MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015744	AG	3	6	146	151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015744	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015744	TC	3	6	578	583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015744	GA	3	6	791	796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015744	AG	3	6	919	924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015744	GA	3	6	999	1004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015744	AG	3	6	5330	5335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015744	AG	3	6	16349	16354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015744	GC	3	6	16665	16670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015744	GA	3	6	17038	17043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015744	TC	3	6	32521	32526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015744	GC	3	6	34672	34677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015744	GT	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015744	CT	3	6	38144	38149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015744	AG	3	6	38316	38321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015744	GA	3	6	38371	38376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015744	GT	3	6	39471	39476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015744	AG	3	6	39770	39775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015744	AG	3	6	43370	43375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015744	AG	3	6	48652	48657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015744	GA	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015744	GC	3	6	58402	58407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015744	AG	3	6	58486	58491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015744	CT	3	6	59846	59851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015744	AG	3	6	60084	60089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015744	GA	3	6	64904	64909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015744	AG	3	6	69709	69714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015744	AT	5	10	72550	72559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015744	CT	3	6	74578	74583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015744	TG	3	6	81841	81846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015744	AG	4	8	82842	82849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015744	TC	3	6	84203	84208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015744	GA	3	6	84338	84343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015744	AG	3	6	87417	87422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015744	TG	3	6	92779	92784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015744	TA	3	6	98145	98150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015744	GA	3	6	104641	104646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015744	TC	3	6	105768	105773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015744	TC	3	6	109899	109904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015744	AG	3	6	114309	114314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015744	CT	3	6	114449	114454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015744	AG	3	6	114507	114512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015744	GA	3	6	114530	114535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015744	TC	4	8	121872	121879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015744	TG	3	6	126338	126343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015744	GA	3	6	126436	126441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015744	AG	3	6	126515	126520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015744	AG	3	6	126524	126529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015744	CT	4	8	133150	133157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015744	TA	3	6	133885	133890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015744	GA	3	6	134197	134202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015744	GT	3	6	134304	134309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015744	AC	3	6	135125	135130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015744	AC	3	6	135294	135299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015744	GA	3	6	135357	135362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015744	GA	3	6	136075	136080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015744	TC	3	6	136557	136562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015744	GT	3	6	136906	136911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015744	GC	3	6	137384	137389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015744	AG	3	6	138676	138681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015744	GA	3	6	138762	138767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015744	TC	3	6	138956	138961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015744	TA	3	6	155929	155934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015744	GA	3	6	156241	156246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015744	GT	3	6	156348	156353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015744	AC	3	6	157169	157174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015744	AC	3	6	157337	157342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015744	GA	3	6	157400	157405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015744	GA	3	6	158118	158123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015744	TC	3	6	158600	158605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015744	GT	3	6	158949	158954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015744	GC	3	6	159427	159432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015744	AG	3	6	160719	160724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015744	GA	3	6	160805	160810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015744	TC	3	6	160999	161004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015744	GA	3	6	177141	177146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015744	TC	3	6	183282	183287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015744	CT	3	6	186135	186140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015744	AG	3	6	188492	188497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015744	TC	3	6	191181	191186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015744	CG	3	6	191274	191279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015744	TC	3	6	191905	191910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015744	CT	4	8	192005	192012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015744	AG	3	6	195118	195123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015744	AG	3	6	195233	195238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015744	CG	3	6	195743	195748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015744	CT	4	8	195858	195865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015744	AG	3	6	202890	202895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015744	CA	3	6	208065	208070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015744	TC	3	6	210498	210503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015744	AG	3	6	214279	214284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015744	GA	3	6	214380	214385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015744	AG	3	6	214431	214436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015744	GA	3	6	216938	216943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015744	CT	3	6	222196	222201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015744	AC	3	6	226215	226220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015744	AG	3	6	228722	228727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015744	AG	3	6	228758	228763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015744	CT	3	6	240104	240109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015744	CT	3	6	240170	240175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015744	GA	3	6	245708	245713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015744	TG	3	6	248318	248323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015744	AG	3	6	253730	253735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015744	TA	3	6	253881	253886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015744	CT	4	8	253983	253990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015744	TA	3	6	261544	261549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015744	AT	3	6	269659	269664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015744	GA	3	6	272470	272475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015744	CT	3	6	272491	272496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015744	GT	3	6	272504	272509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015744	TA	3	6	275772	275777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015744	TC	3	6	278419	278424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015744	GA	3	6	278500	278505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015744	TA	3	6	282261	282266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015744	CA	3	6	282319	282324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015744	AG	3	6	284242	284247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015744	AG	3	6	287493	287498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015744	CT	3	6	287507	287512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015744	AG	3	6	287794	287799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015744	TA	3	6	288075	288080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015744	AT	3	6	297556	297561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015744	GT	3	6	297928	297933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015744	TC	3	6	303875	303880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015744	TC	3	6	311450	311455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015744	TG	3	6	311462	311467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015744	CT	3	6	317681	317686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015744	AG	3	6	317695	317700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015744	TC	3	6	323768	323773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015744	TC	3	6	323840	323845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015744	GA	3	6	329168	329173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015744	AG	3	6	331523	331528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015744	TA	3	6	333421	333426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015744	TA	3	6	335512	335517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015744	TA	4	8	335736	335743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015744	AG	3	6	339688	339693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015744	GA	3	6	339701	339706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015744	CT	3	6	340623	340628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015744	GA	3	6	342847	342852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015744	AG	3	6	343364	343369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015744	CT	3	6	343433	343438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015744	GA	3	6	348684	348689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015744	CT	3	6	348691	348696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015744	TC	3	6	350059	350064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015744	AG	3	6	350142	350147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015744	GA	3	6	358556	358561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015744	AT	3	6	358657	358662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015744	CT	3	6	360924	360929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015744	CT	3	6	362294	362299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015744	AG	3	6	364420	364425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015744	CT	3	6	364486	364491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015744	AG	3	6	364816	364821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015744	TC	3	6	365908	365913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015744	AG	3	6	370144	370149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015744	TG	3	6	373495	373500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.