 %	50 %	340780762
43	NC_015850	GC	3	6	23311	23316	0 %	0 %	50 %	50 %	340780762
44	NC_015850	AG	3	6	23554	23559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015850	CT	3	6	23891	23896	0 %	50 %	0 %	50 %	340780763
46	NC_015850	GC	3	6	24377	24382	0 %	0 %	50 %	50 %	340780764
47	NC_015850	CG	3	6	24485	24490	0 %	0 %	50 %	50 %	340780764
48	NC_015850	GC	3	6	24593	24598	0 %	0 %	50 %	50 %	340780765
49	NC_015850	GC	3	6	24618	24623	0 %	0 %	50 %	50 %	340780765
50	NC_015850	GC	3	6	24886	24891	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
51	NC_015850	CG	3	6	25719	25724	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
52	NC_015850	GC	3	6	26354	26359	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
53	NC_015850	CG	3	6	26656	26661	0 %	0 %	50 %	50 %	340780767
54	NC_015850	GC	3	6	27030	27035	0 %	0 %	50 %	50 %	340780767
55	NC_015850	CG	3	6	28602	28607	0 %	0 %	50 %	50 %	340780769
56	NC_015850	GC	3	6	28649	28654	0 %	0 %	50 %	50 %	340780769
57	NC_015850	GC	3	6	28925	28930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015850	GC	3	6	29184	29189	0 %	0 %	50 %	50 %	340780770
59	NC_015850	CG	3	6	30581	30586	0 %	0 %	50 %	50 %	340780773
60	NC_015850	GC	4	8	31084	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	340780774
61	NC_015850	GC	3	6	31332	31337	0 %	0 %	50 %	50 %	340780774
62	NC_015850	CG	3	6	32637	32642	0 %	0 %	50 %	50 %	340780775
63	NC_015850	GC	3	6	33791	33796	0 %	0 %	50 %	50 %	340780776
64	NC_015850	CG	3	6	35752	35757	0 %	0 %	50 %	50 %	340780778
65	NC_015850	GC	3	6	36941	36946	0 %	0 %	50 %	50 %	340780779
66	NC_015850	GC	3	6	37079	37084	0 %	0 %	50 %	50 %	340780779
67	NC_015850	TG	3	6	37370	37375	0 %	50 %	50 %	0 %	340780780
68	NC_015850	CG	3	6	38061	38066	0 %	0 %	50 %	50 %	340780780
69	NC_015850	CA	3	6	41485	41490	50 %	0 %	0 %	50 %	340780783
70	NC_015850	GA	3	6	43196	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	340780784
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72	NC_015850	AT	3	6	44565	44570	50 %	50 %	0 %	0 %	340780785
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76	NC_015850	CG	3	6	48345	48350	0 %	0 %	50 %	50 %	340780787
77	NC_015850	GC	4	8	48582	48589	0 %	0 %	50 %	50 %	340780787
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80	NC_015850	AG	3	6	48759	48764	50 %	0 %	50 %	0 %	340780787
81	NC_015850	CG	3	6	48863	48868	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
82	NC_015850	GC	4	8	49014	49021	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
83	NC_015850	GC	3	6	49329	49334	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
84	NC_015850	GC	3	6	49643	49648	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
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90	NC_015850	GA	3	6	53119	53124	50 %	0 %	50 %	0 %	340780791
91	NC_015850	GC	3	6	53409	53414	0 %	0 %	50 %	50 %	340780792
92	NC_015850	GC	3	6	53789	53794	0 %	0 %	50 %	50 %	340780792
93	NC_015850	CT	3	6	56687	56692	0 %	50 %	0 %	50 %	340780794
94	NC_015850	CG	3	6	57010	57015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015850	GC	3	6	57110	57115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015850	AC	3	6	57506	57511	50 %	0 %	0 %	50 %	340780795
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101	NC_015850	GC	3	6	58378	58383	0 %	0 %	50 %	50 %	340780796
102	NC_015850	GC	3	6	58859	58864	0 %	0 %	50 %	50 %	340780797
103	NC_015850	CG	4	8	59906	59913	0 %	0 %	50 %	50 %	340780797
104	NC_015850	GC	3	6	60351	60356	0 %	0 %	50 %	50 %	340780797
105	NC_015850	CG	3	6	60501	60506	0 %	0 %	50 %	50 %	340780797
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107	NC_015850	CG	3	6	63714	63719	0 %	0 %	50 %	50 %	340780800
108	NC_015850	GC	3	6	65651	65656	0 %	0 %	50 %	50 %	340780802
109	NC_015850	GC	3	6	65846	65851	0 %	0 %	50 %	50 %	340780803
110	NC_015850	CG	4	8	67680	67687	0 %	0 %	50 %	50 %	340780805
111	NC_015850	GC	3	6	67912	67917	0 %	0 %	50 %	50 %	340780805
112	NC_015850	GC	3	6	68422	68427	0 %	0 %	50 %	50 %	340780805
113	NC_015850	GC	3	6	68466	68471	0 %	0 %	50 %	50 %	340780805
114	NC_015850	CG	3	6	68653	68658	0 %	0 %	50 %	50 %	340780806
115	NC_015850	GC	3	6	68985	68990	0 %	0 %	50 %	50 %	340780806
116	NC_015850	GC	3	6	69474	69479	0 %	0 %	50 %	50 %	340780806
117	NC_015850	GC	3	6	71237	71242	0 %	0 %	50 %	50 %	340780807
118	NC_015850	GC	3	6	71830	71835	0 %	0 %	50 %	50 %	340780807
119	NC_015850	CG	3	6	71912	71917	0 %	0 %	50 %	50 %	340780807
120	NC_015850	TC	3	6	72055	72060	0 %	50 %	0 %	50 %	340780807
121	NC_015850	GC	3	6	73376	73381	0 %	0 %	50 %	50 %	340780808
122	NC_015850	GC	3	6	73919	73924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015850	GC	3	6	74392	74397	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
124	NC_015850	GC	3	6	75183	75188	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
125	NC_015850	GC	3	6	75242	75247	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
126	NC_015850	GC	3	6	75295	75300	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
127	NC_015850	GC	3	6	76397	76402	0 %	0 %	50 %	50 %	340780811
128	NC_015850	CG	3	6	76443	76448	0 %	0 %	50 %	50 %	340780811
129	NC_015850	CG	3	6	76585	76590	0 %	0 %	50 %	50 %	340780812
130	NC_015850	GC	4	8	76892	76899	0 %	0 %	50 %	50 %	340780812
131	NC_015850	GC	3	6	77053	77058	0 %	0 %	50 %	50 %	340780812
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133	NC_015850	TG	3	6	78546	78551	0 %	50 %	50 %	0 %	340780814
134	NC_015850	GC	3	6	79850	79855	0 %	0 %	50 %	50 %	340780815
135	NC_015850	GC	3	6	80028	80033	0 %	0 %	50 %	50 %	340780815
136	NC_015850	GC	3	6	80129	80134	0 %	0 %	50 %	50 %	340780815
137	NC_015850	GC	3	6	82110	82115	0 %	0 %	50 %	50 %	340780816
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139	NC_015850	GC	4	8	83507	83514	0 %	0 %	50 %	50 %	340780817
140	NC_015850	CG	3	6	83664	83669	0 %	0 %	50 %	50 %	340780818
141	NC_015850	GC	3	6	83684	83689	0 %	0 %	50 %	50 %	340780818
142	NC_015850	CG	3	6	84000	84005	0 %	0 %	50 %	50 %	340780818
143	NC_015850	CG	3	6	84103	84108	0 %	0 %	50 %	50 %	340780818
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