MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015757	CACGCA	2	12	274133	274144	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015757	ATTTTT	2	12	303761	303772	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015757	GACATT	2	12	398372	398383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015757	TTGAAG	2	12	434325	434336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015757	CTATCC	2	12	452662	452673	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015757	ACTCGA	2	12	461298	461309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015757	AAGTGA	2	12	488763	488774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015757	CTGCCA	2	12	499147	499158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015757	AAGTTG	2	12	702954	702965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015757	GACGGA	2	12	901622	901633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015757	TACAAT	2	12	997531	997542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015757	ACAAGT	2	12	1117648	1117659	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015757	GGTGCG	2	12	1127121	1127132	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015757	CGCGCA	2	12	1133239	1133250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015757	CCAGCC	2	12	1137051	1137062	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015757	TAAAAA	2	12	1178653	1178664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015757	GAACCC	2	12	1242192	1242203	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015757	TGGCTG	2	12	1277284	1277295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015757	AAATAA	2	12	1300157	1300168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015757	TCGACC	2	12	1361955	1361966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015757	GGCCGA	2	12	1368106	1368117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015757	CACCCC	2	12	1382695	1382706	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_015757	TGGGTG	2	12	1416170	1416181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015757	CACGAC	2	12	1460275	1460286	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015757	CTTTCC	2	12	1650416	1650427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015757	CGGATT	2	12	1727247	1727258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015757	CATCGG	2	12	1732938	1732949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015757	TGCCGA	2	12	1746582	1746593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015757	GTCGAC	2	12	1753014	1753025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015757	AACGTA	2	12	1780700	1780711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015757	TAATTC	2	12	1864596	1864607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015757	CTTTCC	2	12	1884509	1884520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015757	AAAAGT	2	12	1884707	1884718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015757	ACGCCA	2	12	1966599	1966610	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015757	AGAATT	2	12	1973853	1973864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015757	GGAACG	2	12	1977743	1977754	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015757	ATCCAG	2	12	1986650	1986661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015757	CGCTAA	2	12	2006937	2006948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015757	GCCCGG	2	12	2013825	2013836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015757	GGCCGA	2	12	2014529	2014540	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015757	GACAAC	2	12	2016730	2016741	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015757	TCGGCC	2	12	2017940	2017951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015757	TCAGGC	2	12	2026508	2026519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015757	AATCAT	2	12	2059501	2059512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015757	TTACGT	2	12	2079947	2079958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015757	CGAATG	2	12	2117618	2117629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015757	GCAGGA	2	12	2120873	2120884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015757	GACCGG	2	12	2137730	2137741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015757	GCTTCG	2	12	2145986	2145997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015757	CGGCGT	2	12	2172373	2172384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015757	CAGCCG	2	12	2187458	2187469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015757	CCGGAA	2	12	2280739	2280750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015757	CCTCCG	2	12	2281979	2281990	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015757	TGGATG	2	12	2312605	2312616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015757	AACCGC	2	12	2380319	2380330	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015757	GCGGGG	2	12	2480240	2480251	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015757	TAATCG	2	12	2490041	2490052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015757	CAGAGC	2	12	2493897	2493908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015757	CGGATG	2	12	2523131	2523142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015757	AGGAAC	2	12	2550251	2550262	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015757	CTGCCA	2	12	2558182	2558193	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015757	CGACCA	2	12	2667017	2667028	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015757	GTCATC	2	12	2771333	2771344	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015757	TCTTTT	2	12	2872626	2872637	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015757	GGCCGA	2	12	2894455	2894466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015757	ATTTGC	2	12	2895918	2895929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015757	GGCCGA	2	12	2921170	2921181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015757	CCGGGG	2	12	2971088	2971099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015757	CGGGGG	2	12	3073732	3073743	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015757	TTCGCG	2	12	3094220	3094231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015757	ACCCCG	2	12	3121167	3121178	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015757	ACGCCG	2	12	3235577	3235588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015757	CAAAAA	2	12	3311524	3311535	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015757	TCGCCG	2	12	3387306	3387317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015757	AAGCCA	2	12	3395256	3395267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015757	GGCGAT	2	12	3428291	3428302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015757	ATCCGA	2	12	3458512	3458523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015757	TGCCGT	2	12	3525508	3525519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015757	ATTCCT	2	12	3526277	3526288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.