MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	ACCGCG	2	12	31022	31033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015848	CGTCGG	2	12	66788	66799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015848	GGTGAC	2	12	69490	69501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015848	TCGGCC	2	12	69942	69953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015848	CAACGG	2	12	78282	78293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015848	TCACCT	2	12	82457	82468	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015848	GCGTCG	2	12	130431	130442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015848	GCGTGC	2	12	130773	130784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015848	GCGGCA	2	12	132060	132071	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015848	TCGGGT	2	12	132699	132710	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015848	TCGGTC	2	12	152940	152951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015848	ACAGCC	2	12	225205	225216	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015848	AGATTC	2	12	337124	337135	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015848	GGGCCG	2	12	349751	349762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015848	GGTCGC	2	12	352561	352572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015848	TGGTCG	2	12	463714	463725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015848	TGCGGG	2	12	482419	482430	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015848	GCACCC	2	12	483321	483332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015848	CCGATA	2	12	483768	483779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015848	ATAGTC	2	12	553255	553266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015848	GCCCGC	2	12	572971	572982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015848	ACCAGT	2	12	601180	601191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015848	TCGTCA	2	12	713991	714002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015848	CGCCGT	2	12	729462	729473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015848	CGCGGG	2	12	845003	845014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015848	CCGGCG	2	12	873517	873528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015848	ACCGGG	2	12	880238	880249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015848	GCGGCC	2	12	915840	915851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015848	ACAGCA	2	12	917213	917224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015848	CTGGGT	2	12	932052	932063	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015848	CAGTCG	2	12	939876	939887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015848	TCGGGT	2	12	973373	973384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015848	CATCGT	2	12	976568	976579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015848	CAACGG	2	12	1034597	1034608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015848	GATCGA	2	12	1034650	1034661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015848	CGGCAG	2	12	1036677	1036688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015848	GACTGC	2	12	1039054	1039065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015848	CGCCGG	2	12	1057918	1057929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015848	GGCGCA	2	12	1107364	1107375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015848	CAATGC	2	12	1134465	1134476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015848	TTGGTG	2	12	1162602	1162613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015848	TTCCGT	2	12	1173294	1173305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015848	CACCCC	2	12	1185002	1185013	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_015848	TAGCCA	2	12	1211486	1211497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015848	AGTTAC	2	12	1238823	1238834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015848	AGGACG	2	12	1303051	1303062	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015848	AGGCCA	2	12	1361351	1361362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015848	TCGACA	2	12	1388836	1388847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015848	CCGAGT	2	12	1444346	1444357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015848	GTGCTG	2	12	1526255	1526266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015848	CACGCG	2	12	1549704	1549715	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015848	ATATTC	2	12	1584731	1584742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015848	GCCCCT	2	12	1657951	1657962	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015848	GGTTGA	2	12	1771945	1771956	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015848	CGAGTG	2	12	1816717	1816728	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015848	CTCCAT	2	12	1856752	1856763	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015848	GGCGCC	2	12	1862891	1862902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015848	CCGCGG	2	12	1928145	1928156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015848	TAGCGG	2	12	1955233	1955244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015848	TTTGCG	2	12	1955406	1955417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015848	ACCGCA	2	12	1958576	1958587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015848	CGGGGC	2	12	1979017	1979028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015848	TCGACT	2	12	2063545	2063556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015848	GGTGAT	2	12	2081841	2081852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015848	TTCGGC	2	12	2095782	2095793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015848	AGTCGC	2	12	2101173	2101184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015848	AGAGGG	2	12	2114274	2114285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015848	ACCGTG	2	12	2180992	2181003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015848	GCTGGG	2	12	2183624	2183635	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015848	CGCGAG	2	12	2220544	2220555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015848	CGGTTG	2	12	2279447	2279458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015848	GCCGGC	2	12	2295790	2295801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015848	CGGCTC	2	12	2312237	2312248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015848	TCGGCG	2	12	2317753	2317764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015848	CCCTGA	2	12	2371105	2371116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015848	AGCCGT	2	12	2386153	2386164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015848	ATAGAA	2	12	2420921	2420932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015848	CGGGTC	2	12	2425335	2425346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015848	GTCGGC	2	12	2425635	2425646	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015848	ACCTCG	2	12	2425702	2425713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015848	GATTCG	2	12	2451143	2451154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015848	CTCAAC	2	12	2463623	2463634	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015848	CCGCTG	2	12	2484212	2484223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015848	CACCGC	2	12	2492667	2492678	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015848	GCGTCG	2	12	2545212	2545223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015848	CCATGT	2	12	2547594	2547605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015848	TGTCGG	2	12	2547843	2547854	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015848	CACGAC	2	12	2563384	2563395	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015848	GCAACC	2	12	2689305	2689316	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015848	CACGTG	2	12	2775880	2775891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015848	GAGGTC	2	12	2779492	2779503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015848	CCGGCA	2	12	2796287	2796298	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015848	CGCCAC	2	12	2854441	2854452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015848	TCAAAC	2	12	2856194	2856205	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015848	ATGCCG	2	12	2861377	2861388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015848	GCACCC	2	12	2890455	2890466	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015848	ACCGCT	2	12	2935318	2935329	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015848	CGACGG	2	12	2940362	2940373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015848	GCCCGA	2	12	2947457	2947468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015848	GTATTG	2	12	2985893	2985904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015848	CCGTTG	2	12	2995838	2995849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015848	GGCGCC	2	12	3015663	3015674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015848	GTTCGG	2	12	3031291	3031302	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015848	CATATT	2	12	3074310	3074321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015848	CCGGCA	2	12	3139882	3139893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015848	CGGGTA	2	12	3163981	3163992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015848	ACGGCC	2	12	3165983	3165994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015848	CATCGA	2	12	3173770	3173781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015848	CGAACC	2	12	3173969	3173980	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015848	TCGCCT	2	12	3182763	3182774	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015848	CATCAC	2	12	3243417	3243428	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015848	GGCACC	2	12	3245405	3245416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015848	AGCGTG	2	12	3253658	3253669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015848	TCGCCG	2	12	3347875	3347886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015848	TCGCCG	2	12	3347932	3347943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015848	TCGCCG	2	12	3347989	3348000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015848	TCGCCG	2	12	3348046	3348057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015848	TCGCCG	2	12	3348103	3348114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015848	CGCCAC	2	12	3364131	3364142	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015848	AGGCCG	2	12	3372799	3372810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015848	CGTAGG	2	12	3443868	3443879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015848	CTGTCG	2	12	3466499	3466510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015848	CGATGC	2	12	3476392	3476403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015848	TGTACA	2	12	3491443	3491454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015848	ACCAAC	2	12	3496792	3496803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015848	CACCCG	2	12	3499283	3499294	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015848	CCGTTG	2	12	3520025	3520036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015848	CTGTCA	2	12	3556191	3556202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015848	GTCGAC	2	12	3558078	3558089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015848	TCCGCT	2	12	3604217	3604228	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015848	TGGTCG	2	12	3670842	3670853	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015848	ACGTCG	2	12	3679830	3679841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015848	GCCTCC	2	12	3697529	3697540	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015848	TGTCGA	2	12	3764538	3764549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015848	CCCAAA	2	12	3774507	3774518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015848	CGCAGC	2	12	3825103	3825114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015848	GCGCAG	2	12	3848128	3848139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015848	CCAGCT	2	12	3851625	3851636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015848	GCCCAA	2	12	3851908	3851919	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015848	TCGATG	3	18	3853136	3853153	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_015848	ATCGCC	2	12	3853685	3853696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015848	TGTACA	2	12	3868892	3868903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015848	CACGTT	2	12	3933980	3933991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015848	TCCTCT	2	12	3939259	3939270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015848	TCGGAG	2	12	3963623	3963634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015848	CCGCTC	2	12	3967652	3967663	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015848	CGTTGG	2	12	3980286	3980297	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_015848	CGGCCG	2	12	3984510	3984521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015848	CGAACA	2	12	4071043	4071054	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015848	TCGGTG	2	12	4141589	4141600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_015848	GTCGAG	2	12	4144499	4144510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_015848	GGCGAG	2	12	4180345	4180356	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015848	TGGCGG	2	12	4267860	4267871	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015848	CTCATC	2	12	4333839	4333850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015848	CATCGC	2	12	4390186	4390197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015848	GGGTTG	2	12	4394208	4394219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.