MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Capnocytophaga canimorsus Cc5 chromosome

Total Repeats: 2258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015846	ATTTC	2	10	1048	1057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015846	TTTTA	2	10	1785	1794	20 %	80 %	0 %	0 %	340620782
3	NC_015846	AGAAA	2	10	1884	1893	80 %	0 %	20 %	0 %	340620782
4	NC_015846	CTTCA	2	10	2025	2034	20 %	40 %	0 %	40 %	340620782
5	NC_015846	CTATT	2	10	2459	2468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015846	AATTA	2	10	3196	3205	60 %	40 %	0 %	0 %	340620783
7	NC_015846	TGATT	2	10	3450	3459	20 %	60 %	20 %	0 %	340620784
8	NC_015846	CCAAT	2	10	4358	4367	40 %	20 %	0 %	40 %	340620785
9	NC_015846	AAATA	2	10	4482	4491	80 %	20 %	0 %	0 %	340620785
10	NC_015846	AATCA	2	10	4588	4597	60 %	20 %	0 %	20 %	340620786
11	NC_015846	TTTAT	2	10	5959	5968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015846	TCAAA	2	10	6347	6356	60 %	20 %	0 %	20 %	340620787
13	NC_015846	CAAAC	2	10	6665	6674	60 %	0 %	0 %	40 %	340620787
14	NC_015846	CTTTA	2	10	6918	6927	20 %	60 %	0 %	20 %	340620787
15	NC_015846	CATCA	2	10	7443	7452	40 %	20 %	0 %	40 %	340620788
16	NC_015846	AAAAT	2	10	9393	9402	80 %	20 %	0 %	0 %	340620789
17	NC_015846	TTTGT	2	10	9648	9657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015846	ATAAA	2	10	9888	9897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015846	GTTCG	2	10	11003	11012	0 %	40 %	40 %	20 %	340620790
20	NC_015846	TGAAA	2	10	12746	12755	60 %	20 %	20 %	0 %	340620790
21	NC_015846	ATTAT	2	10	14192	14201	40 %	60 %	0 %	0 %	340620791
22	NC_015846	TTTGT	2	10	14853	14862	0 %	80 %	20 %	0 %	340620792
23	NC_015846	GAGTT	2	10	15100	15109	20 %	40 %	40 %	0 %	340620792
24	NC_015846	TTTTC	2	10	19206	19215	0 %	80 %	0 %	20 %	340620796
25	NC_015846	CAAAT	2	10	20721	20730	60 %	20 %	0 %	20 %	340620797
26	NC_015846	AATAC	2	10	20857	20866	60 %	20 %	0 %	20 %	340620797
27	NC_015846	AAACG	2	10	22048	22057	60 %	0 %	20 %	20 %	340620798
28	NC_015846	CAAGG	2	10	22521	22530	40 %	0 %	40 %	20 %	340620799
29	NC_015846	TATCC	2	10	23040	23049	20 %	40 %	0 %	40 %	340620800
30	NC_015846	ATATA	2	10	24719	24728	60 %	40 %	0 %	0 %	340620801
31	NC_015846	ATTAA	2	10	25974	25983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015846	TTTTA	2	10	25989	25998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015846	TGTAA	2	10	28185	28194	40 %	40 %	20 %	0 %	340620808
34	NC_015846	CCATA	2	10	29222	29231	40 %	20 %	0 %	40 %	340620808
35	NC_015846	AAATC	2	10	30398	30407	60 %	20 %	0 %	20 %	340620809
36	NC_015846	TTGCT	2	10	32358	32367	0 %	60 %	20 %	20 %	340620810
37	NC_015846	ATTTG	2	10	34200	34209	20 %	60 %	20 %	0 %	340620811
38	NC_015846	ACCAA	2	10	34602	34611	60 %	0 %	0 %	40 %	340620811
39	NC_015846	TTGCT	2	10	34656	34665	0 %	60 %	20 %	20 %	340620811
40	NC_015846	TTGTT	2	10	37207	37216	0 %	80 %	20 %	0 %	340620813
41	NC_015846	ATTTT	2	10	37817	37826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015846	TTTCG	2	10	38691	38700	0 %	60 %	20 %	20 %	340620815
43	NC_015846	TAAAA	2	10	39422	39431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015846	CAAAT	2	10	40909	40918	60 %	20 %	0 %	20 %	340620818
45	NC_015846	ATAAA	2	10	41940	41949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015846	ACTTG	2	10	43737	43746	20 %	40 %	20 %	20 %	340620819
47	NC_015846	AGCCG	2	10	44485	44494	20 %	0 %	40 %	40 %	340620819
48	NC_015846	ATTCC	2	10	44939	44948	20 %	40 %	0 %	40 %	340620819
49	NC_015846	AAGGC	2	10	47333	47342	40 %	0 %	40 %	20 %	340620821
50	NC_015846	AATTT	2	10	48502	48511	40 %	60 %	0 %	0 %	340620822
51	NC_015846	CTTTT	2	10	49208	49217	0 %	80 %	0 %	20 %	340620822
52	NC_015846	AATGA	2	10	50993	51002	60 %	20 %	20 %	0 %	340620823
53	NC_015846	AACAA	2	10	51100	51109	80 %	0 %	0 %	20 %	340620823
54	NC_015846	AAAAG	2	10	52315	52324	80 %	0 %	20 %	0 %	340620824
55	NC_015846	TGAAA	2	10	53361	53370	60 %	20 %	20 %	0 %	340620825
56	NC_015846	ATTTC	2	10	55283	55292	20 %	60 %	0 %	20 %	340620828
57	NC_015846	CCGTT	2	10	57653	57662	0 %	40 %	20 %	40 %	340620830
58	NC_015846	CGAAG	2	10	59143	59152	40 %	0 %	40 %	20 %	340620830
59	NC_015846	TTTCA	2	10	60159	60168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015846	TAAAA	2	10	61036	61045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015846	GGATT	2	10	61349	61358	20 %	40 %	40 %	0 %	340620832
62	NC_015846	ATTTT	2	10	63631	63640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015846	TTACT	2	10	63750	63759	20 %	60 %	0 %	20 %	340620834
64	NC_015846	TGATT	2	10	64246	64255	20 %	60 %	20 %	0 %	340620834
65	NC_015846	TAAAT	2	10	65681	65690	60 %	40 %	0 %	0 %	340620835
66	NC_015846	AAATA	2	10	69563	69572	80 %	20 %	0 %	0 %	340620838
67	NC_015846	AAATA	2	10	71676	71685	80 %	20 %	0 %	0 %	340620838
68	NC_015846	CATCA	2	10	73518	73527	40 %	20 %	0 %	40 %	340620838
69	NC_015846	TCAAA	2	10	77386	77395	60 %	20 %	0 %	20 %	340620838
70	NC_015846	TTTGG	2	10	78712	78721	0 %	60 %	40 %	0 %	340620840
71	NC_015846	AGGGG	2	10	81672	81681	20 %	0 %	80 %	0 %	340620841
72	NC_015846	AATAG	2	10	83125	83134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015846	AAAAT	2	10	83384	83393	80 %	20 %	0 %	0 %	340620844
74	NC_015846	AACAA	2	10	83711	83720	80 %	0 %	0 %	20 %	340620845
75	NC_015846	AATTG	2	10	83935	83944	40 %	40 %	20 %	0 %	340620845
76	NC_015846	ATAAA	2	10	84849	84858	80 %	20 %	0 %	0 %	340620846
77	NC_015846	GTTTT	2	10	86721	86730	0 %	80 %	20 %	0 %	340620846
78	NC_015846	AAGAT	2	10	87552	87561	60 %	20 %	20 %	0 %	340620846
79	NC_015846	TGGTT	2	10	87652	87661	0 %	60 %	40 %	0 %	340620846
80	NC_015846	ACAAA	2	10	88808	88817	80 %	0 %	0 %	20 %	340620848
81	NC_015846	AAAAG	2	10	89259	89268	80 %	0 %	20 %	0 %	340620848
82	NC_015846	TAGCA	2	10	89955	89964	40 %	20 %	20 %	20 %	340620848
83	NC_015846	TTTGG	2	10	92603	92612	0 %	60 %	40 %	0 %	340620850
84	NC_015846	TTTTA	2	10	93111	93120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015846	GAAGA	2	10	95324	95333	60 %	0 %	40 %	0 %	340620853
86	NC_015846	TTTTG	2	10	96732	96741	0 %	80 %	20 %	0 %	340620855
87	NC_015846	ATTTT	2	10	97311	97320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015846	CATCA	2	10	97882	97891	40 %	20 %	0 %	40 %	340620857
89	NC_015846	CATTA	2	10	100706	100715	40 %	40 %	0 %	20 %	340620860
90	NC_015846	AAAAG	2	10	102005	102014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015846	CCTTT	2	10	102408	102417	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015846	CAATG	2	10	102811	102820	40 %	20 %	20 %	20 %	340620863
93	NC_015846	TCTTT	2	10	104407	104416	0 %	80 %	0 %	20 %	340620864
94	NC_015846	ATCAC	2	10	104982	104991	40 %	20 %	0 %	40 %	340620865
95	NC_015846	CGCCA	2	10	105852	105861	20 %	0 %	20 %	60 %	340620866
96	NC_015846	TAATT	2	10	106174	106183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015846	TAAAA	2	10	109096	109105	80 %	20 %	0 %	0 %	340620871
98	NC_015846	GTTAC	2	10	109661	109670	20 %	40 %	20 %	20 %	340620872
99	NC_015846	TGGTG	2	10	109840	109849	0 %	40 %	60 %	0 %	340620872
100	NC_015846	GATTG	2	10	110216	110225	20 %	40 %	40 %	0 %	340620872
101	NC_015846	ATTTT	2	10	111308	111317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015846	CCAAA	2	10	111894	111903	60 %	0 %	0 %	40 %	340620875
103	NC_015846	TTGGT	2	10	114627	114636	0 %	60 %	40 %	0 %	340620878
104	NC_015846	GATTG	2	10	114874	114883	20 %	40 %	40 %	0 %	340620878
105	NC_015846	ATACA	2	10	114945	114954	60 %	20 %	0 %	20 %	340620878
106	NC_015846	GAACC	2	10	117291	117300	40 %	0 %	20 %	40 %	340620880
107	NC_015846	TCGAA	2	10	120572	120581	40 %	20 %	20 %	20 %	340620882
108	NC_015846	CCTAA	2	10	120967	120976	40 %	20 %	0 %	40 %	340620882
109	NC_015846	GGCAG	2	10	122457	122466	20 %	0 %	60 %	20 %	340620884
110	NC_015846	CAAAA	2	10	122683	122692	80 %	0 %	0 %	20 %	340620884
111	NC_015846	ATCGC	2	10	122989	122998	20 %	20 %	20 %	40 %	340620885
112	NC_015846	GGTGT	2	10	123403	123412	0 %	40 %	60 %	0 %	340620886
113	NC_015846	CCTTT	2	10	124403	124412	0 %	60 %	0 %	40 %	340620886
114	NC_015846	GGCAA	2	10	124728	124737	40 %	0 %	40 %	20 %	340620886
115	NC_015846	AAAAC	2	10	125613	125622	80 %	0 %	0 %	20 %	340620886
116	NC_015846	TTATA	2	10	125957	125966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015846	TGAAG	2	10	127254	127263	40 %	20 %	40 %	0 %	340620888
118	NC_015846	AAATA	2	10	127386	127395	80 %	20 %	0 %	0 %	340620888
119	NC_015846	GCTTT	2	10	128852	128861	0 %	60 %	20 %	20 %	340620888
120	NC_015846	AAAGG	2	10	132629	132638	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015846	CCTTT	2	10	132657	132666	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015846	AGAAA	2	10	134179	134188	80 %	0 %	20 %	0 %	340620892
123	NC_015846	ATAAG	2	10	135413	135422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015846	ATTGG	2	10	135520	135529	20 %	40 %	40 %	0 %	340620893
125	NC_015846	ATTGT	2	10	136713	136722	20 %	60 %	20 %	0 %	340620895
126	NC_015846	AAACA	2	10	141602	141611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015846	TTCCA	2	10	141780	141789	20 %	40 %	0 %	40 %	340620900
128	NC_015846	CCCTA	2	10	142877	142886	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_015846	ATTAA	2	10	143180	143189	60 %	40 %	0 %	0 %	340620901
130	NC_015846	TTATT	2	10	143568	143577	20 %	80 %	0 %	0 %	340620901
131	NC_015846	TGAAA	2	10	144109	144118	60 %	20 %	20 %	0 %	340620903
132	NC_015846	CTTTT	2	10	145003	145012	0 %	80 %	0 %	20 %	340620904
133	NC_015846	AAGCC	2	10	149382	149391	40 %	0 %	20 %	40 %	340620910
134	NC_015846	GATAA	2	10	149738	149747	60 %	20 %	20 %	0 %	340620910
135	NC_015846	AAGTT	2	10	151495	151504	40 %	40 %	20 %	0 %	340620913
136	NC_015846	AAACT	2	10	151610	151619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015846	CCAAA	2	10	151690	151699	60 %	0 %	0 %	40 %	340620914
138	NC_015846	TGTAA	2	10	152176	152185	40 %	40 %	20 %	0 %	340620914
139	NC_015846	TAATT	2	10	153332	153341	40 %	60 %	0 %	0 %	340620918
140	NC_015846	CAAAG	2	10	153394	153403	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015846	TAAAA	2	10	153546	153555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015846	GGAAC	2	10	155876	155885	40 %	0 %	40 %	20 %	340620922
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263	NC_015846	ATTTT	2	10	309194	309203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_015846	TAGGA	2	10	468721	468730	40 %	20 %	40 %	0 %	340621186
405	NC_015846	CAATT	2	10	470741	470750	40 %	40 %	0 %	20 %	340621187
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407	NC_015846	ATTAT	2	10	471643	471652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_015846	TTACA	2	10	478874	478883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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411	NC_015846	ACGTA	2	10	479347	479356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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413	NC_015846	ATTTG	2	10	482186	482195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_015846	TAAAA	2	10	493987	493996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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