MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	TCAA	2	8	246	253	50 %	25 %	0 %	25 %	339505890
2	NC_015741	GCCC	2	8	924	931	0 %	0 %	25 %	75 %	339505890
3	NC_015741	CATC	2	8	1269	1276	25 %	25 %	0 %	50 %	339505890
4	NC_015741	GATG	2	8	2154	2161	25 %	25 %	50 %	0 %	339505891
5	NC_015741	CGCA	2	8	3990	3997	25 %	0 %	25 %	50 %	339505893
6	NC_015741	GACA	2	8	5399	5406	50 %	0 %	25 %	25 %	339505894
7	NC_015741	TGCG	2	8	6470	6477	0 %	25 %	50 %	25 %	339505895
8	NC_015741	GGGC	2	8	6891	6898	0 %	0 %	75 %	25 %	339505896
9	NC_015741	CCGC	2	8	8214	8221	0 %	0 %	25 %	75 %	339505896
10	NC_015741	CTGG	2	8	8891	8898	0 %	25 %	50 %	25 %	339505897
11	NC_015741	GGCT	2	8	9159	9166	0 %	25 %	50 %	25 %	339505897
12	NC_015741	CCCG	2	8	9508	9515	0 %	0 %	25 %	75 %	339505898
13	NC_015741	GGCG	2	8	9565	9572	0 %	0 %	75 %	25 %	339505898
14	NC_015741	CCCG	2	8	9919	9926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_015741	TGTT	2	8	9973	9980	0 %	75 %	25 %	0 %	339505899
16	NC_015741	GGTC	2	8	10182	10189	0 %	25 %	50 %	25 %	339505899
17	NC_015741	TGCG	2	8	11286	11293	0 %	25 %	50 %	25 %	339505900
18	NC_015741	GGGC	2	8	11404	11411	0 %	0 %	75 %	25 %	339505900
19	NC_015741	CGGT	2	8	11516	11523	0 %	25 %	50 %	25 %	339505900
20	NC_015741	CTGC	2	8	12551	12558	0 %	25 %	25 %	50 %	339505901
21	NC_015741	TGGG	2	8	14071	14078	0 %	25 %	75 %	0 %	339505902
22	NC_015741	GGGC	2	8	14449	14456	0 %	0 %	75 %	25 %	339505903
23	NC_015741	CCCG	2	8	14466	14473	0 %	0 %	25 %	75 %	339505903
24	NC_015741	GTTC	2	8	14981	14988	0 %	50 %	25 %	25 %	339505903
25	NC_015741	GGCG	2	8	15106	15113	0 %	0 %	75 %	25 %	339505903
26	NC_015741	CCCG	2	8	15275	15282	0 %	0 %	25 %	75 %	339505903
27	NC_015741	GCCT	2	8	16186	16193	0 %	25 %	25 %	50 %	339505904
28	NC_015741	GCCA	2	8	16310	16317	25 %	0 %	25 %	50 %	339505904
29	NC_015741	CATC	2	8	17120	17127	25 %	25 %	0 %	50 %	339505905
30	NC_015741	TGCA	2	8	17465	17472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015741	TCGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	339505906
32	NC_015741	AACC	2	8	18024	18031	50 %	0 %	0 %	50 %	339505906
33	NC_015741	CAGC	2	8	18044	18051	25 %	0 %	25 %	50 %	339505906
34	NC_015741	GTGG	2	8	18220	18227	0 %	25 %	75 %	0 %	339505906
35	NC_015741	GGTT	2	8	18465	18472	0 %	50 %	50 %	0 %	339505906
36	NC_015741	TCGC	2	8	18931	18938	0 %	25 %	25 %	50 %	339505906
37	NC_015741	GAGC	2	8	19885	19892	25 %	0 %	50 %	25 %	339505907
38	NC_015741	GATG	2	8	20452	20459	25 %	25 %	50 %	0 %	339505907
39	NC_015741	GGAG	2	8	21060	21067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015741	GAAA	2	8	21699	21706	75 %	0 %	25 %	0 %	339505911
41	NC_015741	TGGG	2	8	21756	21763	0 %	25 %	75 %	0 %	339505911
42	NC_015741	GGGT	2	8	21929	21936	0 %	25 %	75 %	0 %	339505911
43	NC_015741	TCGG	2	8	22350	22357	0 %	25 %	50 %	25 %	339505911
44	NC_015741	CTGG	2	8	22818	22825	0 %	25 %	50 %	25 %	339505912
45	NC_015741	TCCG	2	8	23033	23040	0 %	25 %	25 %	50 %	339505912
46	NC_015741	ATCT	2	8	24213	24220	25 %	50 %	0 %	25 %	339505913
47	NC_015741	CTTC	2	8	24796	24803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015741	GTCA	2	8	24990	24997	25 %	25 %	25 %	25 %	339505914
49	NC_015741	GATC	2	8	25321	25328	25 %	25 %	25 %	25 %	339505914
50	NC_015741	CGTG	2	8	25538	25545	0 %	25 %	50 %	25 %	339505914
51	NC_015741	CGGG	2	8	26136	26143	0 %	0 %	75 %	25 %	339505914
52	NC_015741	CCAT	2	8	26985	26992	25 %	25 %	0 %	50 %	339505915
53	NC_015741	AGAA	2	8	28006	28013	75 %	0 %	25 %	0 %	339505916
54	NC_015741	GGGC	2	8	28621	28628	0 %	0 %	75 %	25 %	339505917
55	NC_015741	TGAT	2	8	29385	29392	25 %	50 %	25 %	0 %	339505918
56	NC_015741	GCTG	2	8	29816	29823	0 %	25 %	50 %	25 %	339505919
57	NC_015741	CCCG	2	8	30075	30082	0 %	0 %	25 %	75 %	339505919
58	NC_015741	GGTC	2	8	30578	30585	0 %	25 %	50 %	25 %	339505919
59	NC_015741	CAAT	2	8	31301	31308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015741	CAGA	2	8	32400	32407	50 %	0 %	25 %	25 %	339505921
61	NC_015741	GTCA	2	8	33510	33517	25 %	25 %	25 %	25 %	339505922
62	NC_015741	ATGA	2	8	33831	33838	50 %	25 %	25 %	0 %	339505922
63	NC_015741	CGGT	2	8	34428	34435	0 %	25 %	50 %	25 %	339505923
64	NC_015741	GTTT	2	8	34491	34498	0 %	75 %	25 %	0 %	339505923
65	NC_015741	GCCC	2	8	35068	35075	0 %	0 %	25 %	75 %	339505923
66	NC_015741	GCAC	2	8	35188	35195	25 %	0 %	25 %	50 %	339505923
67	NC_015741	TGCG	2	8	35638	35645	0 %	25 %	50 %	25 %	339505924
68	NC_015741	TGGC	2	8	36121	36128	0 %	25 %	50 %	25 %	339505924
69	NC_015741	TGCC	2	8	36191	36198	0 %	25 %	25 %	50 %	339505924
70	NC_015741	GGCA	2	8	36680	36687	25 %	0 %	50 %	25 %	339505924
71	NC_015741	TGGG	2	8	37586	37593	0 %	25 %	75 %	0 %	339505925
72	NC_015741	CTGA	2	8	38039	38046	25 %	25 %	25 %	25 %	339505926
73	NC_015741	TCGG	2	8	38660	38667	0 %	25 %	50 %	25 %	339505926
74	NC_015741	GACT	2	8	38712	38719	25 %	25 %	25 %	25 %	339505926
75	NC_015741	TCAG	2	8	38921	38928	25 %	25 %	25 %	25 %	339505927
76	NC_015741	GCTG	2	8	39334	39341	0 %	25 %	50 %	25 %	339505928
77	NC_015741	ATTC	2	8	40660	40667	25 %	50 %	0 %	25 %	339505929
78	NC_015741	AATC	2	8	42329	42336	50 %	25 %	0 %	25 %	339505930
79	NC_015741	GACC	2	8	42576	42583	25 %	0 %	25 %	50 %	339505930
80	NC_015741	GATG	2	8	42687	42694	25 %	25 %	50 %	0 %	339505930
81	NC_015741	AAGC	2	8	43247	43254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015741	CAGG	2	8	43343	43350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015741	GGCC	2	8	44247	44254	0 %	0 %	50 %	50 %	339505931
84	NC_015741	CACC	2	8	44416	44423	25 %	0 %	0 %	75 %	339505932
85	NC_015741	ATCC	2	8	44449	44456	25 %	25 %	0 %	50 %	339505932
86	NC_015741	AAAG	2	8	45377	45384	75 %	0 %	25 %	0 %	339505933
87	NC_015741	CGAC	2	8	45878	45885	25 %	0 %	25 %	50 %	339505934
88	NC_015741	CAAG	2	8	46601	46608	50 %	0 %	25 %	25 %	339505934
89	NC_015741	AATC	2	8	46757	46764	50 %	25 %	0 %	25 %	339505934
90	NC_015741	GCTG	2	8	47127	47134	0 %	25 %	50 %	25 %	339505934
91	NC_015741	TGCC	2	8	47306	47313	0 %	25 %	25 %	50 %	339505934
92	NC_015741	TCGG	2	8	48101	48108	0 %	25 %	50 %	25 %	339505935
93	NC_015741	GCCT	2	8	49523	49530	0 %	25 %	25 %	50 %	339505937
94	NC_015741	CTGG	2	8	50012	50019	0 %	25 %	50 %	25 %	339505937
95	NC_015741	GATG	2	8	50060	50067	25 %	25 %	50 %	0 %	339505937
96	NC_015741	ACAA	2	8	50894	50901	75 %	0 %	0 %	25 %	339505938
97	NC_015741	GTGA	2	8	51473	51480	25 %	25 %	50 %	0 %	339505938
98	NC_015741	CTGG	2	8	51611	51618	0 %	25 %	50 %	25 %	339505938
99	NC_015741	CAAG	2	8	52198	52205	50 %	0 %	25 %	25 %	339505939
100	NC_015741	CTCG	2	8	52213	52220	0 %	25 %	25 %	50 %	339505939
101	NC_015741	GCAA	2	8	53061	53068	50 %	0 %	25 %	25 %	339505939
102	NC_015741	CTGA	2	8	53718	53725	25 %	25 %	25 %	25 %	339505940
103	NC_015741	GCAA	2	8	54394	54401	50 %	0 %	25 %	25 %	339505941
104	NC_015741	TGAA	2	8	54463	54470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015741	TGTC	2	8	54832	54839	0 %	50 %	25 %	25 %	339505942
106	NC_015741	ATCA	2	8	56294	56301	50 %	25 %	0 %	25 %	339505943
107	NC_015741	CCGC	2	8	56577	56584	0 %	0 %	25 %	75 %	339505943
108	NC_015741	CGGT	2	8	56644	56651	0 %	25 %	50 %	25 %	339505943
109	NC_015741	TGAT	2	8	56937	56944	25 %	50 %	25 %	0 %	339505943
110	NC_015741	GACA	2	8	57401	57408	50 %	0 %	25 %	25 %	339505944
111	NC_015741	CACG	2	8	57415	57422	25 %	0 %	25 %	50 %	339505944
112	NC_015741	TCCA	2	8	57606	57613	25 %	25 %	0 %	50 %	339505944
113	NC_015741	TGAA	2	8	58030	58037	50 %	25 %	25 %	0 %	339505944
114	NC_015741	GGCC	2	8	58124	58131	0 %	0 %	50 %	50 %	339505944
115	NC_015741	ATGG	2	8	58236	58243	25 %	25 %	50 %	0 %	339505944
116	NC_015741	TGCC	2	8	58327	58334	0 %	25 %	25 %	50 %	339505944
117	NC_015741	GGTC	2	8	58403	58410	0 %	25 %	50 %	25 %	339505944
118	NC_015741	ACCC	2	8	59570	59577	25 %	0 %	0 %	75 %	339505944
119	NC_015741	CACG	2	8	59823	59830	25 %	0 %	25 %	50 %	339505944
120	NC_015741	GGGC	2	8	60131	60138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015741	TGAT	2	8	60159	60166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015741	CGAC	2	8	60918	60925	25 %	0 %	25 %	50 %	339505946
123	NC_015741	GATG	2	8	61342	61349	25 %	25 %	50 %	0 %	339505946
124	NC_015741	GCCC	2	8	61361	61368	0 %	0 %	25 %	75 %	339505946
125	NC_015741	CTGA	2	8	61463	61470	25 %	25 %	25 %	25 %	339505946
126	NC_015741	TGCC	2	8	63064	63071	0 %	25 %	25 %	50 %	339505946
127	NC_015741	TGCC	2	8	63115	63122	0 %	25 %	25 %	50 %	339505946
128	NC_015741	CGCC	2	8	64015	64022	0 %	0 %	25 %	75 %	339505947
129	NC_015741	CCTG	2	8	64172	64179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015741	CCGT	2	8	64568	64575	0 %	25 %	25 %	50 %	339505948
131	NC_015741	GCCA	2	8	64695	64702	25 %	0 %	25 %	50 %	339505948
132	NC_015741	CATC	2	8	64734	64741	25 %	25 %	0 %	50 %	339505948
133	NC_015741	TTCA	2	8	65413	65420	25 %	50 %	0 %	25 %	339505948
134	NC_015741	AGCA	2	8	65629	65636	50 %	0 %	25 %	25 %	339505948
135	NC_015741	CGAG	2	8	65761	65768	25 %	0 %	50 %	25 %	339505949
136	NC_015741	CGGA	2	8	66403	66410	25 %	0 %	50 %	25 %	339505949
137	NC_015741	TTCT	2	8	66686	66693	0 %	75 %	0 %	25 %	339505949
138	NC_015741	TCGG	2	8	66871	66878	0 %	25 %	50 %	25 %	339505949
139	NC_015741	GCAG	2	8	66894	66901	25 %	0 %	50 %	25 %	339505949
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.