MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus hirae ATCC 9790 plasmid pTG9790

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015845	GAA	2	6	1713	1718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620746
2	NC_015845	CAA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620746
3	NC_015845	CTT	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620746
4	NC_015845	AAT	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620746
5	NC_015845	CAA	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620746
6	NC_015845	TGT	2	6	2036	2041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620746
7	NC_015845	GTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620746
8	NC_015845	ATA	2	6	2105	2110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620746
9	NC_015845	ATG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620746
10	NC_015845	AAC	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620746
11	NC_015845	GAA	2	6	2428	2433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620747
12	NC_015845	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620747
13	NC_015845	ATT	2	6	2532	2537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620747
14	NC_015845	ATT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620747
15	NC_015845	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620747
16	NC_015845	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620747
17	NC_015845	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620747
18	NC_015845	CAA	2	6	2881	2886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620747
19	NC_015845	TGA	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620748
20	NC_015845	TGT	2	6	3128	3133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620748
21	NC_015845	GAA	2	6	3166	3171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620748
22	NC_015845	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620748
23	NC_015845	ATT	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620748
24	NC_015845	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620748
25	NC_015845	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620748
26	NC_015845	GAT	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620748
27	NC_015845	TGA	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620748
28	NC_015845	TTC	2	6	3745	3750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620749
29	NC_015845	ATG	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620749
30	NC_015845	TAG	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620749
31	NC_015845	AAG	2	6	4006	4011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620749
32	NC_015845	ATT	2	6	4046	4051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620749
33	NC_015845	GAA	3	9	4109	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620750
34	NC_015845	AGA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620750
35	NC_015845	GTT	2	6	4195	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620750
36	NC_015845	AAT	2	6	4241	4246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620750
37	NC_015845	TAA	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620750
38	NC_015845	ATT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620750
39	NC_015845	AAT	2	6	4320	4325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620750
40	NC_015845	AAG	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
41	NC_015845	AAG	2	6	4403	4408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
42	NC_015845	GAT	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620751
43	NC_015845	GAA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
44	NC_015845	GAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
45	NC_015845	AGA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
46	NC_015845	TTG	2	6	4936	4941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620751
47	NC_015845	AAG	2	6	4961	4966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
48	NC_015845	TTA	2	6	4992	4997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620751
49	NC_015845	ATG	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620751
50	NC_015845	GAA	2	6	5317	5322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620751
51	NC_015845	GGA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340620751
52	NC_015845	GAA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620752
53	NC_015845	TAT	2	6	5506	5511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620752
54	NC_015845	TTA	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620752
55	NC_015845	TTG	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620752
56	NC_015845	GAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620753
57	NC_015845	AAC	2	6	5719	5724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620753
58	NC_015845	GAA	2	6	5789	5794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620753
59	NC_015845	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620753
60	NC_015845	CAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620753
61	NC_015845	GAT	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620753
62	NC_015845	GAA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
63	NC_015845	GAA	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
64	NC_015845	TCT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620754
65	NC_015845	TTA	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620754
66	NC_015845	GTT	2	6	6559	6564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620754
67	NC_015845	CAC	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620754
68	NC_015845	GAA	2	6	7126	7131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
69	NC_015845	TGT	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620754
70	NC_015845	ATT	2	6	7275	7280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620754
71	NC_015845	ACT	2	6	7283	7288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620754
72	NC_015845	CTG	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620754
73	NC_015845	ATG	2	6	7360	7365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
74	NC_015845	AAT	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620754
75	NC_015845	TGG	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620754
76	NC_015845	TTA	2	6	7695	7700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620754
77	NC_015845	ATT	2	6	7802	7807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620754
78	NC_015845	GTG	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620754
79	NC_015845	GTG	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620754
80	NC_015845	TGA	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
81	NC_015845	GTA	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
82	NC_015845	TGA	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
83	NC_015845	TAG	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
84	NC_015845	GGT	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620754
85	NC_015845	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620754
86	NC_015845	GAA	2	6	8318	8323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
87	NC_015845	TAA	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620754
88	NC_015845	ATG	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
89	NC_015845	GAT	2	6	8389	8394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620754
90	NC_015845	GAA	2	6	8578	8583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
91	NC_015845	AGA	2	6	8631	8636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620754
92	NC_015845	AGG	2	6	8651	8656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340620754
93	NC_015845	ATT	2	6	8674	8679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620755
94	NC_015845	ATT	2	6	8815	8820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620755
95	NC_015845	TGG	2	6	9025	9030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620755
96	NC_015845	CCG	2	6	9174	9179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340620755
97	NC_015845	TGT	2	6	9208	9213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620755
98	NC_015845	ATG	3	9	9313	9321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
99	NC_015845	TGA	2	6	9326	9331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
100	NC_015845	AGA	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620755
101	NC_015845	TTG	2	6	9694	9699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620755
102	NC_015845	TTA	3	9	9706	9714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620755
103	NC_015845	AGG	2	6	9890	9895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340620755
104	NC_015845	AAT	2	6	9921	9926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620755
105	NC_015845	GAT	3	9	9963	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
106	NC_015845	GTA	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
107	NC_015845	GAA	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620755
108	NC_015845	GAA	2	6	10353	10358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620755
109	NC_015845	TAA	2	6	10430	10435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620755
110	NC_015845	AGT	2	6	10494	10499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
111	NC_015845	TGA	2	6	10531	10536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620755
112	NC_015845	GAA	2	6	10548	10553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620755
113	NC_015845	GAA	2	6	10668	10673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620756
114	NC_015845	GAT	2	6	10746	10751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620756
115	NC_015845	ATT	2	6	10806	10811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620756
116	NC_015845	ATA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620756
117	NC_015845	TAT	2	6	10989	10994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620756
118	NC_015845	TGG	2	6	11002	11007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620756
119	NC_015845	AAT	2	6	11151	11156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620756
120	NC_015845	ATG	2	6	11167	11172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620756
121	NC_015845	GGT	2	6	11214	11219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620756
122	NC_015845	TGG	3	9	11225	11233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620756
123	NC_015845	ATT	2	6	11285	11290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620756
124	NC_015845	ATG	2	6	11332	11337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620756
125	NC_015845	TGG	2	6	11390	11395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620756
126	NC_015845	GAA	2	6	11594	11599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620756
127	NC_015845	TGA	2	6	11633	11638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620756
128	NC_015845	TGG	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620757
129	NC_015845	AGA	3	9	11791	11799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620757
130	NC_015845	AAG	3	9	11871	11879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620757
131	NC_015845	AAT	2	6	11921	11926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620757
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.