MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus hirae ATCC 9790 plasmid pTG9790

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015845	ACC	2	6	1	6	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015845	AAG	2	6	61	66	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015845	TTG	2	6	311	316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015845	GAC	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015845	TGC	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015845	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015845	AGA	2	6	542	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015845	AAT	2	6	597	602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015845	TTG	2	6	742	747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015845	CTT	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015845	AGA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015845	AGA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015845	TAA	2	6	929	934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015845	ATT	2	6	1044	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015845	AAG	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015845	GAT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015845	AGA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015845	AGA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015845	GAC	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015845	GAT	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015845	TGG	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015845	AAT	2	6	1442	1447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015845	GTA	3	9	1482	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015845	ACC	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015845	TGA	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015845	GGT	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015845	AAG	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015845	GTT	2	6	12720	12725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015845	GAA	2	6	13008	13013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015845	ATT	2	6	14955	14960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015845	TAG	2	6	16249	16254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015845	CCT	2	6	16258	16263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015845	TAT	2	6	16283	16288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015845	ATA	2	6	16329	16334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015845	TAT	2	6	16355	16360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015845	GTT	2	6	16375	16380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015845	ATA	2	6	16432	16437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015845	ATA	2	6	16464	16469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015845	ATA	2	6	16496	16501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015845	TAT	2	6	16647	16652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015845	GTG	2	6	16813	16818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015845	TGC	2	6	16880	16885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015845	CTT	2	6	17031	17036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015845	CAA	2	6	17068	17073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015845	AAT	2	6	17152	17157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015845	CAA	2	6	17176	17181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015845	GTA	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015845	AAG	2	6	18773	18778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015845	AGT	2	6	18799	18804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015845	GCA	2	6	18850	18855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015845	CTT	2	6	18924	18929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015845	CTT	2	6	18977	18982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015845	TGA	2	6	19176	19181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015845	ATT	2	6	19208	19213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015845	TAT	2	6	19277	19282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015845	TAT	2	6	19424	19429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015845	TTG	2	6	20092	20097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015845	TGG	2	6	21330	21335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015845	TAA	3	9	21520	21528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015845	ATG	2	6	21537	21542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015845	ATT	2	6	21682	21687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015845	ATA	2	6	21875	21880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015845	GAC	2	6	21887	21892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015845	TTC	2	6	21896	21901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015845	TGT	2	6	22191	22196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015845	TAT	2	6	22242	22247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015845	GAT	2	6	22324	22329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015845	AAT	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015845	TTG	2	6	23994	23999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015845	AGA	2	6	24017	24022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015845	ATT	2	6	24571	24576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015845	TAT	2	6	24706	24711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015845	CCT	2	6	24753	24758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015845	TGT	2	6	24779	24784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015845	AGA	2	6	24793	24798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015845	TTG	2	6	26271	26276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015845	GTT	2	6	26338	26343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015845	ACG	2	6	26414	26419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015845	GTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015845	AGG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015845	ACA	2	6	28469	28474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015845	AAG	2	6	28480	28485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015845	TCG	2	6	28487	28492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015845	ATG	2	6	28493	28498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015845	GTT	2	6	28510	28515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015845	ATA	2	6	28520	28525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015845	CGA	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015845	GTT	2	6	28672	28677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.