MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 1310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015848	GCAC	2	8	11555	11562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015848	GCCC	2	8	12400	12407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015848	ATTC	2	8	13638	13645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015848	TCAA	2	8	25443	25450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015848	GAGC	2	8	25471	25478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015848	GGCC	2	8	25485	25492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015848	ACCA	2	8	31057	31064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015848	GCTA	2	8	33788	33795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015848	CTAC	2	8	47265	47272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015848	CTGG	2	8	52762	52769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015848	GCCG	2	8	53616	53623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015848	CTTG	2	8	68556	68563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015848	GCTG	2	8	68700	68707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015848	ATCG	2	8	69636	69643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015848	CGAC	2	8	70314	70321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015848	CGGT	2	8	81231	81238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015848	CGGT	2	8	81416	81423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015848	GCGG	2	8	91552	91559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015848	GCAT	2	8	91563	91570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015848	CCGG	2	8	99053	99060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015848	CGAA	2	8	99272	99279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015848	GAGT	2	8	101051	101058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015848	ACCG	2	8	103056	103063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015848	ATCC	2	8	129142	129149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015848	GCTC	2	8	129699	129706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015848	GCCC	2	8	129834	129841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015848	GGCG	2	8	130267	130274	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015848	GCTG	2	8	132098	132105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015848	TGCA	2	8	132785	132792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015848	GCCG	2	8	132977	132984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015848	CCAG	2	8	133626	133633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015848	CTGT	2	8	134044	134051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015848	GCGA	2	8	134230	134237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015848	CGGG	2	8	134273	134280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015848	GCTC	2	8	134785	134792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015848	CGGG	2	8	137497	137504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015848	TTCT	2	8	143414	143421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015848	ACGC	2	8	143486	143493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015848	GGGC	2	8	143578	143585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015848	AGCA	2	8	144658	144665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015848	GCCG	2	8	147464	147471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015848	GCGT	2	8	152008	152015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015848	GCGG	2	8	153074	153081	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015848	GCCG	2	8	155981	155988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015848	CCGG	2	8	159400	159407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015848	GGCT	2	8	161574	161581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015848	CGCA	2	8	161600	161607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015848	TCGT	2	8	165291	165298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015848	CCGG	2	8	165299	165306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015848	CCCG	2	8	165511	165518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_015848	ACTT	2	8	174993	175000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015848	GGAT	2	8	181214	181221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015848	CCAC	2	8	183189	183196	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015848	AGCC	2	8	183236	183243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015848	TTGA	2	8	193390	193397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015848	CTGG	2	8	203377	203384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015848	CTGT	2	8	218984	218991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015848	CGGG	2	8	225070	225077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015848	GATG	2	8	226155	226162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015848	AACT	2	8	237352	237359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015848	GGAA	2	8	237527	237534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015848	ACGT	2	8	238279	238286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015848	ACAT	2	8	238346	238353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015848	TGGA	2	8	238360	238367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015848	GTGC	2	8	248059	248066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015848	GAAC	2	8	255745	255752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015848	CGCA	2	8	260354	260361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015848	GACG	2	8	262763	262770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015848	GCGG	2	8	279673	279680	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015848	CGGC	2	8	281039	281046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015848	TAGA	2	8	295148	295155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015848	ACTT	2	8	298853	298860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015848	TCGT	2	8	300481	300488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015848	AACT	2	8	302531	302538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015848	AACC	2	8	302539	302546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015848	ATGC	2	8	303529	303536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015848	GACG	2	8	308847	308854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015848	TTGC	2	8	316487	316494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015848	GGTC	2	8	316659	316666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015848	TCGG	2	8	316884	316891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015848	CAGC	2	8	317008	317015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015848	CTCG	2	8	329588	329595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015848	GGTA	2	8	342522	342529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015848	GCCG	2	8	342609	342616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015848	TGGC	2	8	342621	342628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015848	GCCG	2	8	345558	345565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015848	TGGC	2	8	345570	345577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015848	AATC	2	8	383515	383522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015848	GGCC	2	8	393875	393882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015848	AAGG	2	8	394891	394898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015848	TGAC	2	8	403861	403868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015848	GTCA	2	8	403872	403879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015848	ATCG	2	8	424861	424868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015848	GCCA	2	8	424952	424959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015848	GTCC	2	8	424978	424985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015848	ACGG	2	8	425064	425071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015848	GAGC	2	8	431846	431853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015848	GAGC	2	8	431897	431904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015848	GAGC	2	8	431948	431955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015848	CACG	2	8	462206	462213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015848	TGCG	2	8	463318	463325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015848	GGGT	2	8	463740	463747	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015848	CGTC	2	8	465031	465038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015848	GCTC	2	8	465255	465262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015848	GTCG	2	8	476780	476787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015848	GGAT	2	8	477548	477555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015848	CGAG	2	8	477691	477698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015848	CGAT	2	8	482466	482473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015848	CCCA	2	8	483065	483072	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_015848	GCCC	2	8	483133	483140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_015848	GCAC	2	8	483685	483692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015848	CAAC	2	8	487554	487561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015848	ACCT	2	8	500680	500687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015848	CGAG	2	8	500915	500922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015848	AGAA	2	8	501141	501148	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015848	GCGG	2	8	513517	513524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015848	ACCG	2	8	515335	515342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015848	CGGG	2	8	515372	515379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015848	GAGG	2	8	517328	517335	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015848	GCGT	2	8	517414	517421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015848	ACGG	2	8	520675	520682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015848	GCAA	2	8	528874	528881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015848	GCTG	2	8	531747	531754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015848	CCGT	2	8	538792	538799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015848	CGGC	2	8	544104	544111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015848	CGGC	2	8	548847	548854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015848	GACG	2	8	548857	548864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015848	CCGA	2	8	555109	555116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015848	AATC	2	8	555537	555544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015848	GTCT	2	8	556159	556166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015848	CGGC	2	8	570160	570167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015848	CCGG	2	8	571095	571102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015848	GTCG	2	8	572905	572912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015848	AGCA	2	8	575237	575244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015848	CGAC	2	8	575907	575914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015848	CGCC	2	8	587801	587808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_015848	GCAT	2	8	587884	587891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015848	GTTT	2	8	596517	596524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015848	GCCG	2	8	601531	601538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015848	GGCG	2	8	606374	606381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015848	TCCC	2	8	606474	606481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_015848	CGAC	2	8	606563	606570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015848	TGGC	2	8	607054	607061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015848	CGGC	2	8	607085	607092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015848	TGCC	2	8	607167	607174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015848	TGGC	2	8	607233	607240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015848	GCTA	2	8	607414	607421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015848	GCGT	2	8	615291	615298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015848	CCGA	2	8	615316	615323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015848	CCGA	2	8	619319	619326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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292	NC_015848	GGGT	2	8	1019784	1019791	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015848	CAGC	2	8	1019800	1019807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_015848	CGGT	2	8	1020581	1020588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_015848	ATGG	2	8	1736323	1736330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015848	CACC	2	8	1760642	1760649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
483	NC_015848	TGAT	2	8	1760794	1760801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_015848	AGCC	2	8	1760960	1760967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_015848	ATCA	2	8	1765744	1765751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_015848	CCCG	2	8	1767620	1767627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
487	NC_015848	GCAG	2	8	1768384	1768391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_015848	GGGC	2	8	1774372	1774379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
489	NC_015848	TGCC	2	8	1777025	1777032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_015848	CCGG	2	8	1777130	1777137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_015848	CACC	2	8	1785644	1785651	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
492	NC_015848	AAGC	2	8	1809814	1809821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_015848	GCCG	2	8	1810628	1810635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_015848	CATG	3	12	1811191	1811202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015848	CGGG	2	8	1815000	1815007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
496	NC_015848	CGGC	2	8	1825666	1825673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_015848	CGAG	2	8	1832700	1832707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015848	TGCC	2	8	1849917	1849924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_015848	CCGA	2	8	1856945	1856952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_015848	ACGT	2	8	1857011	1857018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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