MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium africanum GM041182 chromosome

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015758	ACCGCG	2	12	31075	31086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015758	CGTCGG	2	12	66787	66798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015758	CAACGG	2	12	76309	76320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015758	TCACCT	2	12	80484	80495	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015758	GCGGTG	2	12	104832	104843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015758	GACGCG	2	12	139276	139287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015758	GCCGCG	2	12	179279	179290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015758	TGCACA	2	12	260805	260816	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015758	AGATTC	2	12	324765	324776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015758	TGCCGC	2	12	330618	330629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015758	TGCCGC	2	12	332985	332996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015758	GGTCGC	2	12	338781	338792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015758	TGCCGG	2	12	363484	363495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015758	CCGATC	2	12	363597	363608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015758	CCGGTG	2	12	365112	365123	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015758	TCCCGA	2	12	365305	365316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015758	GGTGTT	2	12	366122	366133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015758	GTGCTG	2	12	366243	366254	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015758	TGCCGA	2	12	366262	366273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015758	CCGGTG	2	12	366279	366290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015758	TGCCGA	2	12	366292	366303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015758	TGCCGA	2	12	397446	397457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015758	ATCGCC	2	12	407715	407726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015758	CAATGC	2	12	408320	408331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015758	AGGCCA	2	12	409201	409212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015758	GGTGTT	2	12	421777	421788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015758	TGCCGG	2	12	421932	421943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015758	GTTTCC	2	12	422056	422067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015758	TGCCGG	2	12	422088	422099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015758	TGCCGA	2	12	422103	422114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015758	GTTTCC	2	12	422116	422127	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015758	GCCGGC	2	12	422716	422727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015758	GATGGT	2	12	423025	423036	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015758	TGCCGG	2	12	423330	423341	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015758	TGCCGA	2	12	423345	423356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015758	TGCCGA	2	12	423375	423386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015758	TGCCGA	2	12	423501	423512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015758	TGCCGG	2	12	423546	423557	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015758	GCCGAT	2	12	423844	423855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015758	TGCCGG	2	12	424398	424409	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015758	CGGTAC	2	12	425841	425852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015758	TGCCGA	2	12	426555	426566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015758	TGCCGA	2	12	427962	427973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015758	GGTGTT	2	12	429124	429135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015758	TGCCGA	2	12	430461	430472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015758	GTTGCC	2	12	430738	430749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015758	GCCGCG	2	12	430856	430867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015758	AGGGTG	2	12	460316	460327	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015758	CCGGCG	2	12	460805	460816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015758	CGGTAG	2	12	462145	462156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015758	GGCCGC	2	12	462404	462415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015758	CGAGGC	2	12	462440	462451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015758	CCGATA	2	12	473216	473227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015758	CCGATG	2	12	528068	528079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015758	TGCCGG	2	12	528282	528293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015758	ATAGTC	2	12	539694	539705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015758	ACCAGT	2	12	587643	587654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015758	TGCCGA	2	12	603817	603828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015758	CGGGTG	2	12	619797	619808	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015758	ACGGCG	2	12	620295	620306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015758	CGGTGG	2	12	620809	620820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015758	CGGCAG	2	12	620881	620892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015758	ACGGCG	2	12	621054	621065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015758	TCGGGT	2	12	665555	665566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015758	GGCCCG	2	12	680401	680412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015758	CGCCGT	2	12	716781	716792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015758	CGCGGG	2	12	827209	827220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015758	CCGGCG	2	12	860572	860583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015758	ACCGGG	2	12	867293	867304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015758	GCGGCC	2	12	904183	904194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015758	ACAGCA	2	12	905556	905567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015758	CTGGGT	2	12	920395	920406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015758	CAGTCG	2	12	928197	928208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015758	TCGGGT	2	12	961927	961938	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015758	CGCGGC	2	12	1007162	1007173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015758	TCACGT	2	12	1007971	1007982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015758	GAGCGG	2	12	1020575	1020586	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015758	CAACGG	2	12	1025715	1025726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015758	GATCGA	2	12	1025766	1025777	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015758	GACTGC	2	12	1030170	1030181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015758	CGCCGG	2	12	1049034	1049045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015758	GGCGCA	2	12	1090833	1090844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015758	TGCCGG	2	12	1119459	1119470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015758	GTCGCG	2	12	1119561	1119572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015758	CAATGC	2	12	1120044	1120055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015758	TTGGTG	2	12	1148181	1148192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015758	TTCCGT	2	12	1158874	1158885	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015758	TAGCCA	2	12	1193569	1193580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015758	AGTTAC	2	12	1219327	1219338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015758	GGTGTT	2	12	1259896	1259907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015758	GCCGAT	2	12	1260428	1260439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015758	AGGTTG	2	12	1260708	1260719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015758	TCGCCG	2	12	1261312	1261323	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015758	AGGACG	2	12	1280312	1280323	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015758	AGGCCA	2	12	1340030	1340041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015758	TCGACA	2	12	1367481	1367492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015758	CCGAGT	2	12	1422878	1422889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015758	GGCGAG	2	12	1471202	1471213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015758	TTGGTG	2	12	1471281	1471292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015758	CCGGCC	2	12	1471646	1471657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015758	CACGCG	2	12	1529645	1529656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015758	ATATTC	2	12	1564672	1564683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015758	GCCCCT	2	12	1638080	1638091	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015758	GCCCCT	2	12	1641874	1641885	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015758	ACCGTG	2	12	1718323	1718334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015758	CCGATG	2	12	1718362	1718373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015758	CGAGTG	2	12	1786646	1786657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015758	GGCGCC	2	12	1832871	1832882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015758	CGGTGG	2	12	1872084	1872095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015758	CGGGAC	2	12	1875065	1875076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015758	AGGCGC	2	12	1875097	1875108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015758	CCGCTG	2	12	1877854	1877865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015758	GTCGGG	2	12	1879807	1879818	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015758	CCGCGG	2	12	1892390	1892401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015758	TAGCGG	2	12	1919495	1919506	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015758	ACCGCA	2	12	1921432	1921443	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015758	TCGTCA	2	12	1955349	1955360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015758	CGTCGC	2	12	1956513	1956524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015758	CGCCGG	2	12	1988561	1988572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015758	GCTGAA	2	12	1990170	1990181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015758	GGCGGT	2	12	1990362	1990373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015758	CACCAG	2	12	1995405	1995416	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015758	GGTTCG	2	12	1995994	1996005	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015758	TCGACT	2	12	2019905	2019916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015758	GGTGAT	2	12	2041052	2041063	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015758	TTCGGC	2	12	2054961	2054972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015758	AGAGGG	2	12	2075151	2075162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015758	ACCGTG	2	12	2141636	2141647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015758	TCGATG	2	12	2142785	2142796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015758	GCTGGG	2	12	2144268	2144279	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015758	CGCGAG	2	12	2177064	2177075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015758	GGTGAT	2	12	2190770	2190781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015758	CGGTTG	2	12	2218760	2218771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015758	GCCGCA	2	12	2221665	2221676	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015758	TCGCAG	2	12	2240994	2241005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015758	ATCGCG	2	12	2242019	2242030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_015758	CATCGA	2	12	2322373	2322384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015758	TGCACT	2	12	2329364	2329375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_015758	CCGCTG	2	12	2419523	2419534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_015758	CACGTG	2	12	2703539	2703550	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_015758	CGGCCG	2	12	2935801	2935812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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243	NC_015758	GGTGTT	2	12	3750466	3750477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
244	NC_015758	CTCGGC	2	12	3751270	3751281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
245	NC_015758	CGGCCG	2	12	3751437	3751448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
246	NC_015758	GCGCAG	2	12	3763001	3763012	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_015758	TGTACA	2	12	3782350	3782361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_015758	GTCGAT	2	12	3805001	3805012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_015758	CACGTT	2	12	3860735	3860746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_015758	TCCTCT	2	12	3866034	3866045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
251	NC_015758	TCGGAG	2	12	3890313	3890324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_015758	CCGCTC	2	12	3894342	3894353	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_015758	CGTTGG	2	12	3906984	3906995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_015758	CGGCCG	2	12	3911124	3911135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
255	NC_015758	TGCGGC	2	12	3916778	3916789	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_015758	GCGCCG	2	12	3917194	3917205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
257	NC_015758	CGCCGG	2	12	3918263	3918274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
258	NC_015758	CGACGG	2	12	3918629	3918640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_015758	CGCCGG	2	12	3918851	3918862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
260	NC_015758	CGACGG	2	12	3919370	3919381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_015758	CGCCGG	2	12	3919592	3919603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_015758	CAACGG	2	12	3919982	3919993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_015758	GCCGGC	2	12	3920091	3920102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
264	NC_015758	CCGGCG	2	12	3920233	3920244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
265	NC_015758	GCCGAC	2	12	3930704	3930715	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
266	NC_015758	GCCGAC	2	12	3931331	3931342	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
267	NC_015758	CCGGCG	2	12	3931572	3931583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
268	NC_015758	CAACGG	2	12	3931792	3931803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_015758	CGGCGA	2	12	3990439	3990450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_015758	CGAACA	2	12	3998223	3998234	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_015758	GATCTC	2	12	4038925	4038936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_015758	GGCGCC	2	12	4038967	4038978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_015758	CAGCAC	3	18	4071194	4071211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
274	NC_015758	GGCGAG	2	12	4086727	4086738	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
275	NC_015758	TGCTCG	2	12	4115725	4115736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_015758	GCGCCG	2	12	4127188	4127199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NC_015758	ACGAGC	2	12	4155261	4155272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_015758	GGTACC	2	12	4155876	4155887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_015758	TGCCTT	2	12	4176015	4176026	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_015758	TGGCGG	2	12	4176680	4176691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
281	NC_015758	GGGGCC	2	12	4231357	4231368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015758	CTCGCC	2	12	4231803	4231814	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_015758	CTCATC	2	12	4244210	4244221	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_015758	GGGTTG	2	12	4301472	4301483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015758	CCGGCG	2	12	4335583	4335594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_015758	ATTGCC	2	12	4346323	4346334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_015758	CGCGGC	2	12	4347905	4347916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.