MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium africanum GM041182 chromosome

Total Repeats: 3485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015758	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	339630084
2	NC_015758	CGTTT	2	10	2093	2102	0 %	60 %	20 %	20 %	339630085
3	NC_015758	CGGTT	2	10	3242	3251	0 %	40 %	40 %	20 %	339630085
4	NC_015758	GTCGG	2	10	4590	4599	0 %	20 %	60 %	20 %	339630087
5	NC_015758	GCAGC	2	10	7374	7383	20 %	0 %	40 %	40 %	339630089
6	NC_015758	CGGTG	2	10	9282	9291	0 %	20 %	60 %	20 %	339630089
7	NC_015758	CAGAC	2	10	9800	9809	40 %	0 %	20 %	40 %	339630089
8	NC_015758	CGCAA	2	10	10324	10333	40 %	0 %	20 %	40 %	339630090
9	NC_015758	CGGCG	2	10	10450	10459	0 %	0 %	60 %	40 %	339630090
10	NC_015758	ACCCG	2	10	11280	11289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_015758	CGACC	2	10	13673	13682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_015758	GGCGT	2	10	14155	14164	0 %	20 %	60 %	20 %	339630095
13	NC_015758	GGGCC	2	10	14438	14447	0 %	0 %	60 %	40 %	339630095
14	NC_015758	GCGTT	2	10	15183	15192	0 %	40 %	40 %	20 %	339630096
15	NC_015758	CCAGC	2	10	15723	15732	20 %	0 %	20 %	60 %	339630097
16	NC_015758	ACCGA	2	10	16486	16495	40 %	0 %	20 %	40 %	339630097
17	NC_015758	ATCGG	2	10	16878	16887	20 %	20 %	40 %	20 %	339630097
18	NC_015758	CGGCC	2	10	17887	17896	0 %	0 %	40 %	60 %	339630098
19	NC_015758	TTAGC	2	10	19038	19047	20 %	40 %	20 %	20 %	339630099
20	NC_015758	GGTCC	2	10	19110	19119	0 %	20 %	40 %	40 %	339630099
21	NC_015758	GTCGT	2	10	21629	21638	0 %	40 %	40 %	20 %	339630100
22	NC_015758	ATCAC	2	10	23902	23911	40 %	20 %	0 %	40 %	339630103
23	NC_015758	GCCGG	2	10	24589	24598	0 %	0 %	60 %	40 %	339630103
24	NC_015758	CGAGC	2	10	26951	26960	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015758	GGCAA	2	10	29284	29293	40 %	0 %	40 %	20 %	339630108
26	NC_015758	CGATC	2	10	30109	30118	20 %	20 %	20 %	40 %	339630109
27	NC_015758	CGACG	2	10	32296	32305	20 %	0 %	40 %	40 %	339630112
28	NC_015758	GCGTC	2	10	32351	32360	0 %	20 %	40 %	40 %	339630112
29	NC_015758	GACAC	2	10	32448	32457	40 %	0 %	20 %	40 %	339630112
30	NC_015758	CCGCC	2	10	33794	33803	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_015758	TCCTG	2	10	37453	37462	0 %	40 %	20 %	40 %	339630118
32	NC_015758	CTCGG	2	10	37546	37555	0 %	20 %	40 %	40 %	339630118
33	NC_015758	GGCGC	2	10	38089	38098	0 %	0 %	60 %	40 %	339630118
34	NC_015758	TGGCC	2	10	38237	38246	0 %	20 %	40 %	40 %	339630118
35	NC_015758	CGGCG	2	10	38769	38778	0 %	0 %	60 %	40 %	339630118
36	NC_015758	GTCCA	2	10	39437	39446	20 %	20 %	20 %	40 %	339630119
37	NC_015758	GCCAA	2	10	41571	41580	40 %	0 %	20 %	40 %	339630121
38	NC_015758	GCGTC	2	10	41986	41995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015758	GCACA	2	10	42370	42379	40 %	0 %	20 %	40 %	339630122
40	NC_015758	GGTAC	2	10	44904	44913	20 %	20 %	40 %	20 %	339630124
41	NC_015758	TCGAA	2	10	45136	45145	40 %	20 %	20 %	20 %	339630124
42	NC_015758	GCACC	2	10	46066	46075	20 %	0 %	20 %	60 %	339630124
43	NC_015758	CGGTG	2	10	47100	47109	0 %	20 %	60 %	20 %	339630125
44	NC_015758	TCATG	2	10	47246	47255	20 %	40 %	20 %	20 %	339630125
45	NC_015758	ATCGG	2	10	47393	47402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015758	GCAGC	2	10	48640	48649	20 %	0 %	40 %	40 %	339630127
47	NC_015758	CCCGA	2	10	48723	48732	20 %	0 %	20 %	60 %	339630127
48	NC_015758	CAGCG	2	10	49848	49857	20 %	0 %	40 %	40 %	339630128
49	NC_015758	CTCCC	2	10	56291	56300	0 %	20 %	0 %	80 %	339630134
50	NC_015758	CGGCG	2	10	56740	56749	0 %	0 %	60 %	40 %	339630134
51	NC_015758	CGACC	2	10	58272	58281	20 %	0 %	20 %	60 %	339630136
52	NC_015758	CTTCG	2	10	58959	58968	0 %	40 %	20 %	40 %	339630137
53	NC_015758	CGGTG	2	10	60015	60024	0 %	20 %	60 %	20 %	339630140
54	NC_015758	TCAGG	2	10	62501	62510	20 %	20 %	40 %	20 %	339630141
55	NC_015758	TGCCG	2	10	65532	65541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015758	GGCGA	2	10	66464	66473	20 %	0 %	60 %	20 %	339630145
57	NC_015758	GGTGT	2	10	69040	69049	0 %	40 %	60 %	0 %	339630147
58	NC_015758	ATCGG	2	10	69677	69686	20 %	20 %	40 %	20 %	339630147
59	NC_015758	CCGCG	2	10	70214	70223	0 %	0 %	40 %	60 %	339630147
60	NC_015758	GGCAA	2	10	70565	70574	40 %	0 %	40 %	20 %	339630147
61	NC_015758	CGACC	2	10	70854	70863	20 %	0 %	20 %	60 %	339630147
62	NC_015758	CGGGT	2	10	71308	71317	0 %	20 %	60 %	20 %	339630147
63	NC_015758	GGTCG	2	10	71368	71377	0 %	20 %	60 %	20 %	339630147
64	NC_015758	TGCCT	2	10	72109	72118	0 %	40 %	20 %	40 %	339630148
65	NC_015758	GTCCA	2	10	72980	72989	20 %	20 %	20 %	40 %	339630149
66	NC_015758	TGACC	2	10	75604	75613	20 %	20 %	20 %	40 %	339630151
67	NC_015758	GCCAA	2	10	75918	75927	40 %	0 %	20 %	40 %	339630151
68	NC_015758	GTCGC	2	10	75995	76004	0 %	20 %	40 %	40 %	339630151
69	NC_015758	GCGCG	2	10	77083	77092	0 %	0 %	60 %	40 %	339630152
70	NC_015758	CACGA	2	10	79940	79949	40 %	0 %	20 %	40 %	339630154
71	NC_015758	GCACC	2	10	80380	80389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015758	CCACC	2	10	80573	80582	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_015758	GAGCA	2	10	82478	82487	40 %	0 %	40 %	20 %	339630156
74	NC_015758	GCCGG	2	10	82577	82586	0 %	0 %	60 %	40 %	339630156
75	NC_015758	GCGAC	2	10	82653	82662	20 %	0 %	40 %	40 %	339630156
76	NC_015758	ATCCG	2	10	83423	83432	20 %	20 %	20 %	40 %	339630157
77	NC_015758	CACCG	2	10	84203	84212	20 %	0 %	20 %	60 %	339630158
78	NC_015758	TGGTC	2	10	86338	86347	0 %	40 %	40 %	20 %	339630160
79	NC_015758	GCTGG	2	10	86975	86984	0 %	20 %	60 %	20 %	339630161
80	NC_015758	TGGGT	2	10	90013	90022	0 %	40 %	60 %	0 %	339630166
81	NC_015758	TCGCC	2	10	90220	90229	0 %	20 %	20 %	60 %	339630166
82	NC_015758	GGGCC	2	10	91193	91202	0 %	0 %	60 %	40 %	339630167
83	NC_015758	GGCCG	2	10	92512	92521	0 %	0 %	60 %	40 %	339630168
84	NC_015758	GCGCC	2	10	93164	93173	0 %	0 %	40 %	60 %	339630168
85	NC_015758	GCTTG	2	10	95196	95205	0 %	40 %	40 %	20 %	339630170
86	NC_015758	CGTGT	2	10	95628	95637	0 %	40 %	40 %	20 %	339630171
87	NC_015758	AGATC	2	10	95707	95716	40 %	20 %	20 %	20 %	339630171
88	NC_015758	CGGCG	2	10	99288	99297	0 %	0 %	60 %	40 %	339630174
89	NC_015758	CGGCG	2	10	99415	99424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015758	GCGGT	2	10	100364	100373	0 %	20 %	60 %	20 %	339630175
91	NC_015758	GGTGA	2	10	100582	100591	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015758	GCGCC	2	10	103196	103205	0 %	0 %	40 %	60 %	339630177
93	NC_015758	GGTGG	2	10	103884	103893	0 %	20 %	80 %	0 %	339630178
94	NC_015758	CTGGC	2	10	105617	105626	0 %	20 %	40 %	40 %	339630180
95	NC_015758	GCACA	2	10	106738	106747	40 %	0 %	20 %	40 %	339630180
96	NC_015758	CTGAA	2	10	109068	109077	40 %	20 %	20 %	20 %	339630183
97	NC_015758	ATCGC	2	10	109563	109572	20 %	20 %	20 %	40 %	339630183
98	NC_015758	TCTGA	2	10	110897	110906	20 %	40 %	20 %	20 %	339630185
99	NC_015758	CGGTC	2	10	111172	111181	0 %	20 %	40 %	40 %	339630185
100	NC_015758	GACCA	2	10	112310	112319	40 %	0 %	20 %	40 %	339630185
101	NC_015758	GGCTG	2	10	114874	114883	0 %	20 %	60 %	20 %	339630185
102	NC_015758	CCGCG	2	10	118794	118803	0 %	0 %	40 %	60 %	339630186
103	NC_015758	TCGTG	2	10	122747	122756	0 %	40 %	40 %	20 %	339630188
104	NC_015758	GCACG	2	10	124402	124411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015758	CCGGA	2	10	124528	124537	20 %	0 %	40 %	40 %	339630190
106	NC_015758	GGCCG	2	10	126889	126898	0 %	0 %	60 %	40 %	339630191
107	NC_015758	TGCGC	2	10	127001	127010	0 %	20 %	40 %	40 %	339630191
108	NC_015758	GCGAG	2	10	127512	127521	20 %	0 %	60 %	20 %	339630191
109	NC_015758	GGGGT	2	10	128521	128530	0 %	20 %	80 %	0 %	339630191
110	NC_015758	CCCAC	2	10	129083	129092	20 %	0 %	0 %	80 %	339630191
111	NC_015758	CCGGC	2	10	129593	129602	0 %	0 %	40 %	60 %	339630191
112	NC_015758	TGCGG	2	10	130003	130012	0 %	20 %	60 %	20 %	339630191
113	NC_015758	ATCAC	2	10	131482	131491	40 %	20 %	0 %	40 %	339630193
114	NC_015758	ATCGG	2	10	131530	131539	20 %	20 %	40 %	20 %	339630193
115	NC_015758	CGGGC	2	10	132621	132630	0 %	0 %	60 %	40 %	339630193
116	NC_015758	GCGAT	2	10	134426	134435	20 %	20 %	40 %	20 %	339630195
117	NC_015758	GTTCG	2	10	134647	134656	0 %	40 %	40 %	20 %	339630195
118	NC_015758	CCTGG	2	10	135039	135048	0 %	20 %	40 %	40 %	339630195
119	NC_015758	GGCCC	2	10	135145	135154	0 %	0 %	40 %	60 %	339630195
120	NC_015758	CGTTG	2	10	135657	135666	0 %	40 %	40 %	20 %	339630195
121	NC_015758	CGACC	2	10	135729	135738	20 %	0 %	20 %	60 %	339630195
122	NC_015758	GAGAT	2	10	138749	138758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015758	CGGCG	2	10	140904	140913	0 %	0 %	60 %	40 %	339630199
124	NC_015758	TGCGG	2	10	141537	141546	0 %	20 %	60 %	20 %	339630200
125	NC_015758	CGCTG	2	10	142244	142253	0 %	20 %	40 %	40 %	339630201
126	NC_015758	GTTGC	2	10	142790	142799	0 %	40 %	40 %	20 %	339630201
127	NC_015758	CCGAT	2	10	143538	143547	20 %	20 %	20 %	40 %	339630201
128	NC_015758	ATCGC	2	10	144229	144238	20 %	20 %	20 %	40 %	339630202
129	NC_015758	AACCG	2	10	144968	144977	40 %	0 %	20 %	40 %	339630202
130	NC_015758	CCGCC	2	10	145555	145564	0 %	0 %	20 %	80 %	339630202
131	NC_015758	CCGCC	2	10	146198	146207	0 %	0 %	20 %	80 %	339630203
132	NC_015758	GGGTC	2	10	147951	147960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015758	ATTGG	2	10	150595	150604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015758	AGCGA	2	10	152498	152507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015758	AGCGA	2	10	152551	152560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015758	TCGTC	2	10	152898	152907	0 %	40 %	20 %	40 %	339630209
137	NC_015758	CACGC	2	10	153362	153371	20 %	0 %	20 %	60 %	339630209
138	NC_015758	ATTCT	2	10	154206	154215	20 %	60 %	0 %	20 %	339630210
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195	NC_015758	GGTGC	2	10	219181	219190	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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246	NC_015758	TGCGC	2	10	296968	296977	0 %	20 %	40 %	40 %	339630328
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257	NC_015758	CGCAG	2	10	309398	309407	20 %	0 %	40 %	40 %	339630338
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261	NC_015758	CCTGG	2	10	311787	311796	0 %	20 %	40 %	40 %	339630341
262	NC_015758	GGCCG	2	10	314892	314901	0 %	0 %	60 %	40 %	339630342
263	NC_015758	TGCGC	2	10	315389	315398	0 %	20 %	40 %	40 %	339630342
264	NC_015758	GTTGG	2	10	316611	316620	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015758	AGCGC	2	10	324532	324541	20 %	0 %	40 %	40 %	339630348
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