MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	TCCGCG	2	12	3370	3381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339505893
2	NC_015741	TGGCGT	2	12	6150	6161	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339505895
3	NC_015741	GGTTCG	2	12	7256	7267	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339505896
4	NC_015741	GATACC	2	12	10017	10028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339505899
5	NC_015741	TGGGCG	2	12	12749	12760	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339505901
6	NC_015741	TGCGCC	2	12	15964	15975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339505904
7	NC_015741	GGCGAA	2	12	19409	19420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339505907
8	NC_015741	GGTCTG	2	12	21903	21914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339505911
9	NC_015741	GCGGTC	2	12	25299	25310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339505914
10	NC_015741	CAAGGG	2	12	25727	25738	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339505914
11	NC_015741	AGGCCA	2	12	25810	25821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505914
12	NC_015741	TCGTTG	2	12	28075	28086	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339505916
13	NC_015741	GATTGG	2	12	32997	33008	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	339505921
14	NC_015741	CAAACC	2	12	38470	38481	50 %	0 %	0 %	50 %	339505926
15	NC_015741	GGGCGC	2	12	48321	48332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505936
16	NC_015741	GGGGGA	2	12	49148	49159	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	339505937
17	NC_015741	CCAGCC	2	12	56206	56217	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	339505943
18	NC_015741	CGAAGG	2	12	60862	60873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339505946
19	NC_015741	GCCCAG	2	12	61905	61916	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339505946
20	NC_015741	TCGTAG	2	12	63978	63989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339505947
21	NC_015741	CGCATC	2	12	65931	65942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339505949
22	NC_015741	CGCCAG	2	12	66074	66085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339505949
23	NC_015741	GACAAC	2	12	72609	72620	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339505956
24	NC_015741	CATCCG	2	12	73676	73687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339505957
25	NC_015741	GATCAG	2	12	75011	75022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339505958
26	NC_015741	TCCGGC	2	12	76830	76841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339505960
27	NC_015741	CGTGCC	2	12	77238	77249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339505960
28	NC_015741	CGCAGC	2	12	82443	82454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339505962
29	NC_015741	TCACCT	2	12	84121	84132	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339505964
30	NC_015741	TGGGCA	2	12	85020	85031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339505965
31	NC_015741	CGCACT	2	12	90043	90054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339505971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.