MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 2381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015744	AG	3	6	146	151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015744	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015744	TC	3	6	578	583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015744	GA	3	6	791	796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015744	AG	3	6	919	924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015744	GA	3	6	999	1004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015744	TC	3	6	1445	1450	0 %	50 %	0 %	50 %	339625374
8	NC_015744	TG	3	6	1789	1794	0 %	50 %	50 %	0 %	339625374
9	NC_015744	AG	3	6	2842	2847	50 %	0 %	50 %	0 %	339625375
10	NC_015744	CT	4	8	3234	3241	0 %	50 %	0 %	50 %	339625376
11	NC_015744	CT	3	6	4095	4100	0 %	50 %	0 %	50 %	339625376
12	NC_015744	TC	3	6	4139	4144	0 %	50 %	0 %	50 %	339625376
13	NC_015744	AG	3	6	4669	4674	50 %	0 %	50 %	0 %	339625376
14	NC_015744	AG	3	6	4847	4852	50 %	0 %	50 %	0 %	339625376
15	NC_015744	AG	3	6	5330	5335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015744	GT	3	6	6650	6655	0 %	50 %	50 %	0 %	339625378
17	NC_015744	TC	3	6	7673	7678	0 %	50 %	0 %	50 %	339625379
18	NC_015744	AG	3	6	8085	8090	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
19	NC_015744	AG	3	6	8244	8249	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
20	NC_015744	AG	3	6	9884	9889	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
21	NC_015744	AG	3	6	9909	9914	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
22	NC_015744	GA	5	10	9932	9941	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
23	NC_015744	CT	3	6	10047	10052	0 %	50 %	0 %	50 %	339625379
24	NC_015744	GA	4	8	10117	10124	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
25	NC_015744	GA	3	6	10378	10383	50 %	0 %	50 %	0 %	339625379
26	NC_015744	AG	3	6	10658	10663	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
27	NC_015744	AG	3	6	10689	10694	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
28	NC_015744	CG	3	6	10881	10886	0 %	0 %	50 %	50 %	339625380
29	NC_015744	GA	3	6	11169	11174	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
30	NC_015744	GA	3	6	11377	11382	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
31	NC_015744	AG	3	6	11766	11771	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
32	NC_015744	GA	3	6	11871	11876	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
33	NC_015744	AG	3	6	12135	12140	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
34	NC_015744	GT	3	6	12236	12241	0 %	50 %	50 %	0 %	339625380
35	NC_015744	GA	3	6	12427	12432	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
36	NC_015744	AG	3	6	12469	12474	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
37	NC_015744	GA	3	6	12619	12624	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
38	NC_015744	AG	3	6	13383	13388	50 %	0 %	50 %	0 %	339625380
39	NC_015744	TA	3	6	14821	14826	50 %	50 %	0 %	0 %	339625381
40	NC_015744	TG	3	6	15039	15044	0 %	50 %	50 %	0 %	339625381
41	NC_015744	TG	3	6	15099	15104	0 %	50 %	50 %	0 %	339625381
42	NC_015744	AG	3	6	15498	15503	50 %	0 %	50 %	0 %	339625382
43	NC_015744	AG	3	6	16349	16354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015744	GC	3	6	16665	16670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015744	GA	3	6	17038	17043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015744	TC	3	6	17516	17521	0 %	50 %	0 %	50 %	339625384
47	NC_015744	AT	3	6	18069	18074	50 %	50 %	0 %	0 %	339625384
48	NC_015744	AC	3	6	19418	19423	50 %	0 %	0 %	50 %	339625384
49	NC_015744	GC	3	6	19619	19624	0 %	0 %	50 %	50 %	339625384
50	NC_015744	GA	3	6	19681	19686	50 %	0 %	50 %	0 %	339625385
51	NC_015744	CA	3	6	19811	19816	50 %	0 %	0 %	50 %	339625385
52	NC_015744	CT	3	6	21452	21457	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
53	NC_015744	CT	3	6	21808	21813	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
54	NC_015744	TC	3	6	21905	21910	0 %	50 %	0 %	50 %	339625386
55	NC_015744	GC	3	6	21974	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	339625386
56	NC_015744	AG	3	6	22045	22050	50 %	0 %	50 %	0 %	339625386
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63	NC_015744	AG	3	6	24912	24917	50 %	0 %	50 %	0 %	339625390
64	NC_015744	GA	3	6	26503	26508	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
65	NC_015744	AG	3	6	26558	26563	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
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74	NC_015744	TC	3	6	32521	32526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015744	GC	3	6	34672	34677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015744	CT	3	6	34823	34828	0 %	50 %	0 %	50 %	339625404
77	NC_015744	TA	3	6	35387	35392	50 %	50 %	0 %	0 %	339625404
78	NC_015744	GA	3	6	35676	35681	50 %	0 %	50 %	0 %	339625404
79	NC_015744	CT	3	6	35832	35837	0 %	50 %	0 %	50 %	339625404
80	NC_015744	TA	3	6	35916	35921	50 %	50 %	0 %	0 %	339625404
81	NC_015744	TG	3	6	36196	36201	0 %	50 %	50 %	0 %	339625404
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89	NC_015744	GT	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015744	CT	3	6	38144	38149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015744	AG	3	6	38316	38321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015744	GA	3	6	38371	38376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015744	GA	3	6	38515	38520	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
94	NC_015744	AG	3	6	38600	38605	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
95	NC_015744	GA	3	6	38788	38793	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
96	NC_015744	AG	3	6	38838	38843	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
97	NC_015744	AG	3	6	39126	39131	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
98	NC_015744	AG	3	6	39333	39338	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
99	NC_015744	GA	3	6	39377	39382	50 %	0 %	50 %	0 %	339625406
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102	NC_015744	AG	3	6	39770	39775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015744	GA	3	6	40327	40332	50 %	0 %	50 %	0 %	339625408
104	NC_015744	TA	3	6	40494	40499	50 %	50 %	0 %	0 %	339625408
105	NC_015744	CT	3	6	41958	41963	0 %	50 %	0 %	50 %	339625409
106	NC_015744	CT	3	6	42403	42408	0 %	50 %	0 %	50 %	339625409
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108	NC_015744	AG	3	6	43370	43375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015744	AT	3	6	43553	43558	50 %	50 %	0 %	0 %	339625411
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111	NC_015744	AG	3	6	45932	45937	50 %	0 %	50 %	0 %	339625414
112	NC_015744	TG	3	6	46143	46148	0 %	50 %	50 %	0 %	339625415
113	NC_015744	AT	3	6	47500	47505	50 %	50 %	0 %	0 %	339625416
114	NC_015744	AG	3	6	48652	48657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015744	AT	3	6	49282	49287	50 %	50 %	0 %	0 %	339625418
116	NC_015744	AG	3	6	49584	49589	50 %	0 %	50 %	0 %	339625418
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118	NC_015744	AT	3	6	50145	50150	50 %	50 %	0 %	0 %	339625418
119	NC_015744	TC	3	6	50603	50608	0 %	50 %	0 %	50 %	339625419
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121	NC_015744	CT	3	6	53316	53321	0 %	50 %	0 %	50 %	339625420
122	NC_015744	AG	3	6	54305	54310	50 %	0 %	50 %	0 %	339625420
123	NC_015744	GA	3	6	55966	55971	50 %	0 %	50 %	0 %	339625423
124	NC_015744	TA	3	6	56198	56203	50 %	50 %	0 %	0 %	339625423
125	NC_015744	GA	3	6	56359	56364	50 %	0 %	50 %	0 %	339625423
126	NC_015744	TC	3	6	56996	57001	0 %	50 %	0 %	50 %	339625424
127	NC_015744	GA	3	6	57776	57781	50 %	0 %	50 %	0 %	339625425
128	NC_015744	TC	3	6	57959	57964	0 %	50 %	0 %	50 %	339625425
129	NC_015744	CT	3	6	58050	58055	0 %	50 %	0 %	50 %	339625425
130	NC_015744	GA	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015744	GC	3	6	58402	58407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015744	AG	3	6	58486	58491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015744	TC	3	6	58669	58674	0 %	50 %	0 %	50 %	339625426
134	NC_015744	AG	4	8	58984	58991	50 %	0 %	50 %	0 %	339625426
135	NC_015744	TC	3	6	59505	59510	0 %	50 %	0 %	50 %	339625426
136	NC_015744	CT	3	6	59846	59851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015744	AG	3	6	60084	60089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015744	AT	3	6	60423	60428	50 %	50 %	0 %	0 %	339625427
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140	NC_015744	CT	3	6	61711	61716	0 %	50 %	0 %	50 %	339625427
141	NC_015744	CA	3	6	62250	62255	50 %	0 %	0 %	50 %	339625427
142	NC_015744	AG	3	6	63341	63346	50 %	0 %	50 %	0 %	339625427
143	NC_015744	AG	3	6	63819	63824	50 %	0 %	50 %	0 %	339625428
144	NC_015744	TA	3	6	64486	64491	50 %	50 %	0 %	0 %	339625428
145	NC_015744	CT	4	8	64770	64777	0 %	50 %	0 %	50 %	339625429
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