MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015741	CA	3	6	87	92	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015741	CA	3	6	106	111	50 %	0 %	0 %	50 %	339505890
3	NC_015741	CG	3	6	425	430	0 %	0 %	50 %	50 %	339505890
4	NC_015741	GC	3	6	608	613	0 %	0 %	50 %	50 %	339505890
5	NC_015741	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	339505890
6	NC_015741	CG	3	6	1169	1174	0 %	0 %	50 %	50 %	339505890
7	NC_015741	CA	3	6	1216	1221	50 %	0 %	0 %	50 %	339505890
8	NC_015741	GC	4	8	1318	1325	0 %	0 %	50 %	50 %	339505890
9	NC_015741	GC	3	6	1867	1872	0 %	0 %	50 %	50 %	339505891
10	NC_015741	CG	4	8	2123	2130	0 %	0 %	50 %	50 %	339505891
11	NC_015741	GC	3	6	2187	2192	0 %	0 %	50 %	50 %	339505891
12	NC_015741	CG	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	339505891
13	NC_015741	GT	4	8	2638	2645	0 %	50 %	50 %	0 %	339505892
14	NC_015741	CA	3	6	3047	3052	50 %	0 %	0 %	50 %	339505892
15	NC_015741	GC	4	8	3096	3103	0 %	0 %	50 %	50 %	339505892
16	NC_015741	GC	3	6	3401	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
17	NC_015741	GC	3	6	3562	3567	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
18	NC_015741	GC	5	10	4017	4026	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
19	NC_015741	CG	3	6	4295	4300	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
20	NC_015741	GC	4	8	4412	4419	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
21	NC_015741	CG	3	6	4876	4881	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
22	NC_015741	GC	3	6	4888	4893	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
23	NC_015741	CG	3	6	4956	4961	0 %	0 %	50 %	50 %	339505893
24	NC_015741	CG	4	8	5017	5024	0 %	0 %	50 %	50 %	339505894
25	NC_015741	CG	3	6	5138	5143	0 %	0 %	50 %	50 %	339505894
26	NC_015741	GC	4	8	5610	5617	0 %	0 %	50 %	50 %	339505894
27	NC_015741	GC	4	8	5845	5852	0 %	0 %	50 %	50 %	339505894
28	NC_015741	GC	3	6	6308	6313	0 %	0 %	50 %	50 %	339505895
29	NC_015741	GC	3	6	6610	6615	0 %	0 %	50 %	50 %	339505895
30	NC_015741	CG	3	6	6853	6858	0 %	0 %	50 %	50 %	339505896
31	NC_015741	GC	5	10	6860	6869	0 %	0 %	50 %	50 %	339505896
32	NC_015741	GC	3	6	7338	7343	0 %	0 %	50 %	50 %	339505896
33	NC_015741	TG	3	6	7898	7903	0 %	50 %	50 %	0 %	339505896
34	NC_015741	CG	3	6	8634	8639	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
35	NC_015741	CG	3	6	8723	8728	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
36	NC_015741	CG	3	6	9034	9039	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
37	NC_015741	GC	3	6	9061	9066	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
38	NC_015741	CG	3	6	9125	9130	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
39	NC_015741	GC	3	6	9132	9137	0 %	0 %	50 %	50 %	339505897
40	NC_015741	GT	3	6	9822	9827	0 %	50 %	50 %	0 %	339505898
41	NC_015741	GC	3	6	9848	9853	0 %	0 %	50 %	50 %	339505898
42	NC_015741	GC	4	8	10031	10038	0 %	0 %	50 %	50 %	339505899
43	NC_015741	GC	3	6	11003	11008	0 %	0 %	50 %	50 %	339505900
44	NC_015741	CG	4	8	11070	11077	0 %	0 %	50 %	50 %	339505900
45	NC_015741	GC	3	6	11208	11213	0 %	0 %	50 %	50 %	339505900
46	NC_015741	GC	3	6	11502	11507	0 %	0 %	50 %	50 %	339505900
47	NC_015741	CG	4	8	11650	11657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015741	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	339505901
49	NC_015741	GC	3	6	11894	11899	0 %	0 %	50 %	50 %	339505901
50	NC_015741	GT	3	6	12040	12045	0 %	50 %	50 %	0 %	339505901
51	NC_015741	GC	3	6	12415	12420	0 %	0 %	50 %	50 %	339505901
52	NC_015741	CG	3	6	12925	12930	0 %	0 %	50 %	50 %	339505901
53	NC_015741	CG	3	6	13433	13438	0 %	0 %	50 %	50 %	339505902
54	NC_015741	GC	3	6	13680	13685	0 %	0 %	50 %	50 %	339505902
55	NC_015741	GC	3	6	14320	14325	0 %	0 %	50 %	50 %	339505903
56	NC_015741	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	339505903
57	NC_015741	GC	3	6	14702	14707	0 %	0 %	50 %	50 %	339505903
58	NC_015741	AC	3	6	15358	15363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015741	GA	3	6	15606	15611	50 %	0 %	50 %	0 %	339505904
60	NC_015741	GT	3	6	15714	15719	0 %	50 %	50 %	0 %	339505904
61	NC_015741	GC	3	6	15863	15868	0 %	0 %	50 %	50 %	339505904
62	NC_015741	CG	3	6	16254	16259	0 %	0 %	50 %	50 %	339505904
63	NC_015741	GT	3	6	16745	16750	0 %	50 %	50 %	0 %	339505905
64	NC_015741	TC	3	6	16969	16974	0 %	50 %	0 %	50 %	339505905
65	NC_015741	GC	3	6	17422	17427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015741	GC	3	6	17701	17706	0 %	0 %	50 %	50 %	339505906
67	NC_015741	GC	4	8	17897	17904	0 %	0 %	50 %	50 %	339505906
68	NC_015741	TG	3	6	18034	18039	0 %	50 %	50 %	0 %	339505906
69	NC_015741	CA	3	6	18132	18137	50 %	0 %	0 %	50 %	339505906
70	NC_015741	GC	3	6	18575	18580	0 %	0 %	50 %	50 %	339505906
71	NC_015741	CG	3	6	18645	18650	0 %	0 %	50 %	50 %	339505906
72	NC_015741	GC	3	6	19040	19045	0 %	0 %	50 %	50 %	339505906
73	NC_015741	CG	3	6	19244	19249	0 %	0 %	50 %	50 %	339505907
74	NC_015741	GC	3	6	19450	19455	0 %	0 %	50 %	50 %	339505907
75	NC_015741	GA	3	6	19825	19830	50 %	0 %	50 %	0 %	339505907
76	NC_015741	GC	3	6	19951	19956	0 %	0 %	50 %	50 %	339505907
77	NC_015741	CG	3	6	20204	20209	0 %	0 %	50 %	50 %	339505907
78	NC_015741	GC	3	6	20647	20652	0 %	0 %	50 %	50 %	339505907
79	NC_015741	CG	3	6	20750	20755	0 %	0 %	50 %	50 %	339505908
80	NC_015741	CG	3	6	20896	20901	0 %	0 %	50 %	50 %	339505908
81	NC_015741	TG	3	6	21004	21009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015741	GA	3	6	21286	21291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015741	GC	3	6	22938	22943	0 %	0 %	50 %	50 %	339505912
84	NC_015741	CG	3	6	24384	24389	0 %	0 %	50 %	50 %	339505913
85	NC_015741	GC	3	6	24968	24973	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
86	NC_015741	CG	3	6	25471	25476	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
87	NC_015741	GC	3	6	25556	25561	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
88	NC_015741	CG	3	6	25689	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
89	NC_015741	GC	3	6	26272	26277	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
90	NC_015741	CG	3	6	26308	26313	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
91	NC_015741	CG	3	6	26882	26887	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
92	NC_015741	GC	4	8	27015	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
93	NC_015741	CG	3	6	27536	27541	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
94	NC_015741	GC	3	6	27664	27669	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
95	NC_015741	GC	3	6	28296	28301	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
96	NC_015741	CG	3	6	28516	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
97	NC_015741	CG	4	8	28679	28686	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
98	NC_015741	GC	3	6	29020	29025	0 %	0 %	50 %	50 %	339505918
99	NC_015741	GT	3	6	29780	29785	0 %	50 %	50 %	0 %	339505919
100	NC_015741	AT	3	6	29892	29897	50 %	50 %	0 %	0 %	339505919
101	NC_015741	GC	3	6	30669	30674	0 %	0 %	50 %	50 %	339505919
102	NC_015741	TC	3	6	31142	31147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015741	GT	3	6	31691	31696	0 %	50 %	50 %	0 %	339505920
104	NC_015741	GC	3	6	31845	31850	0 %	0 %	50 %	50 %	339505920
105	NC_015741	CG	3	6	32629	32634	0 %	0 %	50 %	50 %	339505921
106	NC_015741	CG	4	8	33807	33814	0 %	0 %	50 %	50 %	339505922
107	NC_015741	GC	3	6	34002	34007	0 %	0 %	50 %	50 %	339505922
108	NC_015741	GC	3	6	34068	34073	0 %	0 %	50 %	50 %	339505922
109	NC_015741	GC	3	6	34216	34221	0 %	0 %	50 %	50 %	339505923
110	NC_015741	AT	3	6	35099	35104	50 %	50 %	0 %	0 %	339505923
111	NC_015741	CG	3	6	35299	35304	0 %	0 %	50 %	50 %	339505923
112	NC_015741	TG	3	6	35388	35393	0 %	50 %	50 %	0 %	339505923
113	NC_015741	GC	3	6	35974	35979	0 %	0 %	50 %	50 %	339505924
114	NC_015741	CG	3	6	36171	36176	0 %	0 %	50 %	50 %	339505924
115	NC_015741	GC	3	6	36635	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	339505924
116	NC_015741	CG	3	6	36662	36667	0 %	0 %	50 %	50 %	339505924
117	NC_015741	CA	3	6	36861	36866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015741	TG	3	6	37024	37029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015741	CG	4	8	37407	37414	0 %	0 %	50 %	50 %	339505925
120	NC_015741	GC	3	6	37491	37496	0 %	0 %	50 %	50 %	339505925
121	NC_015741	CG	3	6	38276	38281	0 %	0 %	50 %	50 %	339505926
122	NC_015741	GC	3	6	38584	38589	0 %	0 %	50 %	50 %	339505926
123	NC_015741	AG	3	6	38848	38853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015741	GC	3	6	39862	39867	0 %	0 %	50 %	50 %	339505929
125	NC_015741	GC	3	6	40371	40376	0 %	0 %	50 %	50 %	339505929
126	NC_015741	CG	3	6	40636	40641	0 %	0 %	50 %	50 %	339505929
127	NC_015741	GC	3	6	40811	40816	0 %	0 %	50 %	50 %	339505929
128	NC_015741	GC	3	6	41194	41199	0 %	0 %	50 %	50 %	339505929
129	NC_015741	GA	3	6	41321	41326	50 %	0 %	50 %	0 %	339505929
130	NC_015741	GC	3	6	41836	41841	0 %	0 %	50 %	50 %	339505930
131	NC_015741	TG	3	6	41851	41856	0 %	50 %	50 %	0 %	339505930
132	NC_015741	AC	3	6	42323	42328	50 %	0 %	0 %	50 %	339505930
133	NC_015741	GC	3	6	42850	42855	0 %	0 %	50 %	50 %	339505930
134	NC_015741	GC	3	6	43094	43099	0 %	0 %	50 %	50 %	339505930
135	NC_015741	TG	3	6	43258	43263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015741	TG	3	6	43600	43605	0 %	50 %	50 %	0 %	339505931
137	NC_015741	GC	3	6	43994	43999	0 %	0 %	50 %	50 %	339505931
138	NC_015741	CG	3	6	44241	44246	0 %	0 %	50 %	50 %	339505931
139	NC_015741	AT	3	6	44271	44276	50 %	50 %	0 %	0 %	339505931
140	NC_015741	GC	3	6	44853	44858	0 %	0 %	50 %	50 %	339505933
141	NC_015741	CG	3	6	44891	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	339505933
142	NC_015741	GT	3	6	45164	45169	0 %	50 %	50 %	0 %	339505933
143	NC_015741	TG	3	6	45598	45603	0 %	50 %	50 %	0 %	339505934
144	NC_015741	GC	3	6	45630	45635	0 %	0 %	50 %	50 %	339505934
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.