MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 77361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015848	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625034
2	NC_015848	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625034
3	NC_015848	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
4	NC_015848	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
5	NC_015848	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625034
6	NC_015848	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
7	NC_015848	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625034
8	NC_015848	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625034
9	NC_015848	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
10	NC_015848	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625034
11	NC_015848	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
12	NC_015848	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625034
13	NC_015848	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625034
14	NC_015848	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625034
15	NC_015848	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
16	NC_015848	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625034
17	NC_015848	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625034
18	NC_015848	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
19	NC_015848	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625034
20	NC_015848	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
21	NC_015848	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625034
22	NC_015848	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625034
23	NC_015848	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625034
24	NC_015848	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625034
25	NC_015848	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625035
26	NC_015848	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625035
27	NC_015848	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625035
28	NC_015848	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625035
29	NC_015848	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625035
30	NC_015848	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625035
31	NC_015848	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625035
32	NC_015848	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625035
33	NC_015848	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625035
34	NC_015848	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625035
35	NC_015848	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625035
36	NC_015848	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625035
37	NC_015848	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625035
38	NC_015848	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625035
39	NC_015848	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625035
40	NC_015848	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625035
41	NC_015848	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625035
42	NC_015848	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625035
43	NC_015848	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625036
44	NC_015848	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625036
45	NC_015848	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625036
46	NC_015848	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625036
47	NC_015848	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625036
48	NC_015848	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625036
49	NC_015848	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625036
50	NC_015848	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625036
51	NC_015848	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625036
52	NC_015848	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625036
53	NC_015848	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625036
54	NC_015848	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625036
55	NC_015848	CGG	2	6	4043	4048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625036
56	NC_015848	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625036
57	NC_015848	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625036
58	NC_015848	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625036
59	NC_015848	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625036
60	NC_015848	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625036
61	NC_015848	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625036
62	NC_015848	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625036
63	NC_015848	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625036
64	NC_015848	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625036
65	NC_015848	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625036
66	NC_015848	TGC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625037
67	NC_015848	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625037
68	NC_015848	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625037
69	NC_015848	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625037
70	NC_015848	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625037
71	NC_015848	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625037
72	NC_015848	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625037
73	NC_015848	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625038
74	NC_015848	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
75	NC_015848	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625038
76	NC_015848	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625038
77	NC_015848	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625038
78	NC_015848	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
79	NC_015848	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
80	NC_015848	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625038
81	NC_015848	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
82	NC_015848	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
83	NC_015848	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625038
84	NC_015848	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
85	NC_015848	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
86	NC_015848	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625038
87	NC_015848	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625038
88	NC_015848	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
89	NC_015848	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625038
90	NC_015848	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
91	NC_015848	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
92	NC_015848	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625038
93	NC_015848	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625038
94	NC_015848	GTT	2	6	6452	6457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625038
95	NC_015848	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625038
96	NC_015848	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625038
97	NC_015848	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625038
98	NC_015848	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
99	NC_015848	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625038
100	NC_015848	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625038
101	NC_015848	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625038
102	NC_015848	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625038
103	NC_015848	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625038
104	NC_015848	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625038
105	NC_015848	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625038
106	NC_015848	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625038
107	NC_015848	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625038
108	NC_015848	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625038
109	NC_015848	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625039
110	NC_015848	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
111	NC_015848	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
112	NC_015848	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
113	NC_015848	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625039
114	NC_015848	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625039
115	NC_015848	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
116	NC_015848	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
117	NC_015848	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
118	NC_015848	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
119	NC_015848	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
120	NC_015848	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625039
121	NC_015848	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
122	NC_015848	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
123	NC_015848	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625039
124	NC_015848	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
125	NC_015848	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625039
126	NC_015848	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625039
127	NC_015848	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625039
128	NC_015848	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625039
129	NC_015848	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
130	NC_015848	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625039
131	NC_015848	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
132	NC_015848	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625039
133	NC_015848	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
134	NC_015848	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
135	NC_015848	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
136	NC_015848	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625039
137	NC_015848	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
138	NC_015848	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
139	NC_015848	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
140	NC_015848	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625039
141	NC_015848	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
142	NC_015848	CGT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
143	NC_015848	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
144	NC_015848	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
145	NC_015848	TCG	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
146	NC_015848	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625039
147	NC_015848	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625039
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149	NC_015848	GCA	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
150	NC_015848	ACG	2	6	9268	9273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
151	NC_015848	CGA	3	9	9302	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
152	NC_015848	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
153	NC_015848	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
154	NC_015848	GCT	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
155	NC_015848	CGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
156	NC_015848	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625039
157	NC_015848	CGG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
158	NC_015848	CCG	2	6	9569	9574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625039
159	NC_015848	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
160	NC_015848	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625039
161	NC_015848	TGA	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625039
162	NC_015848	GAA	2	6	9759	9764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625039
163	NC_015848	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625039
164	NC_015848	CGC	2	6	9988	9993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625040
165	NC_015848	TGC	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625040
166	NC_015848	GCG	2	6	10026	10031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625040
167	NC_015848	GCC	3	9	10040	10048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625040
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170	NC_015848	GCC	2	6	10332	10337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625040
171	NC_015848	GCG	2	6	10345	10350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625040
172	NC_015848	TTC	2	6	10497	10502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625040
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189	NC_015848	CGG	2	6	12095	12100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625041
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213	NC_015848	TGG	2	6	14394	14399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625045
214	NC_015848	CAT	2	6	14551	14556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625045
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225	NC_015848	CAG	2	6	15184	15189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625046
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238	NC_015848	TCG	2	6	16174	16179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625047
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241	NC_015848	GCC	2	6	16353	16358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625047
242	NC_015848	ACG	2	6	16384	16389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625047
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244	NC_015848	TGC	2	6	16442	16447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625047
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246	NC_015848	GAC	2	6	16522	16527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625047
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248	NC_015848	GGC	2	6	16573	16578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625047
249	NC_015848	CCG	2	6	16616	16621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625047
250	NC_015848	ACG	2	6	16666	16671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625047
251	NC_015848	CGG	2	6	16682	16687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625047
252	NC_015848	CTG	2	6	16892	16897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625047
253	NC_015848	ATG	2	6	16984	16989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625047
254	NC_015848	GAT	2	6	17013	17018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625047
255	NC_015848	TGA	2	6	17026	17031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625047
256	NC_015848	CGG	2	6	17165	17170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625047
257	NC_015848	CGA	2	6	17201	17206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625047
258	NC_015848	GGT	2	6	17213	17218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625047
259	NC_015848	GGT	2	6	17409	17414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625047
260	NC_015848	CGG	2	6	17462	17467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625048
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498	NC_015848	GCC	2	6	31736	31741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625061
499	NC_015848	CTC	2	6	32070	32075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625062
500	NC_015848	CAC	2	6	32085	32090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625062

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