MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 4363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015847	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015847	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015847	TGCA	2	8	5860	5867	25 %	25 %	25 %	25 %	340623186
5	NC_015847	AATT	2	8	6270	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	340623186
6	NC_015847	AATT	2	8	6479	6486	50 %	50 %	0 %	0 %	340623187
7	NC_015847	TAGA	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	340623188
8	NC_015847	AATC	2	8	7818	7825	50 %	25 %	0 %	25 %	340623188
9	NC_015847	ATTT	2	8	7924	7931	25 %	75 %	0 %	0 %	340623188
10	NC_015847	AATT	2	8	8254	8261	50 %	50 %	0 %	0 %	340623188
11	NC_015847	AATT	2	8	8857	8864	50 %	50 %	0 %	0 %	340623189
12	NC_015847	AATA	2	8	9772	9779	75 %	25 %	0 %	0 %	340623189
13	NC_015847	TTAA	2	8	10188	10195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015847	TAAA	2	8	10199	10206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015847	TGGA	2	8	10291	10298	25 %	25 %	50 %	0 %	340623190
16	NC_015847	TAAT	2	8	10461	10468	50 %	50 %	0 %	0 %	340623190
17	NC_015847	GAAG	2	8	10610	10617	50 %	0 %	50 %	0 %	340623190
18	NC_015847	AATT	2	8	10797	10804	50 %	50 %	0 %	0 %	340623190
19	NC_015847	TTCA	2	8	10962	10969	25 %	50 %	0 %	25 %	340623190
20	NC_015847	AAAT	2	8	11691	11698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015847	AATA	2	8	12336	12343	75 %	25 %	0 %	0 %	340623192
22	NC_015847	CTGA	2	8	12427	12434	25 %	25 %	25 %	25 %	340623192
23	NC_015847	ATTT	2	8	12546	12553	25 %	75 %	0 %	0 %	340623193
24	NC_015847	GTAT	2	8	12760	12767	25 %	50 %	25 %	0 %	340623193
25	NC_015847	TTTA	2	8	13296	13303	25 %	75 %	0 %	0 %	340623193
26	NC_015847	CTTT	2	8	13658	13665	0 %	75 %	0 %	25 %	340623193
27	NC_015847	TAAA	2	8	14204	14211	75 %	25 %	0 %	0 %	340623193
28	NC_015847	ATTT	2	8	15388	15395	25 %	75 %	0 %	0 %	340623194
29	NC_015847	TCAA	2	8	15398	15405	50 %	25 %	0 %	25 %	340623194
30	NC_015847	TATT	2	8	15940	15947	25 %	75 %	0 %	0 %	340623196
31	NC_015847	CTTG	2	8	16072	16079	0 %	50 %	25 %	25 %	340623196
32	NC_015847	TTCC	2	8	16151	16158	0 %	50 %	0 %	50 %	340623196
33	NC_015847	ATTT	2	8	16227	16234	25 %	75 %	0 %	0 %	340623196
34	NC_015847	AGGA	2	8	16385	16392	50 %	0 %	50 %	0 %	340623196
35	NC_015847	ATTT	2	8	16716	16723	25 %	75 %	0 %	0 %	340623196
36	NC_015847	ATTA	2	8	16737	16744	50 %	50 %	0 %	0 %	340623196
37	NC_015847	AGAA	2	8	17324	17331	75 %	0 %	25 %	0 %	340623197
38	NC_015847	TAGT	2	8	17536	17543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015847	CTTT	2	8	17921	17928	0 %	75 %	0 %	25 %	340623198
40	NC_015847	ATAC	2	8	18120	18127	50 %	25 %	0 %	25 %	340623198
41	NC_015847	ATGG	2	8	18242	18249	25 %	25 %	50 %	0 %	340623198
42	NC_015847	TAAA	2	8	18618	18625	75 %	25 %	0 %	0 %	340623198
43	NC_015847	GAAA	2	8	18634	18641	75 %	0 %	25 %	0 %	340623198
44	NC_015847	CTTT	2	8	19073	19080	0 %	75 %	0 %	25 %	340623199
45	NC_015847	CATT	2	8	19438	19445	25 %	50 %	0 %	25 %	340623199
46	NC_015847	ATTC	2	8	20630	20637	25 %	50 %	0 %	25 %	340623200
47	NC_015847	TTAT	2	8	20986	20993	25 %	75 %	0 %	0 %	340623200
48	NC_015847	TAAT	2	8	21070	21077	50 %	50 %	0 %	0 %	340623201
49	NC_015847	CTTT	2	8	22208	22215	0 %	75 %	0 %	25 %	340623202
50	NC_015847	AAAT	2	8	22436	22443	75 %	25 %	0 %	0 %	340623202
51	NC_015847	TAAA	2	8	23515	23522	75 %	25 %	0 %	0 %	340623203
52	NC_015847	ATTT	2	8	23657	23664	25 %	75 %	0 %	0 %	340623204
53	NC_015847	TGTT	2	8	24149	24156	0 %	75 %	25 %	0 %	340623205
54	NC_015847	ATAA	2	8	24189	24196	75 %	25 %	0 %	0 %	340623205
55	NC_015847	ATAG	2	8	24420	24427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015847	ATTT	2	8	24954	24961	25 %	75 %	0 %	0 %	340623206
57	NC_015847	TATT	2	8	26041	26048	25 %	75 %	0 %	0 %	340623208
58	NC_015847	CCTG	2	8	26380	26387	0 %	25 %	25 %	50 %	340623208
59	NC_015847	TACT	2	8	26633	26640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015847	AAGG	2	8	26923	26930	50 %	0 %	50 %	0 %	340623209
61	NC_015847	ATTT	2	8	26936	26943	25 %	75 %	0 %	0 %	340623209
62	NC_015847	TTTA	2	8	27024	27031	25 %	75 %	0 %	0 %	340623209
63	NC_015847	ACAA	2	8	27508	27515	75 %	0 %	0 %	25 %	340623209
64	NC_015847	AATA	2	8	27873	27880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015847	CTTT	2	8	28034	28041	0 %	75 %	0 %	25 %	340623210
66	NC_015847	TTCC	2	8	28764	28771	0 %	50 %	0 %	50 %	340623211
67	NC_015847	CATC	2	8	28878	28885	25 %	25 %	0 %	50 %	340623211
68	NC_015847	ATCT	2	8	29130	29137	25 %	50 %	0 %	25 %	340623211
69	NC_015847	TATC	2	8	29883	29890	25 %	50 %	0 %	25 %	340623211
70	NC_015847	GTTT	2	8	30898	30905	0 %	75 %	25 %	0 %	340623211
71	NC_015847	ATCT	2	8	31098	31105	25 %	50 %	0 %	25 %	340623211
72	NC_015847	AAAT	2	8	31190	31197	75 %	25 %	0 %	0 %	340623211
73	NC_015847	TTCT	2	8	31517	31524	0 %	75 %	0 %	25 %	340623211
74	NC_015847	TTGT	2	8	31719	31726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015847	GCCT	2	8	31802	31809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015847	ATTC	2	8	31950	31957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015847	TGGG	2	8	31980	31987	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015847	CAAC	2	8	32549	32556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015847	GGCT	2	8	32818	32825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015847	TCCT	2	8	35798	35805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015847	AAAT	2	8	38039	38046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015847	TTTC	2	8	38989	38996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015847	CATT	2	8	39349	39356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015847	AAAT	2	8	39766	39773	75 %	25 %	0 %	0 %	340623212
85	NC_015847	GCAA	2	8	40017	40024	50 %	0 %	25 %	25 %	340623212
86	NC_015847	CGTC	2	8	40345	40352	0 %	25 %	25 %	50 %	340623212
87	NC_015847	AATT	2	8	40939	40946	50 %	50 %	0 %	0 %	340623213
88	NC_015847	AATT	2	8	41324	41331	50 %	50 %	0 %	0 %	340623213
89	NC_015847	GATC	2	8	41988	41995	25 %	25 %	25 %	25 %	340623213
90	NC_015847	TTGA	2	8	42102	42109	25 %	50 %	25 %	0 %	340623213
91	NC_015847	TTTA	2	8	42196	42203	25 %	75 %	0 %	0 %	340623213
92	NC_015847	TAAT	2	8	42748	42755	50 %	50 %	0 %	0 %	340623214
93	NC_015847	AAAC	2	8	43204	43211	75 %	0 %	0 %	25 %	340623214
94	NC_015847	GATA	2	8	43793	43800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015847	ATTA	2	8	44352	44359	50 %	50 %	0 %	0 %	340623215
96	NC_015847	TATT	2	8	44844	44851	25 %	75 %	0 %	0 %	340623215
97	NC_015847	ATTT	2	8	44903	44910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015847	ATTA	2	8	44926	44933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015847	ATTA	2	8	45069	45076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015847	TAAT	2	8	45106	45113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015847	ATTT	2	8	45153	45160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015847	AAAG	2	8	46442	46449	75 %	0 %	25 %	0 %	340623216
103	NC_015847	TGGT	2	8	46994	47001	0 %	50 %	50 %	0 %	340623217
104	NC_015847	ATAA	2	8	48122	48129	75 %	25 %	0 %	0 %	340623218
105	NC_015847	TTTA	2	8	49693	49700	25 %	75 %	0 %	0 %	340623220
106	NC_015847	AAAT	2	8	49702	49709	75 %	25 %	0 %	0 %	340623220
107	NC_015847	ATTA	2	8	49733	49740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015847	CATA	2	8	49814	49821	50 %	25 %	0 %	25 %	340623221
109	NC_015847	CCTG	2	8	50179	50186	0 %	25 %	25 %	50 %	340623221
110	NC_015847	TTTC	2	8	50244	50251	0 %	75 %	0 %	25 %	340623221
111	NC_015847	ACCC	2	8	51023	51030	25 %	0 %	0 %	75 %	340623222
112	NC_015847	TACT	2	8	51503	51510	25 %	50 %	0 %	25 %	340623222
113	NC_015847	TTTC	2	8	51577	51584	0 %	75 %	0 %	25 %	340623222
114	NC_015847	CTTT	2	8	51835	51842	0 %	75 %	0 %	25 %	340623223
115	NC_015847	CATC	2	8	52167	52174	25 %	25 %	0 %	50 %	340623223
116	NC_015847	TTCA	2	8	53219	53226	25 %	50 %	0 %	25 %	340623223
117	NC_015847	AAAT	2	8	53698	53705	75 %	25 %	0 %	0 %	340623224
118	NC_015847	TGCA	2	8	53788	53795	25 %	25 %	25 %	25 %	340623224
119	NC_015847	TAAT	2	8	53839	53846	50 %	50 %	0 %	0 %	340623224
120	NC_015847	TTTC	2	8	53955	53962	0 %	75 %	0 %	25 %	340623224
121	NC_015847	AAAT	2	8	54182	54189	75 %	25 %	0 %	0 %	340623224
122	NC_015847	TCTT	2	8	54352	54359	0 %	75 %	0 %	25 %	340623224
123	NC_015847	TTCA	2	8	54467	54474	25 %	50 %	0 %	25 %	340623225
124	NC_015847	AATT	2	8	54976	54983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015847	AATT	2	8	55306	55313	50 %	50 %	0 %	0 %	340623226
126	NC_015847	ATTA	2	8	55565	55572	50 %	50 %	0 %	0 %	340623226
127	NC_015847	TGAT	2	8	55645	55652	25 %	50 %	25 %	0 %	340623226
128	NC_015847	ATTT	2	8	56306	56313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015847	GGAA	2	8	56388	56395	50 %	0 %	50 %	0 %	340623227
130	NC_015847	ATTA	2	8	56723	56730	50 %	50 %	0 %	0 %	340623227
131	NC_015847	AAAT	2	8	56744	56751	75 %	25 %	0 %	0 %	340623227
132	NC_015847	AATG	2	8	57419	57426	50 %	25 %	25 %	0 %	340623227
133	NC_015847	AAAG	2	8	57858	57865	75 %	0 %	25 %	0 %	340623228
134	NC_015847	ATTA	2	8	58531	58538	50 %	50 %	0 %	0 %	340623228
135	NC_015847	ACAT	2	8	58922	58929	50 %	25 %	0 %	25 %	340623229
136	NC_015847	AAGT	2	8	59285	59292	50 %	25 %	25 %	0 %	340623230
137	NC_015847	CTTT	2	8	59366	59373	0 %	75 %	0 %	25 %	340623230
138	NC_015847	AATG	2	8	59532	59539	50 %	25 %	25 %	0 %	340623230
139	NC_015847	ATTT	2	8	59556	59563	25 %	75 %	0 %	0 %	340623230
140	NC_015847	GATG	2	8	60044	60051	25 %	25 %	50 %	0 %	340623230
141	NC_015847	AAAT	2	8	60426	60433	75 %	25 %	0 %	0 %	340623231
142	NC_015847	TGTA	2	8	60624	60631	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_015847	AAAT	2	8	61040	61047	75 %	25 %	0 %	0 %	340623232
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