MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015736	GCCCA	2	10	11820	11829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015736	CGCAC	2	10	17692	17701	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015736	AGGGA	2	10	20817	20826	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015736	TCACG	2	10	21438	21447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015736	GGACG	2	10	21971	21980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015736	GCCTG	2	10	24651	24660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015736	GCTGG	2	10	25175	25184	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015736	GCACA	2	10	25512	25521	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015736	CTGTG	2	10	26508	26517	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015736	GCGCC	2	10	32417	32426	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_015736	AATGC	2	10	35971	35980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015736	CCCTG	2	10	36110	36119	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015736	GCGTA	2	10	36135	36144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015736	GCAGT	2	10	36264	36273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015736	TCGTG	2	10	48331	48340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015736	TGCTG	2	10	50328	50337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015736	CTCAT	2	10	51353	51362	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015736	CAAGA	2	10	51650	51659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015736	AGCGC	2	10	52181	52190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015736	CAGTT	2	10	55760	55769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015736	GGTGG	2	10	56214	56223	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015736	GCGCA	2	10	57679	57688	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015736	ATGGC	2	10	58954	58963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015736	GCTGC	2	10	64598	64607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015736	CATGG	2	10	65769	65778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015736	GCGCC	2	10	66146	66155	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015736	ACTGG	2	10	68487	68496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015736	GCTTA	2	10	68879	68888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015736	GAAAG	2	10	69048	69057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015736	GCCAT	2	10	76926	76935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015736	AGCGA	2	10	78223	78232	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015736	ATGTA	2	10	80624	80633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015736	ACCAT	2	10	84443	84452	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015736	CACTG	2	10	86158	86167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015736	CAGCT	2	10	86214	86223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015736	CCAGC	2	10	86418	86427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015736	TGCAT	2	10	86673	86682	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015736	GCAGA	2	10	86693	86702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015736	GCAAC	2	10	87419	87428	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015736	CGGCG	2	10	87550	87559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015736	TGCAT	2	10	92029	92038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015736	TACTG	2	10	107894	107903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015736	TCTTG	2	10	124496	124505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015736	GATGA	2	10	124792	124801	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015736	CACAG	2	10	125816	125825	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015736	CACGA	2	10	127815	127824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015736	CGGCG	2	10	131756	131765	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015736	TACCA	2	10	132127	132136	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015736	CGGCG	2	10	132319	132328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015736	CGCAC	2	10	133944	133953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_015736	TATGC	2	10	134587	134596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015736	GACGC	2	10	135186	135195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015736	GCGCC	2	10	135409	135418	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_015736	CGTGC	2	10	137592	137601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.