MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	CAAAT	2	10	2306	2315	60 %	20 %	0 %	20 %	340397869
2	NC_015760	CAACC	2	10	2610	2619	40 %	0 %	0 %	60 %	340397869
3	NC_015760	TTTCA	2	10	2670	2679	20 %	60 %	0 %	20 %	340397869
4	NC_015760	TGAAA	2	10	2835	2844	60 %	20 %	20 %	0 %	340397870
5	NC_015760	TCTCG	2	10	5266	5275	0 %	40 %	20 %	40 %	340397873
6	NC_015760	GAGAT	2	10	5558	5567	40 %	20 %	40 %	0 %	340397873
7	NC_015760	GACTA	2	10	12521	12530	40 %	20 %	20 %	20 %	340397879
8	NC_015760	GGTAA	2	10	12770	12779	40 %	20 %	40 %	0 %	340397880
9	NC_015760	TTGGT	2	10	21867	21876	0 %	60 %	40 %	0 %	340397881
10	NC_015760	CAATC	2	10	22999	23008	40 %	20 %	0 %	40 %	340397883
11	NC_015760	ATTCA	2	10	24118	24127	40 %	40 %	0 %	20 %	340397883
12	NC_015760	CAATA	2	10	25572	25581	60 %	20 %	0 %	20 %	340397885
13	NC_015760	TGATT	2	10	27132	27141	20 %	60 %	20 %	0 %	340397886
14	NC_015760	TTTTG	2	10	27746	27755	0 %	80 %	20 %	0 %	340397887
15	NC_015760	GTAGA	2	10	30458	30467	40 %	20 %	40 %	0 %	340397890
16	NC_015760	GCTTT	2	10	32038	32047	0 %	60 %	20 %	20 %	340397892
17	NC_015760	GTGAT	2	10	33053	33062	20 %	40 %	40 %	0 %	340397892
18	NC_015760	AAATG	2	10	36541	36550	60 %	20 %	20 %	0 %	340397893
19	NC_015760	TCAAA	2	10	40789	40798	60 %	20 %	0 %	20 %	340397897
20	NC_015760	TTTTA	2	10	41581	41590	20 %	80 %	0 %	0 %	340397898
21	NC_015760	TTAAA	2	10	41655	41664	60 %	40 %	0 %	0 %	340397898
22	NC_015760	ATAGC	2	10	42832	42841	40 %	20 %	20 %	20 %	340397899
23	NC_015760	ACAAT	2	10	43438	43447	60 %	20 %	0 %	20 %	340397899
24	NC_015760	TAATA	2	10	45331	45340	60 %	40 %	0 %	0 %	340397901
25	NC_015760	TTTAT	2	10	45607	45616	20 %	80 %	0 %	0 %	340397902
26	NC_015760	TTGAT	2	10	46085	46094	20 %	60 %	20 %	0 %	340397903
27	NC_015760	GAAGC	2	10	48900	48909	40 %	0 %	40 %	20 %	340397905
28	NC_015760	ATTTT	2	10	49213	49222	20 %	80 %	0 %	0 %	340397906
29	NC_015760	GCTTG	2	10	52088	52097	0 %	40 %	40 %	20 %	340397910
30	NC_015760	TGAGT	2	10	53938	53947	20 %	40 %	40 %	0 %	340397913
31	NC_015760	ACTAT	2	10	56724	56733	40 %	40 %	0 %	20 %	340397915
32	NC_015760	GGCCT	2	10	57742	57751	0 %	20 %	40 %	40 %	340397917
33	NC_015760	TCAGT	2	10	57800	57809	20 %	40 %	20 %	20 %	340397917
34	NC_015760	ATCGT	2	10	59015	59024	20 %	40 %	20 %	20 %	340397917
35	NC_015760	GATAA	2	10	60648	60657	60 %	20 %	20 %	0 %	340397919
36	NC_015760	CTTTA	2	10	63553	63562	20 %	60 %	0 %	20 %	340397922
37	NC_015760	GCAGA	2	10	66483	66492	40 %	0 %	40 %	20 %	340397926
38	NC_015760	AGTGA	2	10	67884	67893	40 %	20 %	40 %	0 %	340397927
39	NC_015760	TTGAT	2	10	67894	67903	20 %	60 %	20 %	0 %	340397927
40	NC_015760	ATGCC	2	10	75523	75532	20 %	20 %	20 %	40 %	340397928
41	NC_015760	TGATT	2	10	75791	75800	20 %	60 %	20 %	0 %	340397928
42	NC_015760	TGGTA	2	10	77984	77993	20 %	40 %	40 %	0 %	340397928
43	NC_015760	TCAAA	2	10	80188	80197	60 %	20 %	0 %	20 %	340397929
44	NC_015760	AATTT	2	10	80748	80757	40 %	60 %	0 %	0 %	340397931
45	NC_015760	AAGAT	2	10	81499	81508	60 %	20 %	20 %	0 %	340397932
46	NC_015760	TCAGC	2	10	88608	88617	20 %	20 %	20 %	40 %	340397939
47	NC_015760	CAGAT	2	10	90242	90251	40 %	20 %	20 %	20 %	340397940
48	NC_015760	GGCTT	2	10	93249	93258	0 %	40 %	40 %	20 %	340397943
49	NC_015760	AAGAT	2	10	98468	98477	60 %	20 %	20 %	0 %	340397946
50	NC_015760	AAGGA	2	10	99507	99516	60 %	0 %	40 %	0 %	340397947
51	NC_015760	GCTTC	2	10	100754	100763	0 %	40 %	20 %	40 %	340397950
52	NC_015760	TGTTT	2	10	100964	100973	0 %	80 %	20 %	0 %	340397950
53	NC_015760	GATGA	2	10	104270	104279	40 %	20 %	40 %	0 %	340397953
54	NC_015760	GTATC	2	10	104580	104589	20 %	40 %	20 %	20 %	340397954
55	NC_015760	ATAGA	2	10	104881	104890	60 %	20 %	20 %	0 %	340397954
56	NC_015760	AACAA	2	10	107611	107620	80 %	0 %	0 %	20 %	340397959
57	NC_015760	CACAC	2	10	107745	107754	40 %	0 %	0 %	60 %	340397959
58	NC_015760	TGGAC	2	10	110023	110032	20 %	20 %	40 %	20 %	340397962
59	NC_015760	ATCAA	2	10	112038	112047	60 %	20 %	0 %	20 %	340397963
60	NC_015760	TGAAA	2	10	114494	114503	60 %	20 %	20 %	0 %	340397966
61	NC_015760	GGCTT	2	10	116081	116090	0 %	40 %	40 %	20 %	340397968
62	NC_015760	GTAAA	2	10	117614	117623	60 %	20 %	20 %	0 %	340397970
63	NC_015760	TCTGT	2	10	122057	122066	0 %	60 %	20 %	20 %	340397974
64	NC_015760	CGGTT	2	10	123031	123040	0 %	40 %	40 %	20 %	340397975
65	NC_015760	CGACA	2	10	125082	125091	40 %	0 %	20 %	40 %	340397978
66	NC_015760	AAGGT	2	10	125397	125406	40 %	20 %	40 %	0 %	340397978
67	NC_015760	GTATC	2	10	127740	127749	20 %	40 %	20 %	20 %	340397980
68	NC_015760	CAAGA	2	10	129236	129245	60 %	0 %	20 %	20 %	340397981
69	NC_015760	AAAGG	2	10	130386	130395	60 %	0 %	40 %	0 %	340397982
70	NC_015760	TAAAG	2	10	130556	130565	60 %	20 %	20 %	0 %	340397982
71	NC_015760	TTTGG	2	10	130922	130931	0 %	60 %	40 %	0 %	340397983
72	NC_015760	TTTGG	3	15	150677	150691	0 %	60 %	40 %	0 %	340397992
73	NC_015760	GAAGA	2	10	151399	151408	60 %	0 %	40 %	0 %	340397994
74	NC_015760	TTTGG	2	10	154463	154472	0 %	60 %	40 %	0 %	340397997
75	NC_015760	AAGGT	2	10	154489	154498	40 %	20 %	40 %	0 %	340397997
76	NC_015760	CTGGT	2	10	156070	156079	0 %	40 %	40 %	20 %	340397997
77	NC_015760	ACTGT	2	10	156287	156296	20 %	40 %	20 %	20 %	340397998
78	NC_015760	TGATT	2	10	157587	157596	20 %	60 %	20 %	0 %	340397999
79	NC_015760	GAGAT	2	10	158639	158648	40 %	20 %	40 %	0 %	340397999
80	NC_015760	ATTGA	2	10	158944	158953	40 %	40 %	20 %	0 %	340397999
81	NC_015760	CTGGT	2	10	158954	158963	0 %	40 %	40 %	20 %	340397999
82	NC_015760	CATCA	2	10	160195	160204	40 %	20 %	0 %	40 %	340398001
83	NC_015760	AGTAG	2	10	168866	168875	40 %	20 %	40 %	0 %	340398007
84	NC_015760	CACAA	2	10	171765	171774	60 %	0 %	0 %	40 %	340398008
85	NC_015760	CGTAG	2	10	175125	175134	20 %	20 %	40 %	20 %	340398011
86	NC_015760	CACGC	2	10	176238	176247	20 %	0 %	20 %	60 %	340398013
87	NC_015760	CAAGT	2	10	179557	179566	40 %	20 %	20 %	20 %	340398016
88	NC_015760	CTCAG	2	10	182346	182355	20 %	20 %	20 %	40 %	340398019
89	NC_015760	AGCTT	2	10	184689	184698	20 %	40 %	20 %	20 %	340398021
90	NC_015760	AGCTA	2	10	188234	188243	40 %	20 %	20 %	20 %	340398026
91	NC_015760	AAATG	2	10	189206	189215	60 %	20 %	20 %	0 %	340398027
92	NC_015760	TTGGT	2	10	191122	191131	0 %	60 %	40 %	0 %	340398027
93	NC_015760	TAAGG	2	10	194364	194373	40 %	20 %	40 %	0 %	340398030
94	NC_015760	TCAAA	2	10	194524	194533	60 %	20 %	0 %	20 %	340398030
95	NC_015760	AATCC	2	10	195114	195123	40 %	20 %	0 %	40 %	340398031
96	NC_015760	ATTAT	2	10	195179	195188	40 %	60 %	0 %	0 %	340398031
97	NC_015760	TCTTA	2	10	195241	195250	20 %	60 %	0 %	20 %	340398031
98	NC_015760	TTTGA	2	10	197774	197783	20 %	60 %	20 %	0 %	340398033
99	NC_015760	GGTAA	2	10	199871	199880	40 %	20 %	40 %	0 %	340398036
100	NC_015760	TGGCT	2	10	204963	204972	0 %	40 %	40 %	20 %	340398038
101	NC_015760	GAAAA	2	10	205926	205935	80 %	0 %	20 %	0 %	340398039
102	NC_015760	ATCGT	2	10	206208	206217	20 %	40 %	20 %	20 %	340398040
103	NC_015760	TGTTT	2	10	209169	209178	0 %	80 %	20 %	0 %	340398043
104	NC_015760	TAAGA	2	10	209190	209199	60 %	20 %	20 %	0 %	340398043
105	NC_015760	TCTTG	2	10	209357	209366	0 %	60 %	20 %	20 %	340398043
106	NC_015760	CTTTA	2	10	209915	209924	20 %	60 %	0 %	20 %	340398044
107	NC_015760	TAAAT	2	10	210559	210568	60 %	40 %	0 %	0 %	340398045
108	NC_015760	ATGGG	2	10	217869	217878	20 %	20 %	60 %	0 %	340398053
109	NC_015760	GGCTT	2	10	218079	218088	0 %	40 %	40 %	20 %	340398053
110	NC_015760	GCAAC	2	10	218297	218306	40 %	0 %	20 %	40 %	340398053
111	NC_015760	AGGAA	2	10	222513	222522	60 %	0 %	40 %	0 %	340398056
112	NC_015760	GAGAA	2	10	223240	223249	60 %	0 %	40 %	0 %	340398058
113	NC_015760	AGATG	2	10	223787	223796	40 %	20 %	40 %	0 %	340398059
114	NC_015760	GCATC	2	10	225562	225571	20 %	20 %	20 %	40 %	340398061
115	NC_015760	TGCTG	2	10	226030	226039	0 %	40 %	40 %	20 %	340398062
116	NC_015760	TGACC	2	10	227423	227432	20 %	20 %	20 %	40 %	340398064
117	NC_015760	TTTGG	2	10	227992	228001	0 %	60 %	40 %	0 %	340398065
118	NC_015760	ATCAA	2	10	229368	229377	60 %	20 %	0 %	20 %	340398066
119	NC_015760	TGATT	2	10	232736	232745	20 %	60 %	20 %	0 %	340398069
120	NC_015760	GTTTG	2	10	233115	233124	0 %	60 %	40 %	0 %	340398069
121	NC_015760	ATAAG	2	10	234044	234053	60 %	20 %	20 %	0 %	340398070
122	NC_015760	AGATG	2	10	234388	234397	40 %	20 %	40 %	0 %	340398070
123	NC_015760	GTTAC	2	10	234494	234503	20 %	40 %	20 %	20 %	340398070
124	NC_015760	AAATT	2	10	235895	235904	60 %	40 %	0 %	0 %	340398070
125	NC_015760	GAAGT	2	10	236097	236106	40 %	20 %	40 %	0 %	340398071
126	NC_015760	TGGAT	2	10	236711	236720	20 %	40 %	40 %	0 %	340398072
127	NC_015760	ATTTT	2	10	241961	241970	20 %	80 %	0 %	0 %	340398076
128	NC_015760	GTTTG	2	10	252971	252980	0 %	60 %	40 %	0 %	340398086
129	NC_015760	GGTCA	2	10	253362	253371	20 %	20 %	40 %	20 %	340398086
130	NC_015760	TTGGC	2	10	254567	254576	0 %	40 %	40 %	20 %	340398087
131	NC_015760	AGCGG	2	10	257780	257789	20 %	0 %	60 %	20 %	340398091
132	NC_015760	AAGAC	2	10	257853	257862	60 %	0 %	20 %	20 %	340398091
133	NC_015760	ACTTG	2	10	258043	258052	20 %	40 %	20 %	20 %	340398092
134	NC_015760	GTGAT	2	10	259146	259155	20 %	40 %	40 %	0 %	340398093
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262	NC_015760	GCGGT	2	10	520291	520300	0 %	20 %	60 %	20 %	340398350
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