MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	GAAGTG	2	12	19611	19622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015760	ACTAAT	2	12	19641	19652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015760	AGGTTA	2	12	26131	26142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015760	GAAGTG	2	12	73136	73147	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015760	ACTAAT	2	12	73166	73177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015760	TTCGGG	2	12	74051	74062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015760	GAAGTG	2	12	137691	137702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015760	ACTAAT	2	12	137721	137732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015760	GAAGTG	2	12	143493	143504	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015760	ACTAAT	2	12	143523	143534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015760	CAAATA	2	12	159787	159798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015760	TTTTTC	2	12	168208	168219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015760	TTTTTC	2	12	168369	168380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015760	ATTTTT	2	12	237124	237135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015760	ACTCTT	2	12	304541	304552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015760	ATTTTT	2	12	314608	314619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015760	GAAGTG	2	12	354099	354110	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015760	ACTAAT	2	12	354129	354140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015760	AAAAGG	2	12	385671	385682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015760	AGAATA	2	12	390410	390421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015760	TGTAAA	2	12	400034	400045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015760	GATAAA	2	12	447435	447446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015760	TCTGTT	2	12	449630	449641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015760	TATTTT	2	12	456032	456043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015760	ATTAAA	2	12	488750	488761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015760	AATCTA	2	12	491672	491683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015760	CTTTTT	2	12	521990	522001	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015760	ACTTGC	2	12	586812	586823	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015760	TGTTAG	2	12	591999	592010	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015760	GATAGT	2	12	598127	598138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015760	TCCTAA	2	12	724434	724445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015760	GCTTTT	2	12	749150	749161	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015760	GTTTTA	2	12	760780	760791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015760	ATAGTA	2	12	834615	834626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015760	CCTTTT	2	12	840982	840993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015760	CTTTTT	2	12	912139	912150	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015760	CAAGGT	2	12	937831	937842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015760	TAAAAA	2	12	1038133	1038144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015760	AGTAAT	2	12	1068603	1068614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015760	GATAAT	2	12	1077830	1077841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015760	AAGATA	2	12	1085405	1085416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015760	GAATAA	2	12	1206643	1206654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015760	TCATAT	2	12	1260122	1260133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015760	AAAGAA	2	12	1284208	1284219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015760	AGATTA	2	12	1330935	1330946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015760	ATCAAA	2	12	1339883	1339894	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015760	CGATTT	2	12	1348555	1348566	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015760	AAAAGA	2	12	1351186	1351197	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015760	AAAAAG	2	12	1375864	1375875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015760	AAAAGA	2	12	1382938	1382949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015760	AAGCCT	2	12	1384630	1384641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015760	TCATTT	2	12	1386802	1386813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015760	ATTTTC	2	12	1386894	1386905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015760	TATTTT	2	12	1413419	1413430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015760	AAAAAC	2	12	1427606	1427617	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015760	ATGGAT	2	12	1441974	1441985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015760	CTTTAT	2	12	1484670	1484681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015760	GTAAAA	2	12	1492167	1492178	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015760	TTCATA	2	12	1497269	1497280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015760	TTAAAA	2	12	1505478	1505489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015760	CAAAAA	2	12	1543101	1543112	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015760	TTTGAT	2	12	1576503	1576514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015760	CCCGAA	2	12	1582090	1582101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015760	GAAAAA	2	12	1582501	1582512	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015760	ATATCT	2	12	1638553	1638564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015760	AGTCAA	2	12	1638575	1638586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015760	TTTCTT	2	12	1663513	1663524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015760	TTACTA	2	12	1693407	1693418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015760	TATTTC	2	12	1694960	1694971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015760	ATAGGG	2	12	1718056	1718067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015760	AGCAAA	2	12	1800964	1800975	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015760	CTTGGA	2	12	1816243	1816254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015760	TCCAAG	2	12	1816261	1816272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015760	AAAAAG	2	12	1876224	1876235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015760	GATTTT	2	12	1881110	1881121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015760	CCCTCT	2	12	1916964	1916975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015760	TTTTTC	2	12	1964103	1964114	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015760	GTTTCA	2	12	1969064	1969075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015760	AAAAGA	2	12	1994672	1994683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015760	AGTACA	2	12	1998644	1998655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015760	TATTAG	2	12	2015920	2015931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015760	CAAAAA	2	12	2022338	2022349	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015760	CATAAA	2	12	2037137	2037148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015760	AAATAG	2	12	2067986	2067997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015760	CAAGGG	2	12	2141144	2141155	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015760	TAGAAA	2	12	2162272	2162283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015760	AATAAA	2	12	2207992	2208003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.