MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 2582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	CCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015847	AGG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015847	CTC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015847	TCT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015847	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015847	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015847	ACG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015847	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015847	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015847	CCT	2	6	863	868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015847	AGG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015847	GTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015847	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015847	CCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015847	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015847	TTA	2	6	1605	1610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015847	AAG	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015847	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015847	TAC	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015847	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015847	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015847	CTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015847	CGA	3	9	2186	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015847	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015847	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015847	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015847	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015847	TTG	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015847	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015847	GAC	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015847	AAG	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015847	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015847	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015847	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015847	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015847	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015847	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015847	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015847	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015847	CAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015847	GTC	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015847	TCA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015847	GGC	2	6	4001	4006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015847	GGT	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015847	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015847	CCA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015847	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015847	CTG	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015847	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015847	CCA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015847	TAT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015847	CGG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015847	TAG	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015847	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015847	TAA	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015847	ATT	2	6	7578	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015847	TAA	2	6	11401	11406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015847	ATA	2	6	11624	11629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015847	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015847	ATA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015847	ATA	2	6	22729	22734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015847	GTT	2	6	22755	22760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015847	ATT	2	6	23623	23628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015847	TAA	2	6	23904	23909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015847	TAA	2	6	24398	24403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015847	TAA	2	6	24443	24448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015847	TAA	3	9	24478	24486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015847	GAA	2	6	24490	24495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015847	ATA	2	6	26650	26655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015847	ATT	2	6	26671	26676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015847	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015847	ACC	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015847	AGA	2	6	28190	28195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015847	AAT	2	6	28212	28217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015847	TCC	2	6	31995	32000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015847	CCA	2	6	32107	32112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015847	AGG	2	6	32136	32141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015847	CTC	2	6	32178	32183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015847	TCT	2	6	32341	32346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015847	GCT	2	6	32438	32443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015847	CAG	2	6	32539	32544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015847	ACG	2	6	32564	32569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015847	CTG	2	6	32625	32630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015847	CAA	2	6	32807	32812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015847	CCT	2	6	32880	32885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015847	AGG	2	6	32897	32902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015847	GTG	2	6	32972	32977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015847	CCG	2	6	33242	33247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015847	CCT	2	6	33581	33586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015847	TCA	2	6	33597	33602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015847	TTA	2	6	33622	33627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015847	AAG	2	6	33764	33769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015847	CGG	2	6	33836	33841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015847	TAC	3	9	33869	33877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015847	CGG	2	6	33978	33983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015847	GCT	2	6	34056	34061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015847	CTG	2	6	34077	34082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015847	CGA	3	9	34203	34211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015847	TTC	2	6	34244	34249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015847	ACC	2	6	34255	34260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015847	AGA	2	6	34373	34378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015847	CAA	2	6	34392	34397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015847	TTG	2	6	34521	34526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015847	CAA	2	6	34568	34573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015847	GAC	2	6	34602	34607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015847	AAG	2	6	34936	34941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015847	TAA	2	6	35005	35010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015847	ATA	2	6	35291	35296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015847	CGG	2	6	35330	35335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015847	GCG	2	6	35367	35372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015847	TAG	2	6	35426	35431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015847	AGG	2	6	35451	35456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015847	GTG	2	6	35567	35572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015847	TAT	2	6	35616	35621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015847	TAC	2	6	35632	35637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015847	GGA	2	6	35847	35852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015847	CAC	2	6	35935	35940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015847	GTC	2	6	35961	35966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015847	TCA	2	6	35977	35982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015847	GGC	2	6	36099	36104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015847	GGT	2	6	36266	36271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015847	CAG	2	6	36338	36343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015847	CCA	2	6	36432	36437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015847	GCT	2	6	36461	36466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015847	CTG	2	6	36586	36591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015847	TGG	2	6	36670	36675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015847	CCA	2	6	36685	36690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015847	TAT	2	6	36772	36777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015847	CGG	2	6	36899	36904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015847	TAG	2	6	36918	36923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015847	ATA	2	6	37067	37072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015847	AAT	2	6	37142	37147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015847	AAT	2	6	37219	37224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015847	CTA	2	6	37283	37288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015847	TCA	2	6	37373	37378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015847	AAC	2	6	37480	37485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015847	TAA	2	6	37504	37509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015847	GAA	2	6	37574	37579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015847	TCG	2	6	37664	37669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015847	ATT	2	6	37738	37743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015847	TGT	2	6	37872	37877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015847	AAC	2	6	38104	38109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015847	ATA	2	6	38112	38117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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