MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015847	TTTTAA	2	12	955977	955988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015847	ATTACA	2	12	957201	957212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
503	NC_015847	ATGGAA	2	12	959247	959258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624188
504	NC_015847	TTAAAA	2	12	959678	959689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015847	TTCTTT	2	12	960290	960301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
506	NC_015847	AGACAC	2	12	962393	962404	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340624191
507	NC_015847	TTGAAT	2	12	963559	963570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340624192
508	NC_015847	TAAAAA	2	12	964746	964757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624194
509	NC_015847	ATCAAA	2	12	964900	964911	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624194
510	NC_015847	GCAATA	2	12	965144	965155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340624194
511	NC_015847	TCAAAA	2	12	965174	965185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624194
512	NC_015847	TATTTT	2	12	965253	965264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624194
513	NC_015847	CCATCC	2	12	969948	969959	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	340624196
514	NC_015847	TACAAT	2	12	970676	970687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624197
515	NC_015847	AGTTGC	2	12	971491	971502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624198
516	NC_015847	CATCCA	2	12	971884	971895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340624199
517	NC_015847	TAAATA	2	12	973522	973533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015847	TTATAT	2	12	973743	973754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624203
519	NC_015847	ATTTCA	2	12	973993	974004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624203
520	NC_015847	CATTTA	2	12	975247	975258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624204
521	NC_015847	TTTTCT	2	12	975261	975272	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340624204
522	NC_015847	CATTTT	2	12	975425	975436	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624205
523	NC_015847	CTGTTG	2	12	975603	975614	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340624205
524	NC_015847	TACATA	2	12	979644	979655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624213
525	NC_015847	AATTAA	2	12	982184	982195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624216
526	NC_015847	TATTAA	2	12	983806	983817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015847	ATTCCA	2	12	984001	984012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340624218
528	NC_015847	CTGCAA	2	12	984341	984352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340624218
529	NC_015847	ACTGCA	2	12	998080	998091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340624233
530	NC_015847	ATTATA	2	12	998700	998711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015847	CCAAAA	2	12	1005959	1005970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340624243
532	NC_015847	ATAAAA	2	12	1007637	1007648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624244
533	NC_015847	TGAAAA	2	12	1008568	1008579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624244
534	NC_015847	TAGTTT	2	12	1014848	1014859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624250
535	NC_015847	TTTTAA	2	12	1015615	1015626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015847	TTCTAC	2	12	1015733	1015744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624251
537	NC_015847	AAAAAC	2	12	1017571	1017582	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340624253
538	NC_015847	TATTCC	2	12	1020905	1020916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624258
539	NC_015847	TAAACT	2	12	1021830	1021841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340624259
540	NC_015847	TTTTAT	2	12	1024002	1024013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624260
541	NC_015847	ATTCCC	2	12	1025077	1025088	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340624261
542	NC_015847	AATGAA	2	12	1029400	1029411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624266
543	NC_015847	AAATAA	2	12	1030111	1030122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015847	AGCAAG	2	12	1034395	1034406	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
545	NC_015847	AAATGT	2	12	1039631	1039642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624276
546	NC_015847	CATTTA	2	12	1041135	1041146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624278
547	NC_015847	CAAAAA	2	12	1048359	1048370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340624287
548	NC_015847	GAAAAA	2	12	1048565	1048576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624287
549	NC_015847	CCTGTT	2	12	1049732	1049743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340624288
550	NC_015847	AATTGG	2	12	1050617	1050628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340624290
551	NC_015847	AATTAA	2	12	1051084	1051095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624290
552	NC_015847	AAATAT	2	12	1054297	1054308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624293
553	NC_015847	TAAAAA	2	12	1055611	1055622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015847	CTGCAT	2	12	1055914	1055925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340624295
555	NC_015847	CTTGTC	2	12	1060579	1060590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340624301
556	NC_015847	AAACTA	2	12	1063469	1063480	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624303
557	NC_015847	TCCAAG	2	12	1065767	1065778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340624305
558	NC_015847	TTCTAT	2	12	1067706	1067717	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624307
559	NC_015847	TTTCTT	2	12	1069105	1069116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340624308
560	NC_015847	GAAAAA	2	12	1072201	1072212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624310
561	NC_015847	AATCGG	2	12	1072215	1072226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340624310
562	NC_015847	CTGAAA	2	12	1073631	1073642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340624311
563	NC_015847	TAAAAA	2	12	1076477	1076488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015847	GGAAAC	2	12	1077760	1077771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340624319
565	NC_015847	TGCAGC	2	12	1085261	1085272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340624328
566	NC_015847	CAATTT	2	12	1086378	1086389	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340624329
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568	NC_015847	GAATAC	2	12	1092858	1092869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340624334
569	NC_015847	TGAAAA	2	12	1094120	1094131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624334
570	NC_015847	GTCGAT	2	12	1094526	1094537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624334
571	NC_015847	GTTGAA	2	12	1098018	1098029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340624337
572	NC_015847	TACAAC	2	12	1099796	1099807	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	340624338
573	NC_015847	GTTTCA	2	12	1101643	1101654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340624340
574	NC_015847	TGCAAC	2	12	1103301	1103312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340624341
575	NC_015847	CAGTTC	2	12	1104576	1104587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340624342
576	NC_015847	TTTTAA	2	12	1105121	1105132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340624343
577	NC_015847	ATCCAT	2	12	1112845	1112856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340624348
578	NC_015847	AAATAC	2	12	1113786	1113797	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340624350
579	NC_015847	AAAAGA	2	12	1114970	1114981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624350
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581	NC_015847	TTGGAA	2	12	1115293	1115304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340624350
582	NC_015847	TTTTTA	2	12	1116923	1116934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340624353
583	NC_015847	AATAAA	2	12	1117479	1117490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015847	ATCTAA	2	12	1117519	1117530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
585	NC_015847	TAAAAT	2	12	1120747	1120758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624355
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587	NC_015847	ATTCTT	2	12	1124568	1124579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_015847	TTTCAT	2	12	1126162	1126173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340624361
589	NC_015847	CGAAAC	2	12	1126640	1126651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340624361
590	NC_015847	TTGAAA	2	12	1126726	1126737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340624361
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592	NC_015847	AATTAA	2	12	1128644	1128655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340624362
593	NC_015847	CAGTTG	2	12	1131354	1131365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624366
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595	NC_015847	AAAATT	2	12	1137793	1137804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015847	GATAGA	2	12	1141795	1141806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340624379
597	NC_015847	TGAAAA	2	12	1142128	1142139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624380
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599	NC_015847	GAAAAA	2	12	1144832	1144843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340624382
600	NC_015847	CATTTG	2	12	1146728	1146739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340624384
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603	NC_015847	TAAAAA	2	12	1153369	1153380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015847	CTTCAA	2	12	1155854	1155865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340624392
605	NC_015847	ATCTTC	2	12	1156248	1156259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624393
606	NC_015847	GGACTT	2	12	1158288	1158299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340624396
607	NC_015847	TTCCAT	2	12	1158521	1158532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340624397
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609	NC_015847	TGAAAA	2	12	1161673	1161684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624400
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611	NC_015847	TGAAAA	2	12	1163439	1163450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340624401
612	NC_015847	ATAAAA	2	12	1166934	1166945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340624404
613	NC_015847	TTATTG	2	12	1167126	1167137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340624404
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615	NC_015847	ATATTT	2	12	1168527	1168538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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