MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 3548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	340625034
2	NC_015848	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	340625035
3	NC_015848	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	340625035
4	NC_015848	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	340625037
5	NC_015848	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	340625039
6	NC_015848	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	340625039
7	NC_015848	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	340625039
8	NC_015848	CCGGC	2	10	10249	10258	0 %	0 %	40 %	60 %	340625040
9	NC_015848	CGCAA	2	10	10270	10279	40 %	0 %	20 %	40 %	340625040
10	NC_015848	CGGCG	2	10	10396	10405	0 %	0 %	60 %	40 %	340625040
11	NC_015848	ACCCG	2	10	11226	11235	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_015848	CGACC	2	10	13619	13628	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015848	GGCGT	2	10	14101	14110	0 %	20 %	60 %	20 %	340625045
14	NC_015848	GGGCC	2	10	14384	14393	0 %	0 %	60 %	40 %	340625045
15	NC_015848	GCGTT	2	10	15129	15138	0 %	40 %	40 %	20 %	340625046
16	NC_015848	CCAGC	2	10	15669	15678	20 %	0 %	20 %	60 %	340625047
17	NC_015848	ACCGA	2	10	16432	16441	40 %	0 %	20 %	40 %	340625047
18	NC_015848	ATCGG	2	10	16824	16833	20 %	20 %	40 %	20 %	340625047
19	NC_015848	CGGCC	2	10	17833	17842	0 %	0 %	40 %	60 %	340625048
20	NC_015848	TTAGC	2	10	18984	18993	20 %	40 %	20 %	20 %	340625049
21	NC_015848	GGTCC	2	10	19056	19065	0 %	20 %	40 %	40 %	340625049
22	NC_015848	GTCGT	2	10	21575	21584	0 %	40 %	40 %	20 %	340625050
23	NC_015848	ATCAC	2	10	23848	23857	40 %	20 %	0 %	40 %	340625053
24	NC_015848	GCCGG	2	10	24535	24544	0 %	0 %	60 %	40 %	340625053
25	NC_015848	CGAGC	2	10	26897	26906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015848	GGCAA	2	10	29230	29239	40 %	0 %	40 %	20 %	340625058
27	NC_015848	CGATC	2	10	30056	30065	20 %	20 %	20 %	40 %	340625059
28	NC_015848	CGACG	2	10	32243	32252	20 %	0 %	40 %	40 %	340625062
29	NC_015848	GCGTC	2	10	32298	32307	0 %	20 %	40 %	40 %	340625062
30	NC_015848	GACAC	2	10	32395	32404	40 %	0 %	20 %	40 %	340625062
31	NC_015848	TCCTG	2	10	37400	37409	0 %	40 %	20 %	40 %	340625068
32	NC_015848	CTCGG	2	10	37493	37502	0 %	20 %	40 %	40 %	340625068
33	NC_015848	GGCGC	2	10	38036	38045	0 %	0 %	60 %	40 %	340625068
34	NC_015848	TGGCC	2	10	38184	38193	0 %	20 %	40 %	40 %	340625068
35	NC_015848	CGGCG	2	10	38716	38725	0 %	0 %	60 %	40 %	340625068
36	NC_015848	GTCCA	2	10	39441	39450	20 %	20 %	20 %	40 %	340625069
37	NC_015848	GCCAA	2	10	41575	41584	40 %	0 %	20 %	40 %	340625071
38	NC_015848	GCGTC	2	10	41990	41999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015848	GCACA	2	10	42374	42383	40 %	0 %	20 %	40 %	340625072
40	NC_015848	GGTAC	2	10	44908	44917	20 %	20 %	40 %	20 %	340625074
41	NC_015848	TCGAA	2	10	45140	45149	40 %	20 %	20 %	20 %	340625074
42	NC_015848	GCACC	2	10	46070	46079	20 %	0 %	20 %	60 %	340625074
43	NC_015848	CGGTG	2	10	47104	47113	0 %	20 %	60 %	20 %	340625075
44	NC_015848	TCATG	2	10	47250	47259	20 %	40 %	20 %	20 %	340625075
45	NC_015848	ATCGG	2	10	47397	47406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015848	GCAGC	2	10	48644	48653	20 %	0 %	40 %	40 %	340625077
47	NC_015848	CCCGA	2	10	48727	48736	20 %	0 %	20 %	60 %	340625077
48	NC_015848	CAGCG	2	10	49852	49861	20 %	0 %	40 %	40 %	340625078
49	NC_015848	CTCCC	2	10	56292	56301	0 %	20 %	0 %	80 %	340625084
50	NC_015848	CGGCG	2	10	56741	56750	0 %	0 %	60 %	40 %	340625084
51	NC_015848	CGACC	2	10	58273	58282	20 %	0 %	20 %	60 %	340625086
52	NC_015848	CTTCG	2	10	58960	58969	0 %	40 %	20 %	40 %	340625087
53	NC_015848	CGGTG	2	10	60016	60025	0 %	20 %	60 %	20 %	340625090
54	NC_015848	TCAGG	2	10	62502	62511	20 %	20 %	40 %	20 %	340625091
55	NC_015848	TGCCG	2	10	65533	65542	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015848	CGGCG	2	10	66044	66053	0 %	0 %	60 %	40 %	340625095
57	NC_015848	GGCGA	2	10	66465	66474	20 %	0 %	60 %	20 %	340625095
58	NC_015848	CGGCC	2	10	69309	69318	0 %	0 %	40 %	60 %	340625097
59	NC_015848	GGTGT	2	10	71013	71022	0 %	40 %	60 %	0 %	340625098
60	NC_015848	ATCGG	2	10	71650	71659	20 %	20 %	40 %	20 %	340625098
61	NC_015848	CCGCG	2	10	72187	72196	0 %	0 %	40 %	60 %	340625098
62	NC_015848	GGCAA	2	10	72538	72547	40 %	0 %	40 %	20 %	340625098
63	NC_015848	CGACC	2	10	72827	72836	20 %	0 %	20 %	60 %	340625098
64	NC_015848	CGGGT	2	10	73281	73290	0 %	20 %	60 %	20 %	340625098
65	NC_015848	TGCCT	2	10	74082	74091	0 %	40 %	20 %	40 %	340625099
66	NC_015848	GTCCA	2	10	74953	74962	20 %	20 %	20 %	40 %	340625100
67	NC_015848	TGACC	2	10	77577	77586	20 %	20 %	20 %	40 %	340625102
68	NC_015848	GCCAA	2	10	77891	77900	40 %	0 %	20 %	40 %	340625102
69	NC_015848	GTCGC	2	10	77968	77977	0 %	20 %	40 %	40 %	340625102
70	NC_015848	GCGCG	2	10	79056	79065	0 %	0 %	60 %	40 %	340625103
71	NC_015848	CACGA	2	10	81913	81922	40 %	0 %	20 %	40 %	340625105
72	NC_015848	GCACC	2	10	82353	82362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015848	CCACC	2	10	82546	82555	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_015848	GAGCA	2	10	84451	84460	40 %	0 %	40 %	20 %	340625107
75	NC_015848	GCCGG	2	10	84550	84559	0 %	0 %	60 %	40 %	340625107
76	NC_015848	GCGAC	2	10	84626	84635	20 %	0 %	40 %	40 %	340625107
77	NC_015848	ATCCG	2	10	85396	85405	20 %	20 %	20 %	40 %	340625108
78	NC_015848	CACCG	2	10	86176	86185	20 %	0 %	20 %	60 %	340625109
79	NC_015848	TGGTC	2	10	88311	88320	0 %	40 %	40 %	20 %	340625111
80	NC_015848	GCTGG	2	10	88948	88957	0 %	20 %	60 %	20 %	340625112
81	NC_015848	TGGGT	2	10	91986	91995	0 %	40 %	60 %	0 %	340625117
82	NC_015848	TCGCC	2	10	92193	92202	0 %	20 %	20 %	60 %	340625117
83	NC_015848	GGGTC	2	10	92700	92709	0 %	20 %	60 %	20 %	340625118
84	NC_015848	CGGGC	2	10	93165	93174	0 %	0 %	60 %	40 %	340625118
85	NC_015848	GGCCG	2	10	94485	94494	0 %	0 %	60 %	40 %	340625119
86	NC_015848	GCGCC	2	10	95137	95146	0 %	0 %	40 %	60 %	340625119
87	NC_015848	CGCAC	2	10	96462	96471	20 %	0 %	20 %	60 %	340625121
88	NC_015848	GGTTG	2	10	96860	96869	0 %	40 %	60 %	0 %	340625121
89	NC_015848	AGATC	2	10	97680	97689	40 %	20 %	20 %	20 %	340625122
90	NC_015848	TCAGT	2	10	99546	99555	20 %	40 %	20 %	20 %	340625123
91	NC_015848	CGGCG	2	10	102811	102820	0 %	0 %	60 %	40 %	340625127
92	NC_015848	GCGCG	2	10	102940	102949	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015848	AGGTC	2	10	103184	103193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015848	GTCGA	2	10	104270	104279	20 %	20 %	40 %	20 %	340625129
95	NC_015848	GCGCC	2	10	106702	106711	0 %	0 %	40 %	60 %	340625130
96	NC_015848	GTCGA	2	10	107075	107084	20 %	20 %	40 %	20 %	340625130
97	NC_015848	CTGGC	2	10	109094	109103	0 %	20 %	40 %	40 %	340625132
98	NC_015848	GCACA	2	10	110215	110224	40 %	0 %	20 %	40 %	340625132
99	NC_015848	GAGAA	2	10	110284	110293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015848	ATCGC	2	10	113040	113049	20 %	20 %	20 %	40 %	340625135
101	NC_015848	TCTGA	2	10	114374	114383	20 %	40 %	20 %	20 %	340625137
102	NC_015848	CGGTC	2	10	114649	114658	0 %	20 %	40 %	40 %	340625137
103	NC_015848	GACCA	2	10	115787	115796	40 %	0 %	20 %	40 %	340625137
104	NC_015848	GGCTG	2	10	118351	118360	0 %	20 %	60 %	20 %	340625137
105	NC_015848	CCGCG	2	10	122271	122280	0 %	0 %	40 %	60 %	340625138
106	NC_015848	TCGTG	2	10	126224	126233	0 %	40 %	40 %	20 %	340625140
107	NC_015848	GCACG	2	10	127879	127888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015848	CCGGA	2	10	128004	128013	20 %	0 %	40 %	40 %	340625142
109	NC_015848	GGCCG	2	10	130365	130374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015848	TGCGC	2	10	130477	130486	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015848	GCGAG	2	10	130988	130997	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015848	GGGGT	2	10	131997	132006	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015848	CCCAC	2	10	132559	132568	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_015848	CCGGC	2	10	133069	133078	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015848	TGCGG	2	10	133479	133488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015848	ATCAC	2	10	134958	134967	40 %	20 %	0 %	40 %	340625144
117	NC_015848	ATCGG	2	10	135006	135015	20 %	20 %	40 %	20 %	340625144
118	NC_015848	CGGGC	2	10	136097	136106	0 %	0 %	60 %	40 %	340625144
119	NC_015848	GCGAT	2	10	137902	137911	20 %	20 %	40 %	20 %	340625146
120	NC_015848	GTTCG	2	10	138123	138132	0 %	40 %	40 %	20 %	340625146
121	NC_015848	CCTGG	2	10	138515	138524	0 %	20 %	40 %	40 %	340625146
122	NC_015848	GGCCC	2	10	138621	138630	0 %	0 %	40 %	60 %	340625146
123	NC_015848	CGTTG	2	10	139133	139142	0 %	40 %	40 %	20 %	340625146
124	NC_015848	CGACC	2	10	139205	139214	20 %	0 %	20 %	60 %	340625146
125	NC_015848	GAGAT	2	10	142225	142234	40 %	20 %	40 %	0 %	340625150
126	NC_015848	CGGCG	2	10	144380	144389	0 %	0 %	60 %	40 %	340625151
127	NC_015848	TGCGG	2	10	145013	145022	0 %	20 %	60 %	20 %	340625152
128	NC_015848	CGCTG	2	10	145720	145729	0 %	20 %	40 %	40 %	340625153
129	NC_015848	GTTGC	2	10	146266	146275	0 %	40 %	40 %	20 %	340625153
130	NC_015848	CCGAT	2	10	147014	147023	20 %	20 %	20 %	40 %	340625153
131	NC_015848	ATCGC	2	10	147705	147714	20 %	20 %	20 %	40 %	340625154
132	NC_015848	AACCG	2	10	148444	148453	40 %	0 %	20 %	40 %	340625154
133	NC_015848	CCGCC	2	10	149031	149040	0 %	0 %	20 %	80 %	340625154
134	NC_015848	CCGCC	2	10	149674	149683	0 %	0 %	20 %	80 %	340625155
135	NC_015848	GGGTC	2	10	151428	151437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015848	ATCGG	2	10	153158	153167	20 %	20 %	40 %	20 %	340625159
137	NC_015848	ATTGG	2	10	155993	156002	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015848	AGCGA	2	10	157896	157905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015848	AGCGA	2	10	157949	157958	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015848	AGCGA	2	10	158002	158011	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015848	TCGTC	2	10	158349	158358	0 %	40 %	20 %	40 %	340625162
142	NC_015848	CACGC	2	10	158813	158822	20 %	0 %	20 %	60 %	340625162
143	NC_015848	ATTCT	2	10	159657	159666	20 %	60 %	0 %	20 %	340625163
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155	NC_015848	CTGGG	2	10	167986	167995	0 %	20 %	60 %	20 %	340625171
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176	NC_015848	GTCGC	2	10	190380	190389	0 %	20 %	40 %	40 %	340625191
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197	NC_015848	GCCGA	2	10	221653	221662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_015848	CCTCG	2	10	222089	222098	0 %	20 %	20 %	60 %	340625221
199	NC_015848	TCGGT	3	15	222589	222603	0 %	40 %	40 %	20 %	340625222
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215	NC_015848	CTGCG	2	10	241264	241273	0 %	20 %	40 %	40 %	340625235
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239	NC_015848	TCTGC	2	10	275424	275433	0 %	40 %	20 %	40 %	340625262
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242	NC_015848	CGAGT	2	10	279439	279448	20 %	20 %	40 %	20 %	340625264
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244	NC_015848	GCCGC	2	10	282164	282173	0 %	0 %	40 %	60 %	340625267
245	NC_015848	GCCCG	2	10	282383	282392	0 %	0 %	40 %	60 %	340625267
246	NC_015848	GCAGT	2	10	282761	282770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
247	NC_015848	GATCC	2	10	285203	285212	20 %	20 %	20 %	40 %	340625269
248	NC_015848	GACCG	2	10	286636	286645	20 %	0 %	40 %	40 %	340625271
249	NC_015848	AACCG	2	10	287309	287318	40 %	0 %	20 %	40 %	340625271
250	NC_015848	GGCGA	2	10	287937	287946	20 %	0 %	60 %	20 %	340625272
251	NC_015848	CAGCG	2	10	289548	289557	20 %	0 %	40 %	40 %	340625273
252	NC_015848	GCCGA	2	10	290731	290740	20 %	0 %	40 %	40 %	340625273
253	NC_015848	CGAAC	2	10	296698	296707	40 %	0 %	20 %	40 %	340625279
254	NC_015848	TGGCC	2	10	297437	297446	0 %	20 %	40 %	40 %	340625280
255	NC_015848	GCGGT	2	10	299119	299128	0 %	20 %	60 %	20 %	340625281
256	NC_015848	ACGCC	2	10	300985	300994	20 %	0 %	20 %	60 %	340625282
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258	NC_015848	TGCGC	2	10	308949	308958	0 %	20 %	40 %	40 %	340625289
259	NC_015848	TGCGC	2	10	310158	310167	0 %	20 %	40 %	40 %	340625290
260	NC_015848	TCGAC	2	10	312107	312116	20 %	20 %	20 %	40 %	340625290
261	NC_015848	TGGGG	2	10	315149	315158	0 %	20 %	80 %	0 %	340625294
262	NC_015848	TGCGG	2	10	315798	315807	0 %	20 %	60 %	20 %	340625294
263	NC_015848	TGCCA	2	10	317562	317571	20 %	20 %	20 %	40 %	340625296
264	NC_015848	CGCAG	2	10	318718	318727	20 %	0 %	40 %	40 %	340625297
265	NC_015848	CGGCG	2	10	319352	319361	0 %	0 %	60 %	40 %	340625297
266	NC_015848	CGGCC	2	10	319926	319935	0 %	0 %	40 %	60 %	340625298
267	NC_015848	CAGAT	2	10	320833	320842	40 %	20 %	20 %	20 %	340625298
268	NC_015848	AGCGG	2	10	321057	321066	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
269	NC_015848	CGGAC	2	10	321171	321180	20 %	0 %	40 %	40 %	340625299
270	NC_015848	CGCAG	2	10	321379	321388	20 %	0 %	40 %	40 %	340625299
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272	NC_015848	GCCCG	2	10	322192	322201	0 %	0 %	40 %	60 %	340625300
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382	NC_015848	GCGCC	2	10	482672	482681	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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385	NC_015848	CCCGA	2	10	484968	484977	20 %	0 %	20 %	60 %	340625425
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389	NC_015848	GCACC	2	10	487426	487435	20 %	0 %	20 %	60 %	340625427
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400	NC_015848	GGGTG	2	10	499763	499772	0 %	20 %	80 %	0 %	340625431
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