MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zobellia galactanivorans chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015844	GTATCA	2	12	33950	33961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015844	CCCTCC	2	12	71954	71965	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_015844	AGGCCT	2	12	78492	78503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015844	TTTTCT	2	12	86619	86630	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015844	ACAAGC	2	12	133413	133424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015844	AATTTA	2	12	145776	145787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015844	TAAAAA	2	12	169870	169881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015844	TGAAAA	2	12	175447	175458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015844	TTGTTC	2	12	189653	189664	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015844	TACATT	2	12	231665	231676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015844	ATTTTT	2	12	267818	267829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015844	AGAAAT	2	12	268020	268031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015844	TTAAAT	2	12	277488	277499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015844	CTAAAA	2	12	326725	326736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015844	AATAAG	2	12	355253	355264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015844	CATCGA	2	12	376603	376614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015844	TGTTTT	2	12	385250	385261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015844	TACGTA	2	12	404999	405010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015844	TGCCTT	2	12	409679	409690	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015844	TTTTAT	2	12	423350	423361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015844	TTTTAA	2	12	429761	429772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015844	TTGGTT	2	12	480390	480401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015844	AAGCAA	2	12	497749	497760	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015844	GAAAAG	2	12	507715	507726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015844	TACCTT	2	12	525688	525699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015844	CATAAA	2	12	530687	530698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015844	TTAAAA	2	12	535130	535141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015844	TTATAT	2	12	665167	665178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015844	CTTAAA	2	12	690516	690527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015844	ATACAA	2	12	719927	719938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015844	TACCCC	2	12	913093	913104	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015844	TAAAAA	2	12	993377	993388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015844	TCAACG	2	12	1111915	1111926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015844	TATTCG	2	12	1112702	1112713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015844	TTTTCT	2	12	1112738	1112749	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015844	ACCTTC	2	12	1126783	1126794	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015844	GCGTAT	2	12	1215195	1215206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015844	TAAATT	2	12	1223563	1223574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015844	TTTAAT	2	12	1246229	1246240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015844	GTTCAA	2	12	1247260	1247271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015844	CAAAAT	2	12	1299205	1299216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015844	AATCTC	2	12	1420986	1420997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015844	CATTAT	2	12	1421008	1421019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015844	AAAAAT	2	12	1448955	1448966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015844	ACCTTA	2	12	1471797	1471808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015844	CTTTGT	5	30	1525629	1525658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015844	TTATCT	2	12	1534476	1534487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015844	AGCAAA	2	12	1570640	1570651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015844	TGTACT	2	12	1665079	1665090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015844	TTAAGT	2	12	1671235	1671246	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015844	ATCTTC	2	12	1808741	1808752	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015844	TCAAGT	2	12	1818091	1818102	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015844	CTTGAA	3	18	1818566	1818583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015844	CTTGAG	2	12	1818610	1818621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015844	TGAACT	2	12	1818638	1818649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015844	TTGAAC	2	12	1818650	1818661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015844	TGAACT	4	24	1818664	1818687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015844	TTGAAC	3	18	1818688	1818705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015844	ACTTGA	2	12	1818731	1818742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015844	TCTATT	2	12	1835412	1835423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015844	TTTAAG	2	12	1877036	1877047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015844	TAAAAA	2	12	1883196	1883207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015844	AAAAGA	2	12	2000878	2000889	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015844	GGGTAA	2	12	2004960	2004971	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015844	AATATA	2	12	2048891	2048902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015844	GAAAAA	2	12	2120565	2120576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015844	TATATT	2	12	2128899	2128910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015844	GCTTAT	2	12	2180189	2180200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015844	TCAGGT	2	12	2201487	2201498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015844	TTTAAT	2	12	2205018	2205029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015844	ATACAA	2	12	2304965	2304976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015844	TGTAGT	2	12	2374959	2374970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015844	TGGGTC	2	12	2382511	2382522	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015844	TTTTTG	2	12	2421011	2421022	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015844	GGTATG	2	12	2473526	2473537	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015844	ATGAAA	2	12	2537835	2537846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015844	TTGTGA	2	12	2611504	2611515	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015844	ATTTTT	2	12	2654988	2654999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015844	ATTTTT	2	12	2684341	2684352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015844	ACCATA	2	12	2695991	2696002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015844	CTTGGA	2	12	2706825	2706836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015844	ATTTTT	2	12	2866667	2866678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015844	TTTTCA	2	12	2869039	2869050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015844	GAAAAA	2	12	2887291	2887302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015844	AGAGGG	2	12	3009282	3009293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015844	TAATGT	2	12	3027197	3027208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015844	GGCCTA	2	12	3060626	3060637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015844	TATTAG	2	12	3079769	3079780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015844	TTTTTG	2	12	3145237	3145248	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015844	CATTTT	2	12	3171908	3171919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015844	ATTGAA	2	12	3174725	3174736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015844	TAAAAG	2	12	3257112	3257123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015844	AATTCA	2	12	3287187	3287198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015844	TAGGTA	2	12	3303931	3303942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015844	TCGGCC	2	12	3353417	3353428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015844	TGGTAA	2	12	3354306	3354317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015844	AAACGG	2	12	3355443	3355454	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015844	GCCGTA	2	12	3356036	3356047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015844	TTTCGG	2	12	3356274	3356285	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015844	CCAAGA	2	12	3358386	3358397	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015844	CTCGTC	2	12	3362263	3362274	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015844	TAGGCA	2	12	3363308	3363319	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015844	TGGGGT	2	12	3393955	3393966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015844	AGGCAA	2	12	3414330	3414341	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015844	TTTTGT	2	12	3429059	3429070	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015844	ACGGCT	2	12	3480719	3480730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015844	CATCTT	2	12	3485973	3485984	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015844	TTCGTG	2	12	3512860	3512871	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015844	TACGAA	2	12	3532071	3532082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015844	CGTTGA	2	12	3532860	3532871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015844	TTTGAT	2	12	3544015	3544026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015844	TTAATT	2	12	3546514	3546525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015844	TTAATT	2	12	3553212	3553223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015844	ACATAT	2	12	3560714	3560725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015844	TTTTTA	2	12	3561251	3561262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015844	AAATCC	2	12	3562933	3562944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015844	TTGTTT	2	12	3565454	3565465	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015844	CATAAC	2	12	3676167	3676178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015844	ATTTGC	2	12	3738286	3738297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015844	TTTTGC	2	12	3757404	3757415	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015844	TACCCT	2	12	3757546	3757557	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015844	CCAGCA	2	12	3876109	3876120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015844	ATGGCC	2	12	3886839	3886850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015844	TTCTTA	2	12	3889341	3889352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015844	CTTTTT	2	12	3899617	3899628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015844	TTTTAT	2	12	3910156	3910167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015844	CTTTTT	2	12	3919431	3919442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015844	GAAGTA	2	12	3962366	3962377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015844	GCTTTT	2	12	3978701	3978712	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015844	AATAAA	2	12	3982410	3982421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015844	AAACAT	2	12	4096820	4096831	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015844	ATTTGT	2	12	4154915	4154926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015844	GTATGG	2	12	4154944	4154955	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015844	TTTTGG	2	12	4162709	4162720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015844	AACAAA	2	12	4180780	4180791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_015844	TTTAGT	2	12	4185742	4185753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015844	AAGCAC	2	12	4250727	4250738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015844	CTAAAA	2	12	4312642	4312653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015844	TGCCAA	2	12	4323915	4323926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015844	TATGTA	2	12	4342685	4342696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015844	GAATTT	2	12	4388587	4388598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015844	AACTAA	2	12	4425835	4425846	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015844	TTTTTA	2	12	4446864	4446875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015844	AAAAAC	2	12	4454277	4454288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_015844	CAATTT	2	12	4516176	4516187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015844	TACAAA	2	12	4525135	4525146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015844	AAAATG	2	12	4588862	4588873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015844	TTTTAA	2	12	4605746	4605757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015844	CAATAT	2	12	4705095	4705106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_015844	TTATAT	2	12	4785485	4785496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015844	TTGCTT	2	12	4796948	4796959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_015844	ATTTAG	2	12	4810440	4810451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015844	ATTAAC	2	12	4865575	4865586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015844	ATGAAA	2	12	4891540	4891551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015844	AATAAA	2	12	4918699	4918710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015844	TTAAAA	2	12	4958439	4958450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015844	CTTTTT	2	12	4960418	4960429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_015844	AAACTT	2	12	5004908	5004919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015844	GTGAAA	2	12	5009389	5009400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015844	AGAAAA	2	12	5009720	5009731	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015844	AGGAGT	2	12	5017747	5017758	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015844	ATGTAA	2	12	5031551	5031562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015844	ATTTTA	2	12	5112706	5112717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015844	TTATTC	2	12	5112742	5112753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_015844	GCCCAA	2	12	5114506	5114517	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
166	NC_015844	TACCTA	2	12	5125759	5125770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015844	TTTTTC	2	12	5139688	5139699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_015844	TTTTTC	2	12	5146124	5146135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_015844	ATTTTT	2	12	5300253	5300264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015844	GACCAG	2	12	5343719	5343730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015844	TCTTTT	2	12	5352566	5352577	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_015844	CTTTTT	2	12	5354107	5354118	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_015844	AACCAA	2	12	5354119	5354130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_015844	ATACCT	2	12	5360433	5360444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015844	AAGTTC	2	12	5388713	5388724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_015844	AAATGG	2	12	5391930	5391941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015844	AAACTA	2	12	5430482	5430493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.