MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 1696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	GCGCA	2	10	1145	1154	20 %	0 %	40 %	40 %	339441065
2	NC_015737	TCCGT	2	10	1513	1522	0 %	40 %	20 %	40 %	339441065
3	NC_015737	TCCGC	2	10	3249	3258	0 %	20 %	20 %	60 %	339441066
4	NC_015737	TTTTC	2	10	8852	8861	0 %	80 %	0 %	20 %	339441072
5	NC_015737	CGAAG	2	10	9254	9263	40 %	0 %	40 %	20 %	339441072
6	NC_015737	TACGG	2	10	11467	11476	20 %	20 %	40 %	20 %	339441075
7	NC_015737	TTTGC	2	10	14280	14289	0 %	60 %	20 %	20 %	339441078
8	NC_015737	GTTTT	2	10	15267	15276	0 %	80 %	20 %	0 %	339441079
9	NC_015737	TCTGC	2	10	15725	15734	0 %	40 %	20 %	40 %	339441079
10	NC_015737	GCCTG	2	10	16265	16274	0 %	20 %	40 %	40 %	339441080
11	NC_015737	TCCTT	2	10	18118	18127	0 %	60 %	0 %	40 %	339441081
12	NC_015737	GATCC	2	10	20014	20023	20 %	20 %	20 %	40 %	339441084
13	NC_015737	TTCCT	2	10	22477	22486	0 %	60 %	0 %	40 %	339441085
14	NC_015737	CTTCT	2	10	24877	24886	0 %	60 %	0 %	40 %	339441088
15	NC_015737	GAACA	2	10	29654	29663	60 %	0 %	20 %	20 %	339441094
16	NC_015737	GTCTT	2	10	30670	30679	0 %	60 %	20 %	20 %	339441095
17	NC_015737	CAAGG	2	10	34923	34932	40 %	0 %	40 %	20 %	339441098
18	NC_015737	ACGGA	2	10	37611	37620	40 %	0 %	40 %	20 %	339441100
19	NC_015737	TACGC	2	10	37870	37879	20 %	20 %	20 %	40 %	339441101
20	NC_015737	CGTTC	2	10	38029	38038	0 %	40 %	20 %	40 %	339441101
21	NC_015737	GCCGC	2	10	39738	39747	0 %	0 %	40 %	60 %	339441103
22	NC_015737	CACTG	2	10	44157	44166	20 %	20 %	20 %	40 %	339441107
23	NC_015737	ATATT	2	10	44320	44329	40 %	60 %	0 %	0 %	339441107
24	NC_015737	TGCAC	2	10	47060	47069	20 %	20 %	20 %	40 %	339441108
25	NC_015737	AACAA	2	10	49263	49272	80 %	0 %	0 %	20 %	339441110
26	NC_015737	GCCAG	2	10	49318	49327	20 %	0 %	40 %	40 %	339441110
27	NC_015737	GGGTC	2	10	53825	53834	0 %	20 %	60 %	20 %	339441115
28	NC_015737	CGCAG	2	10	55429	55438	20 %	0 %	40 %	40 %	339441115
29	NC_015737	CCATA	2	10	55497	55506	40 %	20 %	0 %	40 %	339441115
30	NC_015737	ATTAT	2	10	58057	58066	40 %	60 %	0 %	0 %	339441116
31	NC_015737	CCGTT	2	10	58662	58671	0 %	40 %	20 %	40 %	339441117
32	NC_015737	ATTTA	2	10	61572	61581	40 %	60 %	0 %	0 %	339441126
33	NC_015737	AGCGC	2	10	65015	65024	20 %	0 %	40 %	40 %	339441135
34	NC_015737	CTGAC	2	10	65756	65765	20 %	20 %	20 %	40 %	339441136
35	NC_015737	TGTAT	2	10	68603	68612	20 %	60 %	20 %	0 %	339441139
36	NC_015737	AATTA	2	10	68774	68783	60 %	40 %	0 %	0 %	339441139
37	NC_015737	ACCGA	2	10	70888	70897	40 %	0 %	20 %	40 %	339441144
38	NC_015737	AAATC	2	10	72724	72733	60 %	20 %	0 %	20 %	339441147
39	NC_015737	TTTGC	2	10	74042	74051	0 %	60 %	20 %	20 %	339441148
40	NC_015737	CAATG	2	10	76951	76960	40 %	20 %	20 %	20 %	339441150
41	NC_015737	TCGGA	2	10	78030	78039	20 %	20 %	40 %	20 %	339441151
42	NC_015737	CCATG	2	10	78293	78302	20 %	20 %	20 %	40 %	339441151
43	NC_015737	GTTTT	2	10	78722	78731	0 %	80 %	20 %	0 %	339441152
44	NC_015737	CTCTG	2	10	81359	81368	0 %	40 %	20 %	40 %	339441155
45	NC_015737	GTCCA	2	10	83430	83439	20 %	20 %	20 %	40 %	339441156
46	NC_015737	CGGAT	2	10	89174	89183	20 %	20 %	40 %	20 %	339441161
47	NC_015737	GATCT	2	10	90967	90976	20 %	40 %	20 %	20 %	339441162
48	NC_015737	AAGAT	2	10	92023	92032	60 %	20 %	20 %	0 %	339441163
49	NC_015737	TTCTT	2	10	93838	93847	0 %	80 %	0 %	20 %	339441165
50	NC_015737	GCGCA	2	10	95237	95246	20 %	0 %	40 %	40 %	339441166
51	NC_015737	CGCAG	2	10	97784	97793	20 %	0 %	40 %	40 %	339441169
52	NC_015737	CGATC	2	10	99472	99481	20 %	20 %	20 %	40 %	339441170
53	NC_015737	GATGC	2	10	100179	100188	20 %	20 %	40 %	20 %	339441171
54	NC_015737	TCCGT	2	10	100966	100975	0 %	40 %	20 %	40 %	339441171
55	NC_015737	CCCTG	2	10	101174	101183	0 %	20 %	20 %	60 %	339441172
56	NC_015737	CATGA	2	10	101345	101354	40 %	20 %	20 %	20 %	339441172
57	NC_015737	CTGTG	2	10	109278	109287	0 %	40 %	40 %	20 %	339441179
58	NC_015737	CATGT	2	10	110258	110267	20 %	40 %	20 %	20 %	339441180
59	NC_015737	CTTTT	2	10	111014	111023	0 %	80 %	0 %	20 %	339441180
60	NC_015737	TCCGC	2	10	113868	113877	0 %	20 %	20 %	60 %	339441183
61	NC_015737	CAGAT	2	10	117828	117837	40 %	20 %	20 %	20 %	339441185
62	NC_015737	GAACC	2	10	120015	120024	40 %	0 %	20 %	40 %	339441186
63	NC_015737	TGTAA	2	10	124153	124162	40 %	40 %	20 %	0 %	339441190
64	NC_015737	GGGGC	2	10	124583	124592	0 %	0 %	80 %	20 %	339441190
65	NC_015737	TCACT	2	10	124881	124890	20 %	40 %	0 %	40 %	339441190
66	NC_015737	GTAAT	2	10	126278	126287	40 %	40 %	20 %	0 %	339441191
67	NC_015737	TGCAG	2	10	128270	128279	20 %	20 %	40 %	20 %	339441194
68	NC_015737	TTCCG	2	10	130068	130077	0 %	40 %	20 %	40 %	339441195
69	NC_015737	CTGGC	2	10	132111	132120	0 %	20 %	40 %	40 %	339441197
70	NC_015737	AGATG	2	10	134016	134025	40 %	20 %	40 %	0 %	339441198
71	NC_015737	CCGGA	2	10	134087	134096	20 %	0 %	40 %	40 %	339441198
72	NC_015737	GATAT	2	10	134313	134322	40 %	40 %	20 %	0 %	339441199
73	NC_015737	TCATC	2	10	140083	140092	20 %	40 %	0 %	40 %	339441205
74	NC_015737	CAGTA	2	10	140128	140137	40 %	20 %	20 %	20 %	339441205
75	NC_015737	GGACA	2	10	140211	140220	40 %	0 %	40 %	20 %	339441205
76	NC_015737	AATCA	2	10	143605	143614	60 %	20 %	0 %	20 %	339441209
77	NC_015737	TTAAT	2	10	144143	144152	40 %	60 %	0 %	0 %	339441210
78	NC_015737	CGGAA	2	10	144459	144468	40 %	0 %	40 %	20 %	339441210
79	NC_015737	CGAAA	2	10	145310	145319	60 %	0 %	20 %	20 %	339441211
80	NC_015737	GCCCA	2	10	146316	146325	20 %	0 %	20 %	60 %	339441213
81	NC_015737	TGATT	2	10	148004	148013	20 %	60 %	20 %	0 %	339441215
82	NC_015737	TTACT	2	10	149236	149245	20 %	60 %	0 %	20 %	339441218
83	NC_015737	TTAAC	2	10	150011	150020	40 %	40 %	0 %	20 %	339441220
84	NC_015737	CGGAC	2	10	154582	154591	20 %	0 %	40 %	40 %	339441229
85	NC_015737	ATTTC	2	10	158906	158915	20 %	60 %	0 %	20 %	339441233
86	NC_015737	TCATT	2	10	161125	161134	20 %	60 %	0 %	20 %	339441234
87	NC_015737	CTACC	2	10	163856	163865	20 %	20 %	0 %	60 %	339441239
88	NC_015737	GTACG	2	10	164124	164133	20 %	20 %	40 %	20 %	339441240
89	NC_015737	GCCGC	2	10	164797	164806	0 %	0 %	40 %	60 %	339441241
90	NC_015737	TCCCA	2	10	165656	165665	20 %	20 %	0 %	60 %	339441243
91	NC_015737	TGCAT	2	10	168190	168199	20 %	40 %	20 %	20 %	339441247
92	NC_015737	TTTCC	2	10	168850	168859	0 %	60 %	0 %	40 %	339441248
93	NC_015737	CCTTC	2	10	169459	169468	0 %	40 %	0 %	60 %	339441248
94	NC_015737	TTTTC	2	10	171417	171426	0 %	80 %	0 %	20 %	339441249
95	NC_015737	TGATT	2	10	172464	172473	20 %	60 %	20 %	0 %	339441250
96	NC_015737	TGTTC	2	10	173238	173247	0 %	60 %	20 %	20 %	339441251
97	NC_015737	TTTTC	2	10	173400	173409	0 %	80 %	0 %	20 %	339441251
98	NC_015737	CGACC	2	10	174030	174039	20 %	0 %	20 %	60 %	339441252
99	NC_015737	ATTAT	2	10	175786	175795	40 %	60 %	0 %	0 %	339441257
100	NC_015737	CTGCC	2	10	183207	183216	0 %	20 %	20 %	60 %	339441260
101	NC_015737	GATCT	2	10	184517	184526	20 %	40 %	20 %	20 %	339441260
102	NC_015737	TTGTT	2	10	185098	185107	0 %	80 %	20 %	0 %	339441260
103	NC_015737	CGTCC	2	10	186817	186826	0 %	20 %	20 %	60 %	339441262
104	NC_015737	GATCC	2	10	188830	188839	20 %	20 %	20 %	40 %	339441265
105	NC_015737	AAATC	2	10	189138	189147	60 %	20 %	0 %	20 %	339441266
106	NC_015737	GCGCT	2	10	190421	190430	0 %	20 %	40 %	40 %	339441267
107	NC_015737	CCCAG	2	10	190755	190764	20 %	0 %	20 %	60 %	339441267
108	NC_015737	CTTTT	2	10	191026	191035	0 %	80 %	0 %	20 %	339441267
109	NC_015737	TTTTC	2	10	191451	191460	0 %	80 %	0 %	20 %	339441267
110	NC_015737	CAGAA	2	10	192024	192033	60 %	0 %	20 %	20 %	339441268
111	NC_015737	CTGTT	2	10	192196	192205	0 %	60 %	20 %	20 %	339441268
112	NC_015737	TCTTT	2	10	192995	193004	0 %	80 %	0 %	20 %	339441269
113	NC_015737	ATGTA	2	10	195568	195577	40 %	40 %	20 %	0 %	339441271
114	NC_015737	TGCCT	2	10	196250	196259	0 %	40 %	20 %	40 %	339441272
115	NC_015737	TCATA	2	10	196668	196677	40 %	40 %	0 %	20 %	339441272
116	NC_015737	CGGCG	2	10	196692	196701	0 %	0 %	60 %	40 %	339441272
117	NC_015737	GATCC	2	10	197179	197188	20 %	20 %	20 %	40 %	339441272
118	NC_015737	CACCT	2	10	197782	197791	20 %	20 %	0 %	60 %	339441272
119	NC_015737	GATCC	2	10	197798	197807	20 %	20 %	20 %	40 %	339441272
120	NC_015737	CGGTT	2	10	199354	199363	0 %	40 %	40 %	20 %	339441274
121	NC_015737	TCGCC	2	10	200583	200592	0 %	20 %	20 %	60 %	339441274
122	NC_015737	TCCGC	2	10	202132	202141	0 %	20 %	20 %	60 %	339441276
123	NC_015737	CATCA	2	10	202910	202919	40 %	20 %	0 %	40 %	339441277
124	NC_015737	GAGAA	2	10	208332	208341	60 %	0 %	40 %	0 %	339441283
125	NC_015737	CCGCA	2	10	210937	210946	20 %	0 %	20 %	60 %	339441286
126	NC_015737	CCGTA	2	10	212042	212051	20 %	20 %	20 %	40 %	339441287
127	NC_015737	GTCAT	2	10	212904	212913	20 %	40 %	20 %	20 %	339441287
128	NC_015737	ATCAT	2	10	212940	212949	40 %	40 %	0 %	20 %	339441287
129	NC_015737	GAAGG	2	10	213342	213351	40 %	0 %	60 %	0 %	339441287
130	NC_015737	ATATG	2	10	213424	213433	40 %	40 %	20 %	0 %	339441287
131	NC_015737	CGCGC	2	10	215669	215678	0 %	0 %	40 %	60 %	339441289
132	NC_015737	ATGCT	2	10	216921	216930	20 %	40 %	20 %	20 %	339441289
133	NC_015737	CCCGG	2	10	217172	217181	0 %	0 %	40 %	60 %	339441289
134	NC_015737	TTTCT	2	10	217514	217523	0 %	80 %	0 %	20 %	339441289
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253	NC_015737	ATACG	2	10	428226	428235	40 %	20 %	20 %	20 %	339441466
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259	NC_015737	GATTC	2	10	435925	435934	20 %	40 %	20 %	20 %	339441472
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