MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eggerthella sp. YY7918

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015738	TGCTAC	2	12	18912	18923	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015738	CTGCCC	2	12	26643	26654	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015738	GGGGCA	2	12	28183	28194	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015738	ACGAAG	2	12	28799	28810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015738	GAAAAC	2	12	93602	93613	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015738	CGTTTC	2	12	101957	101968	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015738	CTTGCG	2	12	117208	117219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015738	CCGCAG	2	12	196942	196953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015738	CTTTTC	2	12	219150	219161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015738	TGAGGG	2	12	262942	262953	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015738	GAGAGG	2	12	277116	277127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015738	GCCGAT	2	12	293722	293733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015738	AAAGAG	2	12	362365	362376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015738	TGCGTG	2	12	400011	400022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015738	TGCGGG	2	12	448966	448977	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015738	TACTTC	2	12	473641	473652	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015738	TTCGGT	2	12	536103	536114	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015738	TCGCGT	2	12	565159	565170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015738	TCCCTT	2	12	690277	690288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015738	TGCTGA	2	12	704679	704690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015738	TCGCCA	2	12	705360	705371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015738	CGTGTT	2	12	745077	745088	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015738	TGCTGT	2	12	762883	762894	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015738	ATTGCG	2	12	850221	850232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015738	CGCTGT	2	12	961095	961106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015738	ACAAAA	2	12	978538	978549	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015738	GATTTA	2	12	978674	978685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015738	GTCGCG	2	12	1055159	1055170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015738	ACAAAA	2	12	1089090	1089101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015738	GATTTA	2	12	1089226	1089237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015738	TTTCGG	2	12	1114484	1114495	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015738	GCGCAC	2	12	1114526	1114537	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015738	TGGTGA	2	12	1165947	1165958	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015738	CGTGCG	2	12	1256938	1256949	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015738	TCAAAA	2	12	1257077	1257088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015738	GAAAAA	2	12	1423187	1423198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015738	TCATTT	2	12	1425557	1425568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015738	CCTTTG	2	12	1461742	1461753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015738	CTCCTT	2	12	1513586	1513597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015738	GCTACG	2	12	1616363	1616374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015738	GAAGTT	2	12	1643083	1643094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015738	TTCGGT	2	12	1647713	1647724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015738	CCGAGG	2	12	1688916	1688927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015738	ATCCAC	2	12	1715235	1715246	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015738	TGCTTC	2	12	1721117	1721128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015738	TGCACA	2	12	1741186	1741197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015738	TCGCAT	2	12	1774036	1774047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015738	TATTAA	2	12	1780442	1780453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015738	CCTTTT	2	12	1788481	1788492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015738	CTTTTG	2	12	1846800	1846811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015738	ACGGAG	2	12	1882564	1882575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015738	CCTAAA	2	12	1923466	1923477	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015738	CTTCGC	2	12	1963021	1963032	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015738	GTTGCG	2	12	2032466	2032477	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015738	CAAGGA	2	12	2066229	2066240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015738	CGTCGG	2	12	2085782	2085793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015738	TCGATC	2	12	2101869	2101880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015738	GAAGTA	2	12	2151760	2151771	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015738	TTACCA	2	12	2214156	2214167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015738	TCAATG	2	12	2407166	2407177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015738	ACGATG	2	12	2410727	2410738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015738	TCTGCA	2	12	2456161	2456172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015738	CGCGAA	2	12	2461263	2461274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015738	AGGGTG	2	12	2498850	2498861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015738	CGCATG	2	12	2534167	2534178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015738	CATGCC	2	12	2677958	2677969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015738	AGACCA	2	12	2681259	2681270	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015738	GCAAGA	2	12	2788909	2788920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015738	TGAAAA	2	12	2814807	2814818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015738	AGAGCT	2	12	2961917	2961928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015738	TCTTTG	2	12	2965087	2965098	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015738	CTTCTC	2	12	2979450	2979461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015738	GCGGCA	2	12	3032384	3032395	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015738	AGAGGA	2	12	3100451	3100462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.