MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 1140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	TGGAA	2	10	5743	5752	40 %	20 %	40 %	0 %	340623186
2	NC_015847	CTGTT	2	10	7991	8000	0 %	60 %	20 %	20 %	340623188
3	NC_015847	ATTTT	2	10	8631	8640	20 %	80 %	0 %	0 %	340623189
4	NC_015847	ATATG	2	10	9746	9755	40 %	40 %	20 %	0 %	340623189
5	NC_015847	AAAAT	2	10	10030	10039	80 %	20 %	0 %	0 %	340623189
6	NC_015847	CATAA	2	10	10117	10126	60 %	20 %	0 %	20 %	340623189
7	NC_015847	AAAAC	2	10	11052	11061	80 %	0 %	0 %	20 %	340623190
8	NC_015847	TAAAA	5	25	12517	12541	80 %	20 %	0 %	0 %	340623192
9	NC_015847	TCAAT	2	10	13673	13682	40 %	40 %	0 %	20 %	340623193
10	NC_015847	TTTTA	2	10	14193	14202	20 %	80 %	0 %	0 %	340623193
11	NC_015847	CAATT	2	10	16917	16926	40 %	40 %	0 %	20 %	340623196
12	NC_015847	TGGAA	2	10	19971	19980	40 %	20 %	40 %	0 %	340623199
13	NC_015847	CTTTT	2	10	21281	21290	0 %	80 %	0 %	20 %	340623201
14	NC_015847	CAGAA	2	10	22878	22887	60 %	0 %	20 %	20 %	340623203
15	NC_015847	CGTAT	2	10	23013	23022	20 %	40 %	20 %	20 %	340623203
16	NC_015847	AAAAC	2	10	23487	23496	80 %	0 %	0 %	20 %	340623203
17	NC_015847	CTAAA	2	10	23752	23761	60 %	20 %	0 %	20 %	340623204
18	NC_015847	AGTGG	2	10	24174	24183	20 %	20 %	60 %	0 %	340623205
19	NC_015847	TATCC	2	10	24360	24369	20 %	40 %	0 %	40 %	340623205
20	NC_015847	AATTT	2	10	25384	25393	40 %	60 %	0 %	0 %	340623207
21	NC_015847	ATTTA	2	10	30421	30430	40 %	60 %	0 %	0 %	340623211
22	NC_015847	ATTTA	2	10	30811	30820	40 %	60 %	0 %	0 %	340623211
23	NC_015847	ACCGT	2	10	31063	31072	20 %	20 %	20 %	40 %	340623211
24	NC_015847	ACTAA	2	10	39780	39789	60 %	20 %	0 %	20 %	340623212
25	NC_015847	TTTTA	2	10	39914	39923	20 %	80 %	0 %	0 %	340623212
26	NC_015847	AAAAT	2	10	40977	40986	80 %	20 %	0 %	0 %	340623213
27	NC_015847	GCACA	2	10	42012	42021	40 %	0 %	20 %	40 %	340623213
28	NC_015847	GTTCA	2	10	42217	42226	20 %	40 %	20 %	20 %	340623213
29	NC_015847	TAAAA	2	10	44482	44491	80 %	20 %	0 %	0 %	340623215
30	NC_015847	ATGCA	2	10	46546	46555	40 %	20 %	20 %	20 %	340623217
31	NC_015847	AAATT	2	10	48963	48972	60 %	40 %	0 %	0 %	340623219
32	NC_015847	AACAA	2	10	51310	51319	80 %	0 %	0 %	20 %	340623222
33	NC_015847	TTTTC	2	10	51702	51711	0 %	80 %	0 %	20 %	340623222
34	NC_015847	AATCA	2	10	52553	52562	60 %	20 %	0 %	20 %	340623223
35	NC_015847	TTTCT	2	10	53722	53731	0 %	80 %	0 %	20 %	340623224
36	NC_015847	GACAG	2	10	54269	54278	40 %	0 %	40 %	20 %	340623224
37	NC_015847	TTTAA	2	10	57579	57588	40 %	60 %	0 %	0 %	340623227
38	NC_015847	TAATT	2	10	57685	57694	40 %	60 %	0 %	0 %	340623227
39	NC_015847	ACTGT	2	10	60779	60788	20 %	40 %	20 %	20 %	340623232
40	NC_015847	AAGAA	2	10	61871	61880	80 %	0 %	20 %	0 %	340623234
41	NC_015847	TATTT	2	10	64870	64879	20 %	80 %	0 %	0 %	340623239
42	NC_015847	TTTTC	2	10	68620	68629	0 %	80 %	0 %	20 %	340623242
43	NC_015847	TATTG	2	10	70007	70016	20 %	60 %	20 %	0 %	340623245
44	NC_015847	TTAAA	2	10	71862	71871	60 %	40 %	0 %	0 %	340623247
45	NC_015847	GGTCA	2	10	72036	72045	20 %	20 %	40 %	20 %	340623248
46	NC_015847	GAACA	2	10	73904	73913	60 %	0 %	20 %	20 %	340623250
47	NC_015847	GATGT	2	10	74201	74210	20 %	40 %	40 %	0 %	340623251
48	NC_015847	ATTCC	2	10	74627	74636	20 %	40 %	0 %	40 %	340623251
49	NC_015847	GGGGA	2	10	82769	82778	20 %	0 %	80 %	0 %	340623259
50	NC_015847	AATAA	2	10	83015	83024	80 %	20 %	0 %	0 %	340623259
51	NC_015847	ATAAA	2	10	83352	83361	80 %	20 %	0 %	0 %	340623259
52	NC_015847	TTTTA	2	10	84101	84110	20 %	80 %	0 %	0 %	340623260
53	NC_015847	AATTA	2	10	86222	86231	60 %	40 %	0 %	0 %	340623262
54	NC_015847	TTTAA	2	10	86374	86383	40 %	60 %	0 %	0 %	340623262
55	NC_015847	CTGTT	2	10	89437	89446	0 %	60 %	20 %	20 %	340623265
56	NC_015847	TCTTT	2	10	90344	90353	0 %	80 %	0 %	20 %	340623266
57	NC_015847	CTATT	2	10	90909	90918	20 %	60 %	0 %	20 %	340623267
58	NC_015847	GTATG	2	10	91660	91669	20 %	40 %	40 %	0 %	340623267
59	NC_015847	TGAAG	2	10	92112	92121	40 %	20 %	40 %	0 %	340623268
60	NC_015847	ATGGA	2	10	99812	99821	40 %	20 %	40 %	0 %	340623277
61	NC_015847	AATAA	2	10	100141	100150	80 %	20 %	0 %	0 %	340623277
62	NC_015847	GAAAT	2	10	100463	100472	60 %	20 %	20 %	0 %	340623277
63	NC_015847	ATTTA	2	10	100688	100697	40 %	60 %	0 %	0 %	340623278
64	NC_015847	AAAAG	2	10	102050	102059	80 %	0 %	20 %	0 %	340623279
65	NC_015847	TTTAT	2	10	103175	103184	20 %	80 %	0 %	0 %	340623281
66	NC_015847	AATTT	2	10	107510	107519	40 %	60 %	0 %	0 %	340623285
67	NC_015847	ATCAT	2	10	109725	109734	40 %	40 %	0 %	20 %	340623287
68	NC_015847	CAGTG	2	10	110718	110727	20 %	20 %	40 %	20 %	340623289
69	NC_015847	CGGAT	2	10	115174	115183	20 %	20 %	40 %	20 %	340623293
70	NC_015847	TTGTT	2	10	115432	115441	0 %	80 %	20 %	0 %	340623294
71	NC_015847	AATTC	2	10	115773	115782	40 %	40 %	0 %	20 %	340623294
72	NC_015847	AAAAT	2	10	117150	117159	80 %	20 %	0 %	0 %	340623295
73	NC_015847	TTTTA	2	10	117483	117492	20 %	80 %	0 %	0 %	340623296
74	NC_015847	GTATT	2	10	117893	117902	20 %	60 %	20 %	0 %	340623296
75	NC_015847	ACACT	2	10	118347	118356	40 %	20 %	0 %	40 %	340623297
76	NC_015847	CTTAA	2	10	119996	120005	40 %	40 %	0 %	20 %	340623298
77	NC_015847	TATTT	2	10	121975	121984	20 %	80 %	0 %	0 %	340623301
78	NC_015847	ATTTT	2	10	122737	122746	20 %	80 %	0 %	0 %	340623303
79	NC_015847	TCCAA	2	10	122914	122923	40 %	20 %	0 %	40 %	340623304
80	NC_015847	AAAAG	2	10	124094	124103	80 %	0 %	20 %	0 %	340623305
81	NC_015847	ACAGA	2	10	128160	128169	60 %	0 %	20 %	20 %	340623308
82	NC_015847	AGCAA	2	10	129301	129310	60 %	0 %	20 %	20 %	340623309
83	NC_015847	TCATA	2	10	129501	129510	40 %	40 %	0 %	20 %	340623309
84	NC_015847	GTTTT	2	10	129887	129896	0 %	80 %	20 %	0 %	340623310
85	NC_015847	GAAAA	2	10	131954	131963	80 %	0 %	20 %	0 %	340623312
86	NC_015847	CTTTT	2	10	132470	132479	0 %	80 %	0 %	20 %	340623313
87	NC_015847	GAGAA	2	10	133147	133156	60 %	0 %	40 %	0 %	340623313
88	NC_015847	TAAAA	2	10	133896	133905	80 %	20 %	0 %	0 %	340623314
89	NC_015847	AAAAT	2	10	136004	136013	80 %	20 %	0 %	0 %	340623316
90	NC_015847	AAAAT	2	10	138717	138726	80 %	20 %	0 %	0 %	340623319
91	NC_015847	TTTTG	2	10	138743	138752	0 %	80 %	20 %	0 %	340623319
92	NC_015847	ATGGG	2	10	139084	139093	20 %	20 %	60 %	0 %	340623319
93	NC_015847	TTCAC	2	10	142112	142121	20 %	40 %	0 %	40 %	340623320
94	NC_015847	ATTTT	2	10	145444	145453	20 %	80 %	0 %	0 %	340623322
95	NC_015847	CCTGA	2	10	145779	145788	20 %	20 %	20 %	40 %	340623322
96	NC_015847	ATAAC	2	10	150286	150295	60 %	20 %	0 %	20 %	340623327
97	NC_015847	AAAAG	2	10	150521	150530	80 %	0 %	20 %	0 %	340623327
98	NC_015847	ACTGG	2	10	152976	152985	20 %	20 %	40 %	20 %	340623329
99	NC_015847	AAATG	2	10	153678	153687	60 %	20 %	20 %	0 %	340623329
100	NC_015847	GAAAA	2	10	154001	154010	80 %	0 %	20 %	0 %	340623329
101	NC_015847	GACTG	2	10	156097	156106	20 %	20 %	40 %	20 %	340623331
102	NC_015847	TTTTC	2	10	158935	158944	0 %	80 %	0 %	20 %	340623335
103	NC_015847	TTGAT	2	10	159696	159705	20 %	60 %	20 %	0 %	340623335
104	NC_015847	AAAAC	2	10	163797	163806	80 %	0 %	0 %	20 %	340623341
105	NC_015847	TAATT	2	10	163970	163979	40 %	60 %	0 %	0 %	340623342
106	NC_015847	TTTCT	2	10	165236	165245	0 %	80 %	0 %	20 %	340623342
107	NC_015847	CAAGT	2	10	166042	166051	40 %	20 %	20 %	20 %	340623343
108	NC_015847	ATTAA	2	10	167975	167984	60 %	40 %	0 %	0 %	340623346
109	NC_015847	GCTTC	2	10	168957	168966	0 %	40 %	20 %	40 %	340623347
110	NC_015847	TCCCG	2	10	170727	170736	0 %	20 %	20 %	60 %	340623349
111	NC_015847	AAAAT	2	10	171157	171166	80 %	20 %	0 %	0 %	340623349
112	NC_015847	ACTGC	2	10	171447	171456	20 %	20 %	20 %	40 %	340623349
113	NC_015847	GGAAT	2	10	176627	176636	40 %	20 %	40 %	0 %	340623356
114	NC_015847	TGGAT	2	10	177867	177876	20 %	40 %	40 %	0 %	340623356
115	NC_015847	TAAAT	2	10	182813	182822	60 %	40 %	0 %	0 %	340623361
116	NC_015847	GATTG	2	10	182917	182926	20 %	40 %	40 %	0 %	340623361
117	NC_015847	CTTTT	2	10	190172	190181	0 %	80 %	0 %	20 %	340623369
118	NC_015847	CTTAT	2	10	192865	192874	20 %	60 %	0 %	20 %	340623372
119	NC_015847	ATTTT	2	10	194598	194607	20 %	80 %	0 %	0 %	340623374
120	NC_015847	TAATT	2	10	197289	197298	40 %	60 %	0 %	0 %	340623377
121	NC_015847	ATTTT	2	10	197969	197978	20 %	80 %	0 %	0 %	340623378
122	NC_015847	GGATA	2	10	201153	201162	40 %	20 %	40 %	0 %	340623382
123	NC_015847	ATAAA	2	10	201335	201344	80 %	20 %	0 %	0 %	340623382
124	NC_015847	TATTT	2	10	201609	201618	20 %	80 %	0 %	0 %	340623382
125	NC_015847	TTAAA	2	10	201845	201854	60 %	40 %	0 %	0 %	340623382
126	NC_015847	TGGAA	2	10	203240	203249	40 %	20 %	40 %	0 %	340623383
127	NC_015847	TTTAA	2	10	206687	206696	40 %	60 %	0 %	0 %	340623388
128	NC_015847	AAATA	2	10	208134	208143	80 %	20 %	0 %	0 %	340623389
129	NC_015847	AAAAT	2	10	208339	208348	80 %	20 %	0 %	0 %	340623389
130	NC_015847	ATTTA	2	10	209055	209064	40 %	60 %	0 %	0 %	340623389
131	NC_015847	GAATT	2	10	209244	209253	40 %	40 %	20 %	0 %	340623390
132	NC_015847	AGTTT	2	10	211508	211517	20 %	60 %	20 %	0 %	340623392
133	NC_015847	TTCAA	2	10	212132	212141	40 %	40 %	0 %	20 %	340623393
134	NC_015847	AATAT	2	10	212404	212413	60 %	40 %	0 %	0 %	340623393
135	NC_015847	AAACC	2	10	214278	214287	60 %	0 %	0 %	40 %	340623395
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