MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 12815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015744	GAG	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625374
2	NC_015744	TCT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625374
3	NC_015744	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625374
4	NC_015744	TAA	3	9	1215	1223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625374
5	NC_015744	AAT	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625374
6	NC_015744	TCT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625374
7	NC_015744	GAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625374
8	NC_015744	AGG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625374
9	NC_015744	TGT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625374
10	NC_015744	ACA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625374
11	NC_015744	TGA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625374
12	NC_015744	CAA	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625374
13	NC_015744	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625374
14	NC_015744	TCT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625374
15	NC_015744	GAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625374
16	NC_015744	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625374
17	NC_015744	GAG	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625374
18	NC_015744	CTT	3	9	2149	2157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625374
19	NC_015744	TAA	2	6	2229	2234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625374
20	NC_015744	CAG	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625374
21	NC_015744	AAC	2	6	2425	2430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625374
22	NC_015744	GAG	2	6	2501	2506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625375
23	NC_015744	CTT	2	6	2565	2570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625375
24	NC_015744	ATT	2	6	2662	2667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625375
25	NC_015744	GTC	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625375
26	NC_015744	AGG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625375
27	NC_015744	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625375
28	NC_015744	ATC	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625376
29	NC_015744	ATG	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625376
30	NC_015744	AAC	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625376
31	NC_015744	ACA	2	6	3258	3263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625376
32	NC_015744	TCA	2	6	3434	3439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625376
33	NC_015744	GGT	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625376
34	NC_015744	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625376
35	NC_015744	AAG	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
36	NC_015744	AGC	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625376
37	NC_015744	TGG	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625376
38	NC_015744	GAA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
39	NC_015744	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625376
40	NC_015744	TCT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625376
41	NC_015744	ATG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625376
42	NC_015744	AAG	2	6	3894	3899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
43	NC_015744	CTT	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625376
44	NC_015744	TCA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625376
45	NC_015744	TTG	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625376
46	NC_015744	TGT	2	6	4033	4038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625376
47	NC_015744	AGA	2	6	4150	4155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
48	NC_015744	CAA	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625376
49	NC_015744	AAG	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
50	NC_015744	AGC	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625376
51	NC_015744	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
52	NC_015744	TAT	2	6	4585	4590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625376
53	NC_015744	AAG	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
54	NC_015744	AGA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
55	NC_015744	GAA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
56	NC_015744	ACT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625376
57	NC_015744	AGA	2	6	4790	4795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
58	NC_015744	GAA	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
59	NC_015744	GTT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625376
60	NC_015744	AAG	2	6	5115	5120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625376
61	NC_015744	TCT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625376
62	NC_015744	TTA	2	6	5440	5445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625377
63	NC_015744	AGA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625377
64	NC_015744	TCA	2	6	5751	5756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625377
65	NC_015744	TAT	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625377
66	NC_015744	TTG	2	6	5871	5876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625377
67	NC_015744	ATT	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625377
68	NC_015744	AGA	3	9	6000	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625377
69	NC_015744	TCG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625377
70	NC_015744	TAC	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625377
71	NC_015744	AGA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625377
72	NC_015744	AGA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625377
73	NC_015744	TTG	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
74	NC_015744	ATT	2	6	6587	6592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625378
75	NC_015744	TTC	2	6	6663	6668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625378
76	NC_015744	TTG	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
77	NC_015744	TTG	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
78	NC_015744	TGT	2	6	6928	6933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
79	NC_015744	GTT	2	6	6944	6949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
80	NC_015744	TGG	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625378
81	NC_015744	TTG	2	6	6966	6971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625378
82	NC_015744	TCA	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625378
83	NC_015744	GTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625378
84	NC_015744	TTC	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625378
85	NC_015744	ACC	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625378
86	NC_015744	AGT	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625378
87	NC_015744	ATG	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
88	NC_015744	GCT	2	6	7656	7661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625379
89	NC_015744	GAT	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
90	NC_015744	CGA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625379
91	NC_015744	CTT	3	9	7834	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625379
92	NC_015744	GTA	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
93	NC_015744	GAA	2	6	7908	7913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
94	NC_015744	AAT	2	6	7955	7960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625379
95	NC_015744	AAT	2	6	7992	7997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625379
96	NC_015744	TTC	2	6	8018	8023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625379
97	NC_015744	AGC	2	6	8030	8035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625379
98	NC_015744	AGA	2	6	8159	8164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
99	NC_015744	AGG	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625379
100	NC_015744	TGA	2	6	8270	8275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
101	NC_015744	CTA	2	6	8308	8313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625379
102	NC_015744	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
103	NC_015744	TAC	2	6	8510	8515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625379
104	NC_015744	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625379
105	NC_015744	TCA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625379
106	NC_015744	TGA	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
107	NC_015744	AAT	2	6	8733	8738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625379
108	NC_015744	AGA	2	6	8840	8845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
109	NC_015744	TCA	2	6	8899	8904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625379
110	NC_015744	TTG	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625379
111	NC_015744	TAG	2	6	8954	8959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
112	NC_015744	AAG	2	6	9118	9123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
113	NC_015744	TCT	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625379
114	NC_015744	TCT	2	6	9159	9164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625379
115	NC_015744	GAG	2	6	9165	9170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625379
116	NC_015744	CTT	2	6	9349	9354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625379
117	NC_015744	GAC	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625379
118	NC_015744	AGA	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
119	NC_015744	TCA	2	6	9609	9614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625379
120	NC_015744	TGT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625379
121	NC_015744	TCC	2	6	9783	9788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625379
122	NC_015744	TTG	2	6	9851	9856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625379
123	NC_015744	AGT	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
124	NC_015744	GTA	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
125	NC_015744	TGA	2	6	10086	10091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
126	NC_015744	AGT	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625379
127	NC_015744	TGT	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625379
128	NC_015744	ACC	2	6	10470	10475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625379
129	NC_015744	TAA	2	6	10508	10513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625379
130	NC_015744	GAA	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625379
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