MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 1133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	GCG	2	6	202	207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505890
2	NC_015741	CGA	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505890
3	NC_015741	GCC	2	6	318	323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505890
4	NC_015741	CGA	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505890
5	NC_015741	GCC	2	6	360	365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505890
6	NC_015741	GCG	2	6	491	496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505890
7	NC_015741	GGA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505890
8	NC_015741	CAT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505890
9	NC_015741	TCG	2	6	804	809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505890
10	NC_015741	GCC	2	6	860	865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505890
11	NC_015741	CGG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505890
12	NC_015741	GCG	2	6	965	970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505890
13	NC_015741	CCA	2	6	1017	1022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505890
14	NC_015741	CTG	2	6	1133	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505890
15	NC_015741	GCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505890
16	NC_015741	GGC	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505890
17	NC_015741	GGA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505890
18	NC_015741	CGG	2	6	1411	1416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505891
19	NC_015741	TGC	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505891
20	NC_015741	AAC	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505891
21	NC_015741	GGC	2	6	1494	1499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505891
22	NC_015741	CAG	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505891
23	NC_015741	TGG	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505891
24	NC_015741	GTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505891
25	NC_015741	TGG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505891
26	NC_015741	GCG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505891
27	NC_015741	CGG	2	6	2222	2227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505891
28	NC_015741	AGC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505891
29	NC_015741	GCG	2	6	2365	2370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505891
30	NC_015741	CTG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505891
31	NC_015741	GCA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505892
32	NC_015741	GTC	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505892
33	NC_015741	CAT	3	9	2694	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505892
34	NC_015741	ATA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339505892
35	NC_015741	TGC	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505892
36	NC_015741	CAG	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505892
37	NC_015741	CAA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505892
38	NC_015741	GCC	2	6	2997	3002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505892
39	NC_015741	ATG	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505892
40	NC_015741	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505892
41	NC_015741	GCA	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505892
42	NC_015741	TCG	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505892
43	NC_015741	TGC	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505892
44	NC_015741	GTG	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505892
45	NC_015741	GCT	2	6	3523	3528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505893
46	NC_015741	CTG	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505893
47	NC_015741	CAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
48	NC_015741	TTG	2	6	3636	3641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505893
49	NC_015741	GCC	4	12	3663	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505893
50	NC_015741	AGC	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
51	NC_015741	ACG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
52	NC_015741	CAG	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
53	NC_015741	GCA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
54	NC_015741	TCA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505893
55	NC_015741	TCT	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505893
56	NC_015741	TCG	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505893
57	NC_015741	GCC	2	6	4327	4332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505893
58	NC_015741	GCG	2	6	4441	4446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505893
59	NC_015741	AGC	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
60	NC_015741	CAG	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505893
61	NC_015741	CAT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505893
62	NC_015741	CGC	2	6	5052	5057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505894
63	NC_015741	GCC	2	6	5130	5135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505894
64	NC_015741	GCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505894
65	NC_015741	ATC	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505894
66	NC_015741	TGA	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505894
67	NC_015741	AGC	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505894
68	NC_015741	CGA	2	6	5554	5559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505894
69	NC_015741	TCC	2	6	5565	5570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339505894
70	NC_015741	CAG	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505894
71	NC_015741	GGC	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505894
72	NC_015741	CGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505894
73	NC_015741	CGA	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505894
74	NC_015741	TTC	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505895
75	NC_015741	TCG	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505895
76	NC_015741	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505895
77	NC_015741	GCA	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505895
78	NC_015741	ATC	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505895
79	NC_015741	CGC	2	6	6381	6386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505895
80	NC_015741	TGC	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505895
81	NC_015741	CGG	2	6	6519	6524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505895
82	NC_015741	CAT	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505895
83	NC_015741	ATG	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505896
84	NC_015741	CGG	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505896
85	NC_015741	CGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505896
86	NC_015741	CAG	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505896
87	NC_015741	TGG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505896
88	NC_015741	TGC	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505896
89	NC_015741	GCT	2	6	7332	7337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505896
90	NC_015741	TGG	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505896
91	NC_015741	TGA	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505896
92	NC_015741	GTG	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505896
93	NC_015741	TGG	2	6	7664	7669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505896
94	NC_015741	GAT	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505896
95	NC_015741	GCT	2	6	8082	8087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505896
96	NC_015741	GTC	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505896
97	NC_015741	TGG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505896
98	NC_015741	GCG	2	6	8418	8423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505897
99	NC_015741	TGC	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505897
100	NC_015741	GAT	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505897
101	NC_015741	GGC	2	6	8569	8574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505897
102	NC_015741	GGA	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505897
103	NC_015741	GAT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505897
104	NC_015741	GCG	2	6	8867	8872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505897
105	NC_015741	AGG	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505897
106	NC_015741	GTC	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505897
107	NC_015741	TGG	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505897
108	NC_015741	CGG	2	6	9268	9273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505897
109	NC_015741	GTT	2	6	9457	9462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505898
110	NC_015741	CCG	2	6	9464	9469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505898
111	NC_015741	AAC	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505898
112	NC_015741	TTC	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505898
113	NC_015741	ATC	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505898
114	NC_015741	ATC	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505899
115	NC_015741	TGA	2	6	10101	10106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505899
116	NC_015741	GTG	2	6	10130	10135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505899
117	NC_015741	GAT	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505899
118	NC_015741	TGT	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505899
119	NC_015741	TTC	2	6	10212	10217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505899
120	NC_015741	GCC	2	6	10273	10278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505899
121	NC_015741	GGT	2	6	10342	10347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505899
122	NC_015741	GGA	2	6	10351	10356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505899
123	NC_015741	CCG	2	6	10526	10531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505899
124	NC_015741	CGT	2	6	10540	10545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505899
125	NC_015741	GCG	2	6	10613	10618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505899
126	NC_015741	CAG	2	6	10624	10629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505899
127	NC_015741	CGG	2	6	10823	10828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505900
128	NC_015741	GTT	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505900
129	NC_015741	TCA	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505900
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131	NC_015741	CGT	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505900
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250	NC_015741	GAA	2	6	20195	20200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505907
251	NC_015741	GCG	2	6	20330	20335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505907
252	NC_015741	CCG	2	6	20338	20343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505907
253	NC_015741	GTT	2	6	20410	20415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505907
254	NC_015741	GCG	2	6	20485	20490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505907
255	NC_015741	TCG	2	6	20535	20540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505907
256	NC_015741	GCA	2	6	20591	20596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505907
257	NC_015741	CGA	2	6	20620	20625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505907
258	NC_015741	GTG	2	6	20630	20635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505907
259	NC_015741	GGA	2	6	20683	20688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505907
260	NC_015741	ATG	2	6	20716	20721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505908
261	NC_015741	ACC	2	6	20725	20730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505908
262	NC_015741	ATT	2	6	20803	20808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339505908
263	NC_015741	ATC	2	6	20917	20922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505908
264	NC_015741	GAT	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505908
265	NC_015741	CTA	2	6	20943	20948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505908
266	NC_015741	ATA	2	6	21139	21144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339505909
267	NC_015741	GAT	2	6	21383	21388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505910
268	NC_015741	CAG	2	6	21404	21409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505910
269	NC_015741	GGC	2	6	21428	21433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505910
270	NC_015741	GCC	2	6	21435	21440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505910
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272	NC_015741	CTT	2	6	21779	21784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505911
273	NC_015741	GAC	2	6	21791	21796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505911
274	NC_015741	ACT	2	6	21809	21814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505911
275	NC_015741	GCT	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505911
276	NC_015741	ATC	2	6	21945	21950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505911
277	NC_015741	TCA	2	6	21973	21978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505911
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280	NC_015741	GGC	2	6	22254	22259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505911
281	NC_015741	TTC	2	6	22326	22331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505911
282	NC_015741	CTG	2	6	22386	22391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505911
283	NC_015741	CGG	2	6	22414	22419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505911
284	NC_015741	ATC	3	9	22425	22433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505911
285	NC_015741	TGG	2	6	22467	22472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505911
286	NC_015741	TGG	2	6	22476	22481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505911
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290	NC_015741	TTC	2	6	22648	22653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505912
291	NC_015741	TTA	2	6	22695	22700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339505912
292	NC_015741	GCC	2	6	22833	22838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505912
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497	NC_015741	TGA	2	6	40694	40699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505929
498	NC_015741	CTG	2	6	40737	40742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505929
499	NC_015741	CCA	2	6	40751	40756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505929
500	NC_015741	CAT	2	6	40790	40795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505929

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