MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	CGCGG	2	10	1478	1487	0 %	0 %	60 %	40 %	339505891
2	NC_015741	TGCGC	2	10	2097	2106	0 %	20 %	40 %	40 %	339505891
3	NC_015741	GCGCG	2	10	2244	2253	0 %	0 %	60 %	40 %	339505891
4	NC_015741	ACGGC	2	10	2849	2858	20 %	0 %	40 %	40 %	339505892
5	NC_015741	CGTTT	2	10	3694	3703	0 %	60 %	20 %	20 %	339505893
6	NC_015741	TTTCA	2	10	5939	5948	20 %	60 %	0 %	20 %	339505894
7	NC_015741	AAGGG	2	10	5971	5980	40 %	0 %	60 %	0 %	339505894
8	NC_015741	TCTGG	2	10	9784	9793	0 %	40 %	40 %	20 %	339505898
9	NC_015741	TGATA	2	10	10650	10659	40 %	40 %	20 %	0 %	339505899
10	NC_015741	CCGAT	2	10	11622	11631	20 %	20 %	20 %	40 %	339505900
11	NC_015741	CCATC	2	10	14089	14098	20 %	20 %	0 %	60 %	339505902
12	NC_015741	CGGTT	2	10	16084	16093	0 %	40 %	40 %	20 %	339505904
13	NC_015741	GCAAG	2	10	16584	16593	40 %	0 %	40 %	20 %	339505905
14	NC_015741	CGATG	2	10	17658	17667	20 %	20 %	40 %	20 %	339505906
15	NC_015741	GACGG	2	10	18475	18484	20 %	0 %	60 %	20 %	339505906
16	NC_015741	ACTTT	2	10	18873	18882	20 %	60 %	0 %	20 %	339505906
17	NC_015741	CTCGA	2	10	20525	20534	20 %	20 %	20 %	40 %	339505907
18	NC_015741	GGCGC	2	10	23978	23987	0 %	0 %	60 %	40 %	339505913
19	NC_015741	ACCGG	2	10	25695	25704	20 %	0 %	40 %	40 %	339505914
20	NC_015741	GCTGT	2	10	29372	29381	0 %	40 %	40 %	20 %	339505918
21	NC_015741	GCGCC	2	10	29707	29716	0 %	0 %	40 %	60 %	339505919
22	NC_015741	CGCGC	2	10	30534	30543	0 %	0 %	40 %	60 %	339505919
23	NC_015741	TGTGC	2	10	33569	33578	0 %	40 %	40 %	20 %	339505922
24	NC_015741	CCGGC	2	10	33587	33596	0 %	0 %	40 %	60 %	339505922
25	NC_015741	CCGCC	2	10	35735	35744	0 %	0 %	20 %	80 %	339505924
26	NC_015741	GACGC	2	10	39581	39590	20 %	0 %	40 %	40 %	339505928
27	NC_015741	GGATG	2	10	40205	40214	20 %	20 %	60 %	0 %	339505929
28	NC_015741	ACGGT	2	10	41260	41269	20 %	20 %	40 %	20 %	339505929
29	NC_015741	TGATC	2	10	42014	42023	20 %	40 %	20 %	20 %	339505930
30	NC_015741	CCCGC	2	10	42031	42040	0 %	0 %	20 %	80 %	339505930
31	NC_015741	TGATC	2	10	42446	42455	20 %	40 %	20 %	20 %	339505930
32	NC_015741	CGGGC	2	10	46897	46906	0 %	0 %	60 %	40 %	339505934
33	NC_015741	TGATC	2	10	47505	47514	20 %	40 %	20 %	20 %	339505935
34	NC_015741	GATCG	2	10	49445	49454	20 %	20 %	40 %	20 %	339505937
35	NC_015741	TGCGG	2	10	49811	49820	0 %	20 %	60 %	20 %	339505937
36	NC_015741	CAGTG	2	10	52978	52987	20 %	20 %	40 %	20 %	339505939
37	NC_015741	TGCGC	2	10	59360	59369	0 %	20 %	40 %	40 %	339505944
38	NC_015741	TGTCG	2	10	61043	61052	0 %	40 %	40 %	20 %	339505946
39	NC_015741	ATCGG	2	10	61080	61089	20 %	20 %	40 %	20 %	339505946
40	NC_015741	GATCC	2	10	61328	61337	20 %	20 %	20 %	40 %	339505946
41	NC_015741	CCCGG	2	10	61816	61825	0 %	0 %	40 %	60 %	339505946
42	NC_015741	CAGCG	2	10	62466	62475	20 %	0 %	40 %	40 %	339505946
43	NC_015741	GCCAA	2	10	65957	65966	40 %	0 %	20 %	40 %	339505949
44	NC_015741	CCCGG	2	10	66130	66139	0 %	0 %	40 %	60 %	339505949
45	NC_015741	AGATC	2	10	66586	66595	40 %	20 %	20 %	20 %	339505949
46	NC_015741	AAGGG	2	10	67444	67453	40 %	0 %	60 %	0 %	339505950
47	NC_015741	GCACA	2	10	69711	69720	40 %	0 %	20 %	40 %	339505953
48	NC_015741	CATCA	2	10	71269	71278	40 %	20 %	0 %	40 %	339505955
49	NC_015741	CTGCG	2	10	72651	72660	0 %	20 %	40 %	40 %	339505956
50	NC_015741	GCCGA	2	10	73546	73555	20 %	0 %	40 %	40 %	339505957
51	NC_015741	AACGC	2	10	74201	74210	40 %	0 %	20 %	40 %	339505957
52	NC_015741	TGTAT	2	10	74964	74973	20 %	60 %	20 %	0 %	339505958
53	NC_015741	GTCGG	2	10	75524	75533	0 %	20 %	60 %	20 %	339505958
54	NC_015741	GCCAA	2	10	78113	78122	40 %	0 %	20 %	40 %	339505961
55	NC_015741	GGCGC	2	10	79129	79138	0 %	0 %	60 %	40 %	339505961
56	NC_015741	TGTTC	2	10	80534	80543	0 %	60 %	20 %	20 %	339505962
57	NC_015741	TGCGC	2	10	80669	80678	0 %	20 %	40 %	40 %	339505962
58	NC_015741	TGATC	2	10	81581	81590	20 %	40 %	20 %	20 %	339505962
59	NC_015741	CAGGT	2	10	82555	82564	20 %	20 %	40 %	20 %	339505962
60	NC_015741	GCGCC	2	10	86274	86283	0 %	0 %	40 %	60 %	339505966
61	NC_015741	ACCTG	2	10	87245	87254	20 %	20 %	20 %	40 %	339505967
62	NC_015741	CCTGC	2	10	87295	87304	0 %	20 %	20 %	60 %	339505967
63	NC_015741	AACCC	2	10	87443	87452	40 %	0 %	0 %	60 %	339505968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.