MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	ATTTTA	2	12	29966	29977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015737	CTTCCT	2	12	32090	32101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015737	ATTCTT	2	12	47680	47691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015737	GCATAA	2	12	58405	58416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015737	GAAAAA	2	12	148220	148231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015737	ATTTCT	2	12	173559	173570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015737	GAAAAA	2	12	219611	219622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015737	TTCTCT	2	12	235357	235368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015737	AGAAAA	2	12	312804	312815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015737	CTTTCT	2	12	342063	342074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015737	TTTCTT	2	12	404790	404801	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015737	CTTTTC	2	12	417926	417937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015737	TTTCTG	2	12	536689	536700	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015737	TATTTT	2	12	573553	573564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015737	ACTCCT	2	12	578718	578729	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015737	CTTACA	2	12	578829	578840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015737	AACATA	2	12	622856	622867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015737	GGGGGT	2	12	658672	658683	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015737	CTTTTT	2	12	674853	674864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015737	CAGCGG	2	12	715271	715282	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015737	GGCGCC	2	12	718995	719006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015737	CTCTTT	2	12	734247	734258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015737	CTTTAT	2	12	780893	780904	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015737	TTTGAA	2	12	827318	827329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015737	CAATTC	2	12	827488	827499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015737	GGAGAA	2	12	859583	859594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015737	TTCTCC	2	12	863428	863439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015737	CTGTCT	2	12	909474	909485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015737	ACCAGG	2	12	917108	917119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015737	ATACCT	2	12	925217	925228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015737	CTTTCT	2	12	970683	970694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015737	GCTTCT	2	12	973306	973317	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015737	ACGGAG	2	12	999936	999947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015737	TTTCTT	2	12	1020271	1020282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015737	TTTCCG	2	12	1020291	1020302	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015737	CAGGGA	2	12	1020410	1020421	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015737	TCTTCA	2	12	1050663	1050674	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015737	ATCTGC	2	12	1050754	1050765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015737	TTACAT	2	12	1100939	1100950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015737	CCGGAC	2	12	1102019	1102030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015737	AAAGAA	2	12	1130700	1130711	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015737	CTTTAA	2	12	1154376	1154387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015737	TGAAAA	2	12	1190394	1190405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015737	AAAAAT	2	12	1190550	1190561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015737	CAAAAG	2	12	1201448	1201459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015737	GACAGG	2	12	1202917	1202928	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015737	ATTCCA	2	12	1204847	1204858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015737	ACAGAA	2	12	1228629	1228640	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015737	AAAATA	2	12	1293203	1293214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015737	GACAGG	2	12	1320647	1320658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015737	TTTTGC	2	12	1340318	1340329	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015737	CAAAAA	2	12	1344665	1344676	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015737	TTTCTC	2	12	1356714	1356725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015737	AGTCGA	2	12	1363123	1363134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015737	TAAAAA	2	12	1384734	1384745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015737	CATATA	2	12	1427808	1427819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015737	GTTTCC	2	12	1431185	1431196	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015737	AGCATC	2	12	1445934	1445945	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015737	TGTCAG	2	12	1503098	1503109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015737	TAAAAA	2	12	1508813	1508824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015737	GTTTCC	2	12	1564128	1564139	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015737	CAGAAA	2	12	1580356	1580367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015737	ACCAGA	2	12	1672273	1672284	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015737	TTTCAT	2	12	1676434	1676445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015737	TTTCTT	2	12	1691979	1691990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015737	AAGGGA	2	12	1706079	1706090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015737	AAATAT	2	12	1859264	1859275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015737	CAGAAA	2	12	1872289	1872300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015737	GCGAGG	2	12	1965253	1965264	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015737	ATTGAA	2	12	1974974	1974985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015737	TTGCCT	2	12	2083702	2083713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015737	TAAAAA	2	12	2108493	2108504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015737	ATTTTG	2	12	2109451	2109462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015737	AAAAAT	2	12	2151318	2151329	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015737	GAAAGA	2	12	2185784	2185795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015737	CCGGCG	2	12	2204021	2204032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015737	TTTCTT	2	12	2292219	2292230	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015737	GGATCC	2	12	2292283	2292294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015737	TATCTG	2	12	2338465	2338476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015737	AAATAA	2	12	2383782	2383793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015737	CTTCTG	2	12	2492226	2492237	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015737	CGCTTC	2	12	2520890	2520901	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015737	CTCCGG	2	12	2537366	2537377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015737	GTTTCT	2	12	2610258	2610269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015737	GGCCTG	2	12	2628465	2628476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015737	GACTCC	2	12	2650524	2650535	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015737	TTTCAT	2	12	2664420	2664431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015737	CTGCCG	2	12	2695069	2695080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015737	TGTTTT	2	12	2713616	2713627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015737	CAAAAA	2	12	2722143	2722154	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015737	TTTCTC	2	12	2740114	2740125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015737	TCACTA	2	12	2758524	2758535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.